[发明专利]一种同时检测三种引起马铃薯块茎坏死的病毒的三重RT-PCR方法及其引物组合在审
申请号: | 201510439761.1 | 申请日: | 2015-07-24 |
公开(公告)号: | CN105039594A | 公开(公告)日: | 2015-11-11 |
发明(设计)人: | 胡新喜;雷艳;熊兴耀;周华兰 | 申请(专利权)人: | 湖南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京知本村知识产权代理事务所 11039 | 代理人: | 刘江良 |
地址: | 410128 *** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 同时 检测 引起 马铃薯 块茎 坏死 病毒 三重 rt pcr 方法 及其 引物 组合 | ||
1.一种同时检测三种引起马铃薯块茎坏死的病毒的三重RT-PCR方法,其特征在于,其步骤包括:
1)取马铃薯植株叶片或块茎,提取其RNA;
2)以步骤1)得到的RNA为模板,通过反转录,得到cDNA;
3)以步骤2)得到的cDNA为模板,用3对引物对其进行PCR扩增;
4)PCR产物凝胶电泳,根据目的片段大小及阳性对照,判断病毒感染情况;
其中,所述引物如下:
检测番茄斑萎病毒(TSWV)的引物为:正向引物如SEQIDNO.1所示;反向引物如SEQIDNO.2所示;
检测马铃薯Y病毒块茎坏死株系(PVYNTN)的引物为:正向引物如SEQIDNO.3所示;反向引物如SEQIDNO.4所示;
检测马铃薯帚顶病毒(PMTV)的引物为:正向引物如SEQIDNO.5所示;反向引物如SEQIDNO.6所示。
2.按照权利要求1所述的方法,其特征在于:三重PCR检测的反应体系,按50μl计:10×PCRBuffer5uL、dNTPMixture4uL、模板4uL、3对引物的正向引物和反向引物各1uL、Taq酶1uL、补足ddH2O至50uL。
3.按照权利要求1所述的方法,其特征在于三重PCR检测的PCR程序:92℃预变性2min;92℃变性30s;60℃退火30s;72℃延伸1min;共40个循环;最后72℃延伸10min。
4.一种用于三重RT-PCR同时检测PVYNTN、TSWV、PMTV三种病毒的引物对组合,其特征在于:其由三对引物组合而成,引物之间没有干扰,无非特异条带产生,所述引物分别如下:
检测番茄斑萎病毒的引物为:
正向引物如SEQIDNO.1所示;反向引物如SEQIDNO.2所示;
检测检测马铃薯Y病毒块茎坏死株系的引物为:
正向引物如SEQIDNO.3所示;反向引物如SEQIDNO.4所示;检测马铃薯帚顶病毒的引物为:
正向引物如SEQIDNO.5所示;反向引物如SEQIDNO.6所示。
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