[发明专利]光可断裂的标记核苷酸和核苷与标记的核苷酸和核苷以及其在DNA测序中的使用方法有效
申请号: | 201110376726.1 | 申请日: | 2007-12-05 |
公开(公告)号: | CN102443030A | 公开(公告)日: | 2012-05-09 |
发明(设计)人: | 弗拉迪斯拉夫·A·利托什;布赖恩·P·斯图皮;迈克尔·L·梅茨克;吴卫东 | 申请(专利权)人: | 激光基因公司 |
主分类号: | C07H19/20 | 分类号: | C07H19/20;C07H19/10;C07H21/00;C07H1/00;C12Q1/68;C12N15/10;C12P19/34;G01N21/64 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 顾晋伟;卢蓓 |
地址: | 美国德*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 断裂 标记 核苷酸 核苷 及其 dna 中的 使用方法 | ||
1.下式的化合物:
其中R1是H、单磷酸酯、二磷酸酯或三磷酸酯,
R2是H或OH,
所述碱基是胞嘧啶、尿嘧啶、胸腺嘧啶、腺嘌呤或鸟嘌呤或其天然衍生物,
所述终止部分是赋予所述化合物以聚合酶终止性能的基团,
所述连接物是双官能团,以及
所述染料是荧光团。
2.权利要求1的化合物,其中所述终止部分是光可断裂的。
3.权利要求1的化合物,其中所述终止部分是光不可断裂的。
4.权利要求1的化合物,其进一步限定为选自下列的化合物:
式I 式II
式III 式IV
式V 式VI
和 式VII
其中R1=H、单磷酸酯、二磷酸酯或三磷酸酯,
R2=H或OH,
R3和R4各自独立地选自H、C1-C12直链或支链烷基、C2-C12直链或支链烯基或多烯基、C2-C12直链或支链炔基或多炔基、以及芳香性基团,
R5、R6、R7、R8和R9各自独立地选自H、OCH3、NO2、CN、卤 素、C1-C12直链或支链烷基、C2-C12直链或支链烯基或多烯基、C2-C12直链或支链炔基或多炔基、以及芳香性基团,前提是R5、R6和R7是下列结构的基团:
其中X是CH2、CH=CH、C≡C、O、S或NH,
Y是CH2、O或NH,
n是0-12的整数,
m是0-12的整数,以及
染料是荧光团。
5.权利要求4的化合物,其中R9是NO2,R3和R4至少之一是H。
6.权利要求4的化合物,其中R9不是NO2。
7.权利要求5或6的化合物,其中R5、R6和R7之一是下述结构的基团:
其中,X是C≡C以及染料是荧光团。
8.权利要求5或6的化合物,其中R3和R4独立地选自H、-CH3、-CH2CH3、-CH2CH2CH3、异丙基、叔丁基、苯基、2-硝基苯基和2,6-二硝基苯基。
9.权利要求8的化合物,其中R3或R4是-CH3、异丙基或叔丁基。
10.权利要求5或6的化合物,其中R3和R4独立地选自H、烷基和芳香基,所述烷基或芳香性基团中任选地含有至少一个杂原子,并且其中所述芳香性基团可任选地是芳基或者是多环基团。
11.权利要求5或6的化合物,其进一步限定为式(I)的化合物。
12.权利要求5或6的化合物,其进一步限定为式(II)的化合物。
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