[发明专利]试剂盒及其在病原体检测中的用途在审
申请号: | 201410515880.6 | 申请日: | 2014-09-29 |
公开(公告)号: | CN105525034A | 公开(公告)日: | 2016-04-27 |
发明(设计)人: | 倪培相;张印新;姚雪;周加利 | 申请(专利权)人: | 天津华大基因科技有限公司;深圳华大基因医学有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12Q1/04;C12M1/34;C12R1/93 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 李志东 |
地址: | 300308 天津市滨海新区空港经济区*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 试剂盒 及其 病原体 检测 中的 用途 | ||
1.试剂盒,其包括如SEQIDNO:1和SEQIDNO:2,SEQIDNO:3和SEQIDNO:4,SEQIDNO:5和SEQIDNO:6,SEQIDNO:7和SEQIDNO:8,SEQIDNO:9和SEQIDNO:10,SEQIDNO:11和SEQIDNO:12,SEQIDNO:13和SEQIDNO:14以及SEQIDNO:15和SEQIDNO:16所示的8对引物序列中的至少2对;
任选地,所述试剂盒包括所述8对引物序列中的至少3对;
任选地,所述试剂盒包括所述8对引物序列中的至少4对;
任选地,所述试剂盒包括所述8对引物序列中的至少5对;
任选地,所述试剂盒包括所述8对引物序列中的至少6对;
任选地,所述试剂盒包括所述8对引物序列中的至少7对;
任选地,所述试剂盒包括所述8对引物序列。
2.权利要求1的试剂盒在病原体扩增和/或检测中的用途,所述病原体包括弓形虫、巨细胞病毒、乙型肝炎病毒、单纯疱疹病毒、梅毒螺旋体、丙肝病毒、人类免疫缺陷病毒和风疹病毒。
3.病原体检测方法,所述病原体包括弓形虫、巨细胞病毒、乙型肝炎病毒、单纯疱疹病毒、梅毒螺旋体、丙肝病毒、人类免疫缺陷病毒和风疹病毒中的至少一种,所述方法包括:
(1)提取待测样本核酸;
(2)对(1)中的核酸中的至少一部分进行扩增,获得扩增产物,所述扩增利用权利要求1的试剂盒进行;
(3)对(2)中的扩增产物进行序列测定,获得测定序列;
(4)利用(3)中的测定序列,确定待测样本中包含的病原体种类。
4.权利要求3的方法,其特征在于,所述样本为血液、血清或血浆样本。
5.权利要求3的方法,其特征在于,所述扩增为多重PCR。
6.权利要求3的方法,其特征在于,(4)包括:
将(3)中的测定序列与病原体参考序列比对,利用获得的比对结果,确定待测样本中包含的病原体种类,所述病原体参考序列包括弓形虫、巨细胞病毒、乙型肝炎病毒、单纯疱疹病毒、梅毒螺旋体、丙肝病毒、人类免疫缺陷病毒和风疹病毒的参考基因组。
7.权利要求6的方法,其特征在于,所述方法还包括:
(5)利用(4)中的比对结果,计算所述确定的各种病原体的丰度,将每种病原体的丰度与该种病原体的不致病丰度进行比较,两者有显著性差异则确定宿主感染该种病原体。
8.病原体检测装置,所述病原体包括弓形虫、巨细胞病毒、乙型肝炎病毒、单纯疱疹病毒、梅毒螺旋体、丙肝病毒、人类免疫缺陷病毒和风疹病毒中的至少一种,所述装置包括:
A.核酸提取单元,用于提取获得待测样本核酸;
B.扩增单元,与A单元相连,用于对来自A的核酸的至少一部分进行扩增,获得扩增产物,所述扩增利用权利要求1的试剂盒中进行;
C.序列测定单元,与B单元相连,用于对接收自B单元的扩增产物进行序列测定,获得测定序列;
D.病原体种类确定单元,与C单元相连,用于利用接收自C单元的测定序列,确定待测样本包含的病原体种类;
任选地,D单元包括:
将接收自C单元的测定序列与病原体参考序列比对,利用获得的比对结果,确定待测样本中包含的病原体种类,所述病原体参考序列包括弓形虫、巨细胞病毒、乙型肝炎病毒、单纯疱疹病毒、梅毒螺旋体、丙肝病毒、人类免疫缺陷病毒和风疹病毒的参考基因组。
9.权利要求8的装置,其特征在于,所述装置还包括:
E.病原体感染判定单元,与D单元相连,用于利用接收自D单元的比对结果,计算所述确定的各种病原体的丰度,将每种病原体的丰度与该种病原体的不致病丰度进行比较,两者有显著性差异则判定宿主感染该种病原体。
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