[发明专利]一种微囊藻毒素降解菌的快速高效筛选方法在审
申请号: | 201710132591.1 | 申请日: | 2017-03-07 |
公开(公告)号: | CN107058515A | 公开(公告)日: | 2017-08-18 |
发明(设计)人: | 史全良;谷青 | 申请(专利权)人: | 苏州大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 苏州创元专利商标事务所有限公司32103 | 代理人: | 陶海锋,孙周强 |
地址: | 215123 江苏省*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 微囊藻 毒素 降解 快速 高效 筛选 方法 | ||
技术领域
本发明属于微囊藻毒素微生物处理技术领域,具体涉及一种微囊藻毒素降解菌的快速高效筛选方法。
背景技术
随着现代社会的飞速发展,大量含氮磷的有机物以及工农业废水排入自然水体中,使得水体发生富营养化,导致藻类快速繁殖形成“水华”,蓝藻细胞破裂后向水体中释放出多种毒素。其中微囊藻毒素 (Microcystin, MC) 是一类出现频率最高、造成危害最严重的藻毒素,它不仅会对动植物造成损伤,甚至引发人类肝损伤和肝癌,严重威胁人类的健康。微囊藻毒素的化学性质因其独特的环状结构显得非常稳定,一般的水处理工艺达不到较好的去除效果,一般的多肽酶也不能将其分解。目前,利用微生物降解来去除MCs是相对最有效、安全的方法,微生物降解已成为环境中MCs自然归趋的主要途径之一。
目前已经被证明有降解MCs作用的菌株大部分集中在α-变形菌纲中的Sphingomonas和Sphingopyxiz这两个属,此外如青枯菌(Ralstonia solanacearum)、食酸戴尔福特菌、伯克霍尔德氏菌,吉氏库特菌,荧光假单胞菌等也被证明有降解作用。目前,MCs降解菌的筛选鉴定方法比较复杂,检测分离纯化的菌株能否降解MCs时需要用到大量的MCs作为材料,实验室自行纯化MCs工作量大、产量低,而MCs纯品价格昂贵。后期对MCs的浓度测定时无论是用HPLC还是ELISA,成本均较大。一般从腐烂藻体水中分离出的细菌数量较多,对其一一进行MCs降解实验不仅工作量大而且会消耗大量的实验资金。
发明内容
本发明公开了一种微囊藻毒素降解菌的快速高效筛选方法,通过设计引物对,根据检测结果来确定其能否降解MCs,从而公开了一种新型的、快速筛选MCs降解菌的方法,进而得到可有效降解微囊藻毒素的降解菌。
本发明采用如下技术方案,一种微囊藻毒素降解菌的快速高效筛选方法,包括以下步骤,
(1)设计如SEQ ID NO:1以及SEQ ID NO:2所述的引物对;
SEQ ID NO:1 : 5'-TGCGCTATGGGKCAGATCC-3'
SEQ ID NO:2:5'-GGTCAAACTTCTTGAGSAGCTG-3'
(2)以待筛选微囊藻毒素降解菌的DNA为模板,利用步骤(1)的引物对进行PCR扩增,得到扩增产物;
(3)检测步骤(2)的扩增产物,根据检测结果完成微囊藻毒素降解菌的筛选。
上述技术方案中,所述PCR扩增采用25µL反应体系,其中ddH2O 17.2 µL,10×PCR缓冲液(Mg2+ plus) 2.5 µL,dNTPs(2.5 mM)2 µL,引物(10 µM) 各1 µL,rTaq DNA聚合酶(5 U/µL)0.3 µL,模板1 µL。
上述技术方案中,所述PCR扩增反应条件为:94℃预变性10 min,94℃ 变性30 s,55℃ 退火30 s,72℃ 延伸30 s,共40个循环,最后72℃ 延伸5 min后,4℃ 保存。
上述技术方案中,检测步骤(2)的扩增产物具体为步骤(2)的扩增产物经1%的琼脂糖凝胶电泳分离、EB 染色、紫外检测。
本发明还公开了一对特异性的引物:
SEQ ID NO:1 : 5'-TGCGCTATGGGKCAGATCC-3'
SEQ ID NO:2:5'-GGTCAAACTTCTTGAGSAGCTG-3'
使用该对引物扩增可以快速筛选出能够降解MCs的菌株中mlrA基因的保守区,长132bp,具STS序列特点。本发明对菌株进行PCR扩增,检测获得阳性结果的可认为是藻毒素降解菌;因此本发明还公开了上述引物对在微囊藻毒素降解菌筛选中的应用。
本发明还公开了一种微囊藻毒素降解的方法,包括以下步骤,
(1)设计如SEQ ID NO:1以及SEQ ID NO:2所述的引物对;
SEQ ID NO:1 : 5'-TGCGCTATGGGKCAGATCC-3'
SEQ ID NO:2:5'-GGTCAAACTTCTTGAGSAGCTG-3'
(2)以待筛选微囊藻毒素降解菌的DNA为模板,利用步骤(1)的引物对进行PCR扩增,得到扩增产物;
(3)检测步骤(2)的扩增产物,根据检测结果选择微囊藻毒素降解菌;
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