本发明属于高原鼢鼠分子标记制备技术领域,具体涉及CYP3A2基因作为高原鼢鼠抗药性检测的分子标记及其应用。本发明的分子标记由CYP3A2基因克隆得到,它的核苷酸序列如序列表SEQ ID №:2所述。在序列表SEQ ID №:2的外显子5第87bp处有A—G;外显子12第33bp处有C—T、第37bp处有R(A/G)—T、第40bp处有A—C、第60bp处有碱基插入A60、第96bp—99bp处有GAGC—CGAT的碱基替换,该突变导致CYP3A2基因多态性。本发明还公开了扩增CYP3A2基因完整CDS序列和部分DNA序列所用的引物以及用于多态性检测的方法,为高原鼢鼠抗药性的标记辅助选择提供了一个新的分子标记。
本申请提供了一种CYP2C19*2和CYP2C19*3位点数字PCR检测试剂盒,包括2对扩增引物与2对MGB探针,ddPCR Supermix for Probes。本申请还提供了一种CYP2C19*2和CYP2C19*3位点数字PCR检测方法,包括DNA提取,数字PCR检测及结果分析等步骤。与现有检测试剂盒相比,本申请可同时检测CYP2C19*2与CYP2C19*3多态位点,检测结果更快速、精确,成本低,满足临床低成本高通量的检测要求。
本发明提供一种检测CYP2C19基因分型的荧光PCR试剂盒,属于体外核酸检测领域,包括检测基因CYP2C19*2和CYP2C19*3型的PCR反应液、Taq酶、尿嘧啶DNA糖基化酶;检测CYP2C19*2和CYP2C19*3基因的PCR反应液当中均包含PCR扩增引物、MGB探针等;检测基因CYP2C19*2型和CYP2C19*3型的扩增引物的核苷酸序列分别如SEQ IDNO:3-4及SEQ ID NO本发明提供的试剂盒灵敏度高,特异性好,可实时监测反应进程,反应时间短,无需后续处理,可最大限度避免反应产物污染,可以取代传统蛋白检测或普通PCR检测CYP2C19基因的分型诊断。
本发明提供一种CYP2C19*2和CYP2C19*3检测引物及其检测体系,属于分子生物学及核酸检测技术领域。本发明在ARMS-PCR的基础上采用双向扩增阻滞突变系统PCR(Bi-Amplification Refractory Mutation System PCR,BI-ARMS-PCR)技术,设计出CYP2C19*2和CYP2C19*3检测引物及其检测体系。通过读取电泳的条带个数及大小来判定待测样本中的rs4244285和rs4986893位点的碱基,从而判断被测试者是否携带CYP3A5*2和/或CYP3A5*2,指导被测试者用药。