[发明专利]恢复排泄物微生物群的组合物及其制造和使用方法

说明书

发明领域

本发明大体涉及医学和胃肠病学，药理学和微生物学。在可选的实施方案中，本发明提供了用于治疗哺乳动物中各种疾病和病症的组合物和方法，所述疾病和病症包括在胃肠道中存在异常微生物群或微生物群落异常分布的慢性疾病。在可选的实施方案中，本发明提供了源自经处理(例如过滤和/或离心)的人排泄物(例如粪便)的流体制剂或配制物，所述处理使得去除了所有细菌、真菌孢子和病毒，但是保留了来自于排泄物的天然生物活性分子。在可选的实施方案中，本发明提供了“粗”过滤，“不完全”过滤或中等程度过滤的微生物群，其仍包含细菌的天然生理成分或营养因子，例如，保留了天然生物活性成分或营养活性成分。在可选的实施方案中，本发明提供了与本发明的流体制剂或配制物相组合的高度过滤的或基本上纯化的微生物群，或者添加回本发明的流体制剂或配制物的高度过滤的或基本上纯化的微生物群。在可选的实施方案中，本发明提供了在其中培养，或在厌氧条件下培养，或在厌氧条件下收获、保存和/或培养细菌或微生物群组分的组合物或配制物。在可选的实施方案中，本发明提供了用于治疗这些病症疾病和病症的各种添加物，组合物和供体限制条件。

发明背景

人胃肠(GI)微生物菌群落，又被称为微生物群，与人微生物组包含约25,000个基因相比，包含大约330万基因。总的这些基因组合物被称为人肠道微生物组。野生型，或正常的GI微生物群包含超过1,200-1,500种不同的细菌物种和少量病毒及一些真菌。GI微生物群中有其他组分，包括纤维蛋白，少量未吸收的碳水化合物，粘液，灰分，矿物盐，微量元素，脂肪，微量营养素，死菌和偶尔未消化的食物。

在细胞数目方面，微生物群组成了非常大的活的人体结构组分。据说，GI微生物群内活菌细胞的绝对数目超过人体所有活细胞约9倍。确实，按照细胞计数，我们为10％人和90％细菌群落。

因此，人GI微生物群被认为是“虚拟器官”，其在我们体内具有“活的”人体器官的特征，并且产生后具有解剖学、生理学、病理学和其他特点的器官形成特征。GI微生物群具有发育不良或被各种寄生虫、病毒、真菌或细菌感染的可能性。因此，需要开发对于此类器官的治疗。除了抗生素之外，正如其他器官，移植是一种可能的治疗。

当受到可暂时或长期停留，甚至在菌群中终身存活的各种病原体侵入时，就是这种GI微生物群构成了我们以前没有意识到的与小肠和大肠有关的各种疾病，这些疾病由“超级感染”我们的最大器官引起，例如引起肠易激综合征(IBS)，艰难梭状芽胞杆菌感染(CDI)，腹泻，假膜性结肠炎等等。

最近在我们对于肠道菌群相关病症的理解方面有了极大的扩展。这些病症中一些易于理解为由异常细菌所引起，例如沙门氏菌肠炎，而诸如肥胖的其他病症在机制方面更难于理解，所述机制可能在肥胖的因果关系中起作用但仍起源于肠道菌群。然而，目前与GI微生物群例如肠微生物组相关的各种病症的名单正在增长。目前认为，仅举几个例子来说，诸如IBS，结肠炎，克罗恩氏病，便秘，代谢综合征的病症在很大程度上是由异常的肠道菌落或异常的GI微生物群引起。

在研究界活跃着试图修复菌群并且尝试和改善或治愈可能由异常的GI微生物群(即定居在肠道的异常细菌组合物)介导的此类病症。抗生素可产生暂时的改善，但是经常失效(例如，复发的CDI)，而这些失效表明对新的治疗方法的需求。

所有此类病症共有的常见基本因素是它们的发作是在一些外来侵入GI感染之后，即使父母可能不记得这个，因为它可能发生在十几年前，例如，正如IBS或便秘。在这些病症中有许多不能通过培养来证明感染，因为人GI微生物群(GI菌落)中存在着超过330万个不同的微生物基因和数量相当大的亚种，因此微生物亚种水平组合物的多样性是相当巨大的，而在这些中只有很小的百分比可被培养。因此，大多数这些病症不可能是简单超级感染特定单一病原体的结果，例如，正如CDI，并且也不可能很快就可以测定哪种特定物种和/或亚种是任何具体疾病或病症(病原)的原因或参与了任何具体疾病或病症。因此，目前的想法是，可能最有效的疗法(例如，对CDI而言)应当是仅仅找到用于输注供体菌群的适当组合物和递送系统，从而可以逆转或改善隐藏的或病原菌过度生长的状态。