[发明专利]筛选杨树生长和木材品质性状的SNP位点、筛选方法、试剂盒及应用

说明书

技术领域

本发明涉及分子生物学技术领域，具体而言，涉及一种筛选杨树生长和木材品质性状的SNP位点、筛选方法、试剂盒及应用。 

背景技术

杨树是北半球地区广泛栽培的重要用材树种，具有广泛的工业用途，是制浆造纸、胶合板、包装材料等的重要原料，有重要的经济价值。随着杨树工业用材林定向培育的发展，对杨树新品种也提出了相应的要求，不仅要求其速生，而且需具备优良的木材品质。在杨树优良品种的定向培育中，与造纸有关的材性性状，如木材密度、纤维长度和宽度、微纤丝角，以及纤维素、木质素含量等，是仅次于生长指标的主要考虑因素。 

分子标记辅助选择育种，是指利用分子标记对育种材料进行选择，是传统遗传育种与现代分子生物学有机结合的育种方法，可以很好的提高育种效率。在分子育种应用之前，需要鉴定与目标性状关联的分子标记。单核苷酸多态性（SNP）是继限制性片段长度多态性（RFLP）和微卫星多态性（SSR）之后发展起来的第3代分子标记，它具有数量多、分布广泛、遗传稳定性高、共显性等特点，是目前分子遗传学研究中重要技术手段。目前，通过对表型和基因型进行联合遗传学的研究，从而利用这些功能位点进行优良种质资源的选择育种，已经成为人工林新品种选育的重要途径。 

基于SNP的关联作图为分子标记辅助选择育种提供了一种新的策略，但是选择有效的分子标记是本领域技术人员一直努力的方向。 

发明内容

本发明旨在提供一种筛选杨树生长和木材品质性状的SNP位点、筛选方法、试剂盒及应用，以提供一种快速、准确筛选杨树生长和木材品质性状的方法和试剂盒。 

为了实现上述目的，根据本发明的一个方面，提供了一种筛选杨树生长和木材品质性状的SNP位点。该SNP位点为毛白杨GA20氧化酶基因第617位、第888位、第1138位和第1607位碱基以及毛白杨UDP-葡萄糖脱氢酶基因第69位、第92位和第229位碱基。 

进一步地，毛白杨GA20氧化酶基因第617位为A/G、第888位为C/T、第1138位为A/T和第1607位为C/T以及毛白杨UDP-葡萄糖脱氢酶基因第69位为C/T、第92位为C/T和第229位为A/C。 

根据本发明的另一个方面，提供了一种筛选杨树生长和木材品质性状的方法。该方法包括以下步骤：S1，提取毛白杨的基因组DNA；S2，测定毛白杨GA20氧化酶基因第617位、 第888位、第1138位和第1607位碱基以及毛白杨UDP-葡萄糖脱氢酶基因第69位、第92位和第229位碱基的多态性；S3，根据步骤S2的测定结果进行筛选。 

进一步地，毛白杨GA20氧化酶基因第617位基因型为AA、第888位基因型为TT、第1138位基因型为AA和第1607位基因型为CC以及毛白杨UDP-葡萄糖脱氢酶基因第69位基因型为CC、第92位基因型为TT和第229位基因型为AC时，毛白杨生长和木材品质最好。 

进一步地，毛白杨GA20氧化酶基因第617位基因型为AG或GG、第888位基因型为CC、第1138位基因型为AT和第1607位基因型为TT以及毛白杨UDP-葡萄糖脱氢酶基因第69位基因型为TT、第92位基因型为CC和第229位基因型为CC时，毛白杨生长和木材品质最差。 

进一步地，步骤S2中在测定毛白杨GA20氧化酶基因第617位碱基用的引物为SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3，测定第888位碱基用的引物为SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6，测定第1138位碱基用的引物为SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9，测定第1607位碱基用的引物为SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11、SEQ ID NO.12碱基以及测定毛白杨UDP-葡萄糖脱氢酶基因第69位碱基用的引物为SEQ ID NO.13、SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15、测定第92位碱基用的引物为SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17、SEQ ID NO.18和测定第229位碱基用的引物为SEQ ID NO.19、SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.21。