[发明专利]一种乙型肝炎病毒基因组DNA的5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷的标记和检测方法有效
申请号: | 201710153469.2 | 申请日: | 2017-03-15 |
公开(公告)号: | CN106929484B | 公开(公告)日: | 2019-07-02 |
发明(设计)人: | 马春红;武专昌;梁晓红;高立芬;王泽华;宋晓佳;徐蕾琪;王体潇;宋洋;杜宪红;谭思雨 | 申请(专利权)人: | 山东大学 |
主分类号: | C12N7/01 | 分类号: | C12N7/01;C12Q1/70;G01N33/569;C12R1/93 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 王志坤 |
地址: | 250101 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 乙型肝炎 病毒 基因组 dna 乙炔 脱氧 尿嘧啶核苷 标记 检测 方法 | ||
1.一种用于非疾病诊断目的的HBV基因组DNA的5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷的标记和检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)扩增NTCP基因,构建NTCP真核表达质粒pcDNA-NTCP,将pcDNA-NTCP转入Huh7肝癌细胞中构建NTCP稳定表达的Huh7-NTCP细胞系;
(2)使用EdU处理HepG2.2.15细胞,获取含EdU-HBV的细胞上清,使用PEG8000处理,离心,弃上清,对沉淀中进行HBV基因组拷贝数定量;
(3)将HBV细胞传代培养至细胞汇合度为50-80%时,使用EdU-HBV感染Huh7-NTCP细胞,然后进行EdU-HBV荧光检测。
2.如权利要求1所述的一种用于非疾病诊断目的的HBV基因组DNA的5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷的标记和检测方法,其特征在于,所述步骤(1)包括:
1)扩增NTCP基因,插入载体pcDNA3.0中,构建了NTCP真核表达质粒pcDNA-NTCP;
2)将pcDNA-NTCP转染Huh7细胞,使用遗传霉素G418进行筛选;
3)挑取遗传霉素G418抗性阳性克隆,使用间接免疫荧光试验和qRT-PCR检测NTCP表达;
4)选择NTCP高表达克隆,扩大培养;
5)感染HBV,用ELISA检测HBsAg,确定Huh7-NTCP细胞系支持HBV感染性。
3.如权利要求2所述的一种用于非疾病诊断目的的HBV基因组DNA的5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷的标记和检测方法,其特征在于,对构建的pcDNA-NTCP质粒进行线性化。
4.如权利要求3所述的一种用于非疾病诊断目的的HBV基因组DNA的5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷的标记和检测方法,其特征在于,对pcDNA-NTCP质粒进行线性化的所用的线性化酶为PvuI内切酶。
5.如权利要求2所述的一种用于非疾病诊断目的的HBV基因组DNA的5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷的标记和检测方法,其特征在于,对NTCP基因进行扩增时的选用的扩增引物为:
pC3NTCP-F:CCCAAGCTTGCCACCATGGAGGCCCACAACGCGTCTG;
pC3NTCP-R:CCGCTCGAGCTAGGCTGTGCAAGGGGAGCAG。
6.如权利要求2所述的一种用于非疾病诊断目的的HBV基因组DNA的5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷的标记和检测方法,其特征在于,对NTCP扩增基因和pcDNA3.0进行酶切选用的限制性内切酶为HindIII和XhoI;
遗传霉素G418的使用浓度为700ug/ml,使用遗传霉素G418进行筛选的时间为4-6周;
进行qRT-PCR时,选用GAPDH为内参,各引物序列分别为:
hNTCP-qF:GGGACATGAACCTCAGCATT;
hNTCP-qR:CGTTTGGATTTGAGGACGAT;
hGAPDH-qF:GGAGTCCACTGGCGTCTTCAC;
hGAPDH-qR:GAGGCATTGCTGATGATCTTGAGG。
7.如权利要求1所述的一种用于非疾病诊断目的的HBV基因组DNA的5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷的标记和检测方法,其特征在于,所述步骤(2)包括:
1)将HepG2.2.15肝癌细胞使用MEM培养基进行传代培养,更换含10μM EdU和2%胎牛血清FBS的MEM培养基再进行传代培养,收集细胞上清;然后再补加含10μM EdU和2%FBS的MEM培养基进行传代培养并收集细胞上清一次;
2)对收集的细胞上清进行病毒纯化,去除细胞碎片及杂质,然后向细胞上清中加入PEG8000,冰上缓慢混匀4-6h;离心,弃上清,对沉淀中进行HBV基因组拷贝数定量。
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