本发明属于高原鼢鼠分子标记制备技术领域,具体涉及CYP3A2基因作为高原鼢鼠抗药性检测的分子标记及其应用。本发明的分子标记由CYP3A2基因克隆得到,它的核苷酸序列如序列表SEQ ID №:2所述。在序列表SEQ ID №:2的外显子5第87bp处有A—G;外显子12第33bp处有C—T、第37bp处有R(A/G)—T、第40bp处有A—C、第60bp处有碱基插入A60、第96bp—99bp处有GAGC—CGAT的碱基替换,该突变导致CYP3A2基因多态性。本发明还公开了扩增CYP3A2基因完整CDS序列和部分DNA序列所用的引物以及用于多态性检测的方法,为高原鼢鼠抗药性的标记辅助选择提供了一个新的分子标记。