[发明专利]一种同时检测三种引起马铃薯块茎坏死的病毒的三重RT-PCR方法及其引物组合在审

专利信息
申请号: 201510439761.1 申请日: 2015-07-24
公开(公告)号: CN105039594A 公开(公告)日: 2015-11-11
发明(设计)人: 胡新喜;雷艳;熊兴耀;周华兰 申请(专利权)人: 湖南农业大学
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 北京知本村知识产权代理事务所 11039 代理人: 刘江良
地址: 410128 *** 国省代码: 湖南;43
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摘要:
搜索关键词: 一种 同时 检测 引起 马铃薯 块茎 坏死 病毒 三重 rt pcr 方法 及其 引物 组合
【权利要求书】:

1.一种同时检测三种引起马铃薯块茎坏死的病毒的三重RT-PCR方法,其特征在于,其步骤包括:

1)取马铃薯植株叶片或块茎,提取其RNA;

2)以步骤1)得到的RNA为模板,通过反转录,得到cDNA;

3)以步骤2)得到的cDNA为模板,用3对引物对其进行PCR扩增;

4)PCR产物凝胶电泳,根据目的片段大小及阳性对照,判断病毒感染情况;

其中,所述引物如下:

检测番茄斑萎病毒(TSWV)的引物为:正向引物如SEQIDNO.1所示;反向引物如SEQIDNO.2所示;

检测马铃薯Y病毒块茎坏死株系(PVYNTN)的引物为:正向引物如SEQIDNO.3所示;反向引物如SEQIDNO.4所示;

检测马铃薯帚顶病毒(PMTV)的引物为:正向引物如SEQIDNO.5所示;反向引物如SEQIDNO.6所示。

2.按照权利要求1所述的方法,其特征在于:三重PCR检测的反应体系,按50μl计:10×PCRBuffer5uL、dNTPMixture4uL、模板4uL、3对引物的正向引物和反向引物各1uL、Taq酶1uL、补足ddH2O至50uL。

3.按照权利要求1所述的方法,其特征在于三重PCR检测的PCR程序:92℃预变性2min;92℃变性30s;60℃退火30s;72℃延伸1min;共40个循环;最后72℃延伸10min。

4.一种用于三重RT-PCR同时检测PVYNTN、TSWV、PMTV三种病毒的引物对组合,其特征在于:其由三对引物组合而成,引物之间没有干扰,无非特异条带产生,所述引物分别如下:

检测番茄斑萎病毒的引物为:

正向引物如SEQIDNO.1所示;反向引物如SEQIDNO.2所示;

检测检测马铃薯Y病毒块茎坏死株系的引物为:

正向引物如SEQIDNO.3所示;反向引物如SEQIDNO.4所示;检测马铃薯帚顶病毒的引物为:

正向引物如SEQIDNO.5所示;反向引物如SEQIDNO.6所示。

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