[发明专利]抗结核抑制剂筛选的靶标基因Rv3290c及应用

权利要求书

1.结核分枝杆菌基因Rv3290c在筛选抗结核抑制剂靶标中的应用，其特征在于，该基因的核苷酸序列如序列表SEQ.ID NO：1所示。

2.结核分枝杆菌基因Rv3290c在筛选抗结核抑制剂靶标中的应用，其特征在于，该基因编码的蛋白质的序列如序列表SEQ.ID NO：2所示。

3.如权利要求1或2所述的一种结核分枝杆菌Rv3290c基因作为药物靶标的应用，其特征在于包含以下步骤：

(1)从PBD蛋白质数据库获得结核分枝杆菌Rv3290c蛋白质结构，以蛋白质上结合磷酸吡哆醛和α-酮戊二酸的天然底物结合位点为其活性位点；

(2)建立针对结核分枝杆菌Rv3290c的计算机药物筛选系统；

(3)运用步骤(2)的计算机药物筛选系统针对结核分枝杆菌Rv3290c蛋白质活性位点，从ZINC数据库中筛选出20个与结核分枝杆菌Rv3290c活性位点有高亲和力的化合物；

(4)利用小分子化合物进行抑菌试验，测定有抑菌活性的小分子的最小抑菌浓度；

其中：

步骤(1)中的结核分枝杆菌Rv3290c蛋白质的序列如序列表SEQ ID NO：2所示；

步骤(3)的20个与结核分枝杆菌Rv3290c活性位点有高亲和力的化合物如下所述，且具有以下特征：

化合物1#

英文名称：N-[(4，4-dimethyl-2，6-dioxocyclohexylidene)methyl](methyl)homocysteine

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC19338987；

化合物2#

英文名称：N-[(2，6-dioxocyclohexylidene)methyl]aspartic acid

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC19639046；

化合物3#

英文名称：2-({2-[(2-methyl-2-phenylcyclopropyl)carbonyl]hydrazino}carbonyl)benzoic acid

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC00333535；

化合物4#

英文名称：

1-(4-chlorophenyl)-5-[(1H-tetraazol-5-ylamino)methylene]-2，4，6(1H，3H，5H)-pyrimidinetrione

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC19805480；

化合物5#

英文名称：N-[(2，2-dimethyl-4，6-dioxo-1，3-dioxan-5-ylidene)methyl]glutamic acid

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC02026613；

化合物6#

英文名称：5-chloro-2-{[(1，3-dioxo-1，3-dihydro-2H-inden-2-ylidene)methyl]amino}benzoic acid

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC19908460；

化合物7#

英文名称：2-[(5-bromo-2-furoyl)amino]-3-(2-furyl)acrylic acid

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC00306269；

化合物8#

英文名称：N～2～-[(2，2-dimethyl-4，6-dioxo-1，3-dioxan-5-ylidene)methyl]glutamine

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC02028991；

化合物9#

英文名称：(5-formyl-4-hydroxy-6-oxo-3-phenylpyridazin-1(6H)-yl)acetic acid

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC19938668；

化合物10#

英文名称：2-(butoxycarbonyl)terephthalic acid

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC02024019；

化合物11#

英文名称：7-hydroxy-2，4-dioxo-1，2，3，4-tetrahydro-6-pteridinecarboxylic acid

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC19800880；

化合物12#

英文名称：3-methyl-1-phenyl-4-(quinolin-5-yldiazenyl)-1H-pyrazol-5-ol

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC06269027；

化合物13#

英文名称：

4-(acetyloxy)-2-[(acetyloxy)methyl]-5-(6-amino-7，8-dihydro-9H-purin-9-yl)tetrahydro-3-furanyl acetate

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC02105819；

化合物14#

英文名称：

ethyl 2-[(3，5-dibromo-2，4-dihydroxybenzylidene)amino]-4，5，6，7-tetrahydro-1-benzothiophene-3-carboxylate

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC00690246；

化合物15#

英文名称：

2-(1，3-dioxo-1，3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)-3-{[(4-methylphenyl)sulfonyl]oxy}acrylic acid

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC02023396；

化合物16#

英文名称：2-[2-(1-cyano-2-hydrazino-2-oxoethylidene)hydrazino]benzoic acid

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC00333102；

化合物17#

英文名称：4-({10-[(3-carboxyacryloyl)oxy]decyl}oxy)-4-oxobut-2-enoic acid

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC04100227；

化合物18#

英文名称：diethyl 2，6-dihydroxypyridine-3，5-dicarboxylate

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC17111072；

化合物19#

英文名称：3-[5-(4-fluorobenzylidene)-4-oxo-2-thioxo-1，3-thiazolidin-3-yl]benzoic acid

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC00966733；

化合物20#

英文名称：

ethyl 4-[(3-{[4-(ethoxycarbonyl)phenyl]imino}-3，4-dihydroquinoxalin-2(1H)-ylidene)amino]benzoate

结构式：

化合物在ZINC数据库中的编号：ZINC09783046；

其中

步骤(4)测定有抑菌活性的小分子化合物即抑制剂14#的最小抑菌浓度分别如下：

结核分枝杆菌      2μg/ml；

牛结核分枝杆菌    2-4μg/ml。