[发明专利]一种利用扩增DNA片段长度多态性测定短链RNA的方法有效
申请号: | 201410362696.2 | 申请日: | 2014-07-28 |
公开(公告)号: | CN104120184A | 公开(公告)日: | 2014-10-29 |
发明(设计)人: | 徐凯;唐放;张耀艺;冯梓浩;杨宇;吴秀锦;张菲菲 | 申请(专利权)人: | 成都诺恩生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 | 代理人: | 杨兵 |
地址: | 610041 四川省成*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 扩增 dna 片段 长度 多态性 测定 rna 方法 | ||
1.一种利用扩增DNA片段长度多态性定量测定短链RNA的方法,其特征在于,包括以下步骤:
首先利用至少两种与待测短链RNA相比无天然同源序列的合成小RNA作为测定的内标,将这些作为内标的所述合成小RNA以不同分子数混合,形成动态小RNA标准分子梯度;
再以等量的所述动态小RNA标准与所述待测短链RNA混合,经由RNA反转录、cDNA加尾、PCR同步扩增及PCR产物DNA长度多态性片段的荧光定量分析,测得所述待测短链RNA扩增产生的DNA片段荧光强度在所述动态小RNA标准荧光强度梯度上的相对比例,从而实现所述待测短链RNA的相对定量。
2.如权利要求1所述的一种利用扩增DNA片段长度多态性定量测定miRNA的方法,其特征在于,测得所述待测短链RNA在所述动态小RNA标准梯度上的相对强度比例后,以待测短链RNA序列为模板合成短链RNA参照物,测定不同分子数量的待测RNA参照物在上述动态小RNA标准梯度上的相对比例,由此获得待测短链RNA参照物的分子数目-相对强度的校正曲线,再利用所述待测短链RNA相对强度比例通过所述校正曲线,计算出样品中待测短链RNA的绝对分子数量。
3.如权利要求1或2所述的一种利用扩增DNA片段长度多态性定量测定短链RNA的方法,其特征在于,所述待测短链RNA为miRNA或siRNA。
4.如权利要求1或2所述的一种利用扩增DNA片段长度多态性定量测定短链RNA的方法,其特征在于,所述RNA反转录过程中,所采用的引物为欧米茄引物。
5.如权利要求1或2所述的一种利用扩增DNA片段长度多态性定量测定短链RNA的方法,其特征在于,所述RNA反转录过程中,所采用的引物为茎环引物。
6.如权利要求5所述的一种利用扩增DNA片段长度多态性定量测定短链RNA的方法,其特征在于,所述茎环引物为经过长度编码的茎环引物。
7.如权利要求6所述的一种利用扩增DNA片段长度多态性定量测定短链RNA的方法,其特征在于,所述长度编码的方法为:在所述茎环引物的PCR靶位点与探针序列之间加上不同碱基数目,并调整引物5’端的碱基序列使之维持茎环的二级结构不变。
8.如权利要求2所述的一种利用扩增DNA片段长度多态性定量测定短链RNA的方法,其特征在于,所述校正曲线符合对数回归的方式,表述为:aXb,其中a、b为常数项,经对不同分子数目的所述合成小RNA的实际测定值而确定。
9.如权利要求1所述的一种利用扩增DNA片段长度多态性定量测定短链RNA的方法,其特征在于,所述与待测短链RNA相比无天然同源序列的合成小RNA的种数为三种。
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