[发明专利]试剂盒及其在病原体检测中的用途

说明书

技术领域

本发明涉及微生物检测，具体地，本发明涉及包含序列的试剂盒、病原体检测方法及装置。

背景技术

孕前筛查是主要针对生殖系统和遗传因素所做的检查，传统的孕前感染筛查主要包括两部分：1)生殖系统：通过白带常规筛查滴虫、霉菌、支原体衣原体感染、阴道炎症，以及淋病、梅毒等性传播性疾病；2)TORCH检测：TO指弓形体(Toxoplasmagondii)，R指风疹病毒(RubellaVirus)，C是指巨细胞病毒(Cytomegalovirus)，H指单纯疱疹病毒(HerpesSimplexVirus)，分I型和II型)，O指其它。

目前，在我国最方便、最常用的TORCH筛查方法是采用ELISA酶免诊断技术检测人体血清中的特异性IgM、IgG抗体。ELISA试剂因其稳定、灵敏度高、特异性强、成本低等优点而在普通实验室中广泛采用，但一般用来做定性，不能定量。TORCH定量检测则采用化学发光法，通过方法学评价，表明化学发光法CLIA测定的灵敏度高，批内和批间变异小，且具有良好的抗干扰能力，可去除标本中可能存在的病毒IgG抗体以及类风湿因子等的干扰，适用于常规临床工作。传统的检测手段在临床诊断中已发挥了巨大的作用，但仍存在一些不足之处，例如耗时、不能一次性同时检出等等。

发明内容

依据本发明一方面提供一种试剂盒，其包括如SEQIDNO：1和SEQIDNO：2，SEQIDNO：3和SEQIDNO：4，SEQIDNO：5和SEQIDNO：6，SEQIDNO：7和SEQIDNO：8，SEQIDNO：9和SEQIDNO：10，SEQIDNO：11和SEQIDNO：12，SEQIDNO：13和SEQIDNO：14以及SEQIDNO：15和SEQIDNO：16所示的8对引物序列中的至少2对。

依据本发明的另一方面提供一种上述试剂盒在病原体扩增和/或检测中的用途，病原体包括弓形虫、巨细胞病毒、乙型肝炎病毒、单纯疱疹病毒、梅毒螺旋体、丙肝病毒、人类免疫缺陷病毒和风疹病毒。

依据本发明的再一方面提供一种病原体检测方法，病原体包括弓形虫、巨细胞病毒、乙型肝炎病毒、单纯疱疹病毒、梅毒螺旋体、丙肝病毒、人类免疫缺陷病毒和风疹病毒中的至少一种，该方法包括：(1)提取待测样本核酸；(2)对(1)中的核酸中的至少一部分进行扩增，获得扩增产物，扩增利用本发明一方面提供的试剂盒进行；(3)对(2)中的扩增产物进行序列测定，获得测定序列；(4)利用(3)中的测定序列，确定待测样本中包含的病原体种类。该方法还包括：(5)利用(4)的确定结果，计算所述确定的各种病原体的丰度，将每种病原体的丰度与该种病原体的不致病丰度进行比较，两者有显著性差异则确定宿主感染该种病原体。

依据本发明的又一方面还提供一种病原体检测装置，所述病原体包括弓形虫、巨细胞病毒、乙型肝炎病毒、单纯疱疹病毒、梅毒螺旋体、丙肝病毒、人类免疫缺陷病毒和风疹病毒中的至少一种，该装置包括：A.核酸提取单元，用于提取获得待测样本核酸；B.扩增单元，与A单元相连，用于对来自A的核酸的至少一部分进行扩增，获得扩增产物，所述核酸中的至少一部分包括能够与本发明一方面提供的试剂盒中的至少1对引物序列结合上的核酸序列，扩增利用本发明一方面的试剂盒进行；C.序列测定单元，与B单元相连，用于对接收自B单元的扩增产物进行序列测定，获得测定序列；D.病原体种类确定单元，与C单元相连，用于利用接收自C单元的测定序列，确定待测样本包含的病原体种类。该装置还包括：E.病原体感染判定单元，与D单元相连，用于利用接收自D单元的结果，计算所述确定的各种病原体的丰度，将每种病原体的丰度与该种病原体的不致病丰度进行比较，两者有显著性差异则判定宿主感染该种病原体。该装置能够用以执行完成本发明一方面的病原体检测方法。

本发明的试剂盒、方法和/装置旨在开发一种基于新一代测序技术的用于辅助临床诊断的孕前感染筛查技术，可一次性地将弓形虫(TOX)、巨细胞病毒(CMV)、乙型肝炎病毒(HBV)、单纯疱疹病毒(HSV)、梅毒螺旋体(TP)、丙肝病毒(HCV)、人类免疫缺陷病毒(HIV)、风疹病毒(RV)八种可造成生殖系统等感染的病原体同时检出。

附图说明

本发明的上述和/或附加的方面和优点从结合下面附图对实施方式的描述中将变得明显和容易理解，其中：

图1是本发明的一个具体实施方式中的病原体检测流程；

图2是本发明的一个具体实施方式中的样本CMV检测结果示意图。