[发明专利]一种乙型肝炎病毒基因组DNA的5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷的标记和检测方法有效

专利信息
申请号: 201710153469.2 申请日: 2017-03-15
公开(公告)号: CN106929484B 公开(公告)日: 2019-07-02
发明(设计)人: 马春红;武专昌;梁晓红;高立芬;王泽华;宋晓佳;徐蕾琪;王体潇;宋洋;杜宪红;谭思雨 申请(专利权)人: 山东大学
主分类号: C12N7/01 分类号: C12N7/01;C12Q1/70;G01N33/569;C12R1/93
代理公司: 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 代理人: 王志坤
地址: 250101 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 一种 乙型肝炎 病毒 基因组 dna 乙炔 脱氧 尿嘧啶核苷 标记 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种用于非疾病诊断目的的HBV基因组DNA的5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷的标记和检测方法,其特征在于,包括如下步骤:

(1)扩增NTCP基因,构建NTCP真核表达质粒pcDNA-NTCP,将pcDNA-NTCP转入Huh7肝癌细胞中构建NTCP稳定表达的Huh7-NTCP细胞系;

(2)使用EdU处理HepG2.2.15细胞,获取含EdU-HBV的细胞上清,使用PEG8000处理,离心,弃上清,对沉淀中进行HBV基因组拷贝数定量;

(3)将HBV细胞传代培养至细胞汇合度为50-80%时,使用EdU-HBV感染Huh7-NTCP细胞,然后进行EdU-HBV荧光检测。

2.如权利要求1所述的一种用于非疾病诊断目的的HBV基因组DNA的5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷的标记和检测方法,其特征在于,所述步骤(1)包括:

1)扩增NTCP基因,插入载体pcDNA3.0中,构建了NTCP真核表达质粒pcDNA-NTCP;

2)将pcDNA-NTCP转染Huh7细胞,使用遗传霉素G418进行筛选;

3)挑取遗传霉素G418抗性阳性克隆,使用间接免疫荧光试验和qRT-PCR检测NTCP表达;

4)选择NTCP高表达克隆,扩大培养;

5)感染HBV,用ELISA检测HBsAg,确定Huh7-NTCP细胞系支持HBV感染性。

3.如权利要求2所述的一种用于非疾病诊断目的的HBV基因组DNA的5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷的标记和检测方法,其特征在于,对构建的pcDNA-NTCP质粒进行线性化。

4.如权利要求3所述的一种用于非疾病诊断目的的HBV基因组DNA的5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷的标记和检测方法,其特征在于,对pcDNA-NTCP质粒进行线性化的所用的线性化酶为PvuI内切酶。

5.如权利要求2所述的一种用于非疾病诊断目的的HBV基因组DNA的5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷的标记和检测方法,其特征在于,对NTCP基因进行扩增时的选用的扩增引物为:

pC3NTCP-F:CCCAAGCTTGCCACCATGGAGGCCCACAACGCGTCTG;

pC3NTCP-R:CCGCTCGAGCTAGGCTGTGCAAGGGGAGCAG。

6.如权利要求2所述的一种用于非疾病诊断目的的HBV基因组DNA的5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷的标记和检测方法,其特征在于,对NTCP扩增基因和pcDNA3.0进行酶切选用的限制性内切酶为HindIII和XhoI;

遗传霉素G418的使用浓度为700ug/ml,使用遗传霉素G418进行筛选的时间为4-6周;

进行qRT-PCR时,选用GAPDH为内参,各引物序列分别为:

hNTCP-qF:GGGACATGAACCTCAGCATT;

hNTCP-qR:CGTTTGGATTTGAGGACGAT;

hGAPDH-qF:GGAGTCCACTGGCGTCTTCAC;

hGAPDH-qR:GAGGCATTGCTGATGATCTTGAGG。

7.如权利要求1所述的一种用于非疾病诊断目的的HBV基因组DNA的5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷的标记和检测方法,其特征在于,所述步骤(2)包括:

1)将HepG2.2.15肝癌细胞使用MEM培养基进行传代培养,更换含10μM EdU和2%胎牛血清FBS的MEM培养基再进行传代培养,收集细胞上清;然后再补加含10μM EdU和2%FBS的MEM培养基进行传代培养并收集细胞上清一次;

2)对收集的细胞上清进行病毒纯化,去除细胞碎片及杂质,然后向细胞上清中加入PEG8000,冰上缓慢混匀4-6h;离心,弃上清,对沉淀中进行HBV基因组拷贝数定量。

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