[发明专利]一种鉴定水稻纹枯病菌Sdh基因核苷酸点突变及其对噻呋酰胺抗药性的方法有效
申请号: | 201210281520.5 | 申请日: | 2012-08-09 |
公开(公告)号: | CN102864220A | 公开(公告)日: | 2013-01-09 |
发明(设计)人: | 刘西莉;牟文君;李波涛;刘鹏飞;李健强;王厚涵;林东 | 申请(专利权)人: | 中国农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/02;C12N15/11;C12N15/31;C07K14/37 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 水稻 病菌 sdh 基因 核苷酸 突变 及其 噻呋酰胺 抗药性 方法 | ||
1.一种检测或辅助检测水稻纹枯病菌中sdhB基因是否存在突变位点的方法,包括如下步骤:
以待测水稻纹枯病菌的基因组DNA为模板,用SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示引物对进行PCR扩增,若能扩增出条带,则所述待测水稻纹枯病菌中sdhB基因存在或候选存在突变位点;
所述突变位点指水稻纹枯病菌中sdhB基因的基因组序列自5’末端起第975位核苷酸为C和T杂合或T纯合。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述PCR扩增中,退火温度为56℃。
3.一种检测或辅助检测水稻纹枯病菌中sdhB基因是否存在突变位点的方法,包括如下步骤:
以待测水稻纹枯病菌的基因组DNA为模板,扩增得到sdhB基因,再用NlaIV酶切所得sdhB基因,若酶切产物中含有230bp片段,则所述待测水稻纹枯病菌中sdhB基因存在或候选存在突变位点;
所述突变位点指水稻纹枯病菌中sdhB基因的基因组序列自5’末端起第975位核苷酸为C和T杂合或T纯合。
4.一种检测或辅助检测水稻纹枯病菌中sdhB基因是否存在突变位点的引物对,由SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示DNA分子组成。
5.水稻纹枯病菌中sdhB基因的一个突变位点,为水稻纹枯病菌中sdhB基因的基因组序列自5’末端起第975位核苷酸为C和T杂合或T纯合。
6.水稻纹枯病菌中sdhB蛋白的一个突变位点,为水稻纹枯病菌中sdhB蛋白的自N端起第249位氨基酸为组氨酸与酪氨酸杂合或纯合的酪氨酸。
7.权利要求5或6所述突变位点在鉴定水稻纹枯病菌抗药性中的应用;所述抗药性为抗噻呋酰胺。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于:存在所述突变位点的水稻纹枯病菌具有或候选具有抗药性。
9.SEQ ID NO:3所示蛋白。
10.SEQ ID NO:4所示基因。
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