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[发明专利]基于ctDNA多位点甲基化的肿瘤病灶位置识别方法-CN202310430384.X在审
发明人：崔品 -专利权人：深圳市睿法生物科技有限公司
申请日： 2023-04-13 - 公布日： 2023-07-14 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明涉及医学检测技术，揭露了一种基于ctDNA多位点甲基化的肿瘤病灶位置识别方法及装置，包括：获取ctDNA序列数据，检测ctDNA序列数据的甲基化；生成ctDNA甲基化序列数据对应的高质量ctDNA甲基化序列数据，对高质量ctDNA甲基化序列数据进行序列扩增，得到高质量ctDNA甲基化序列数据簇；确定高质量ctDNA甲基化序列数据簇与目标基因序列组的ctDNA差异序列数据；根据差异权重确定ctDNA差异序列数据中的差异数据频率，根据差异数据频率及差异偏移距离确定差异序列数据中的ctDNA甲基化位点；对ctDNA甲基化位点的变异序列进行检测，根据变异位点识别目标肿瘤的肿瘤病灶位置。
基于 ctdna 多位点甲基化肿瘤病灶位置识别方法

[发明专利]一种用于肿瘤筛查的ctDNA多维表观遗传标志物差异识别方法-CN202211388295.5有效
发明人：崔品 -专利权人：深圳市睿法生物科技有限公司
申请日： 2022-11-08 - 公布日： 2023-07-21 - 主分类号： G01N21/64 文献下载
摘要：本发明涉及用于肿瘤筛查的ctDNA多维表观遗传标志物差异识别技术领域，揭示了一种用于肿瘤筛查的ctDNA多维表观遗传标志物差异识别方法，包括：获取肿瘤患者样本，取肿瘤患者的血浆为所述肿瘤患者血浆样本，提取所述肿瘤患者样本中的ctDNA，获得肿瘤患者ctDNA；提取所述肿瘤患者ctDNA中的表观遗传标志物，获取ctDNA表观遗传标志物；获取所述ctDNA表观遗传标志物图像，建立所述ctDNA表观遗传标志物图像集；将所述ctDNA表观遗传标志物图像分割为背景与前景两个部分，所述前景为所述ctDNA表观遗传标志物图像的目标。本发明可解决现有方案中利用ctDNA表观遗传标志物筛查肿瘤的程序复杂，操作困难的技术问题。
一种用于肿瘤 ctdna 多维表观遗传标志差异识别方法

[发明专利]一种SNP杂合样本的半定量方法-CN202110205947.6在审
发明人：万谦;蒋小辉;向俊蓓 -专利权人：成都新生命霍普医学检验实验室有限公司
申请日： 2021-02-24 - 公布日： 2021-06-04 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明公开了一种SNP杂合样本的半定量方法，包括如下步骤：1)合成两个长度相同的DNA模板P‑ctDNA‑1和P‑ctDNA‑2，两者序列仅在中部的同一位点存在SNP差异；2)合成能通过PCR完全扩增P‑ctDNA‑1和P‑ctDNA‑2的引物P‑ctDNA‑3和引物P‑ctDNA‑4；3)按多种不同的比例混合P‑ctDNA‑1和P‑ctDNA‑2，得到P‑ctDNA‑2占比不同的DNA混合物；4)以步骤3)中混合物作为模板，以P‑ctDNA‑3和P‑ctDNA‑4为引物进行PCR扩增，然后回收条带，再以P‑ctDNA‑3为引物进行Sanger一代DNA测序，获得不同比例下SNP位点的测序图谱。
一种 snp 样本定量方法

[发明专利]一组检测微小骨肉瘤肺转移分子标记物以及应用-CN201910899947.3有效
发明人：王晋;徐怀远;陈宏敏;邓创忠;许衍扬;宋怿江;唐清连;卢金昌;朱小军;宋国徽 -专利权人：中山大学附属第一医院
申请日： 2019-09-23 - 公布日： 2019-12-03 - 主分类号： C12Q1/6886 文献下载
摘要：本发明提供了血液循环ctDNA突变作为诊断标志物在制备检测骨肉瘤转移的诊断试剂盒中的应用。血液循环ctDNA能够提供对肿瘤基因组的综合描述，因为ctDNA从多个不同肿瘤区域或多个病灶处释放，ctDNA分析可以发现组织活检中无法发现的体细胞突变。ctDNA的出现是癌症复发和不良预后的有力标志，ctDNA具备预测预后的价值。
血液循环预后突变诊断标志物诊断试剂盒肿瘤基因组癌症复发肿瘤区域骨肉瘤体细胞病灶制备发现释放检测预测应用分析

[发明专利]一种微量ctDNA建库的优化方法-CN202110254775.1在审
发明人：戴俊程;江玥;赵啸宇 -专利权人：南京医科大学
申请日： 2021-03-09 - 公布日： 2022-09-13 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明公开了一种微量ctDNA建库的优化方法，优化步骤包括如下：S1，ctDNA提取：首先从患者的静脉血中提取ctDNA，同时提取的ctDNA实量为微量；S2，ctDNA质检：当提取完毕ctDNA后需要对其进行质检，对ctDNA的质量进行把控；S3，ctDNA随机打断：采用限制性酶切法，即可完成对ctDNA的打断目的。
一种微量 ctdna 优化方法

[发明专利]一种优化ctDNA检测准确率的方法-CN202111605813.X有效
发明人：刘涛;王鑫 -专利权人：武汉承启医学检验实验室有限公司
申请日： 2021-12-25 - 公布日： 2022-11-01 - 主分类号： C12Q1/6851 文献下载
摘要：本申请涉及肿瘤DNA检测领域，具体公开了一种优化ctDNA检测准确率的方法，包括以下步骤：S1、血液样本处理：将血液样本在采血2h内进行以下操作：将血液样本离心，取上层血浆；S2、ctDNA的抽离：向血浆中加入裂解液、蛋白质酶解剂和二氧化硅，混匀，离心，取下层沉淀物，加入EB缓冲液，水浴，取出，在室温下，离心，取上清液作为ctDNA样本，保存；S3、ctDNA样本中间处理：将ctDNA样本回温至1‑10℃，超声；S4、ctDNA含量检测：将ctDNA样本PCR扩增，将扩增后的ctDNA与生物传感器混合，杂交反应，检测荧光强度。本申请的ctDNA的检测方法具有血浆提取率高，提取时间短，蛋白质水解度大，准确率、灵敏度高。
一种优化 ctdna 检测准确率方法

[发明专利]尿液ctDNA中EGFR基因突变位点的检测-CN201710210955.3在审
发明人：陈谦;张建民;李新新;贾海雪;刘芳;周瑜 -专利权人：索真（北京）医学科技有限公司
申请日： 2017-03-31 - 公布日： 2018-07-24 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明提出了尿液ctDNA中EGFR基因突变位点的检测，具体提出了从尿液样本中分离ctDNA的方法、基于尿液样本构建测序文库的方法、测序文库、基于尿液样本进行核酸测序方法、用于从尿液样本中分离ctDNA从尿液样本中分离ctDNA的方法包括：向尿液样本中加入EDTA，以便得到第一混合液；将混合液进行离心处理，收集上清液；将上清液进行浓缩处理，以便得到浓缩液；将浓缩液与阴离子交换树脂进行混合处理，以便得到第二混合液；将第二混合液进行色谱分离处理，以便得到洗脱液；以及将洗脱液进行纯化处理，以便得到ctDNA。本发明能够从大量尿液样本中快速、大量地提取出ctDNA，并能够对其进行核酸测序，还可以确定个体药物敏感性，从而提高了尿液ctDNA的应用前景。
尿液样本混合液尿液药物敏感性测序文库核酸测序突变位点浓缩液上清液洗脱液阴离子交换树脂纯化处理混合处理离心处理浓缩处理色谱分离检测构建应用

[发明专利]尿液ctDNA中PIK3CA基因突变位点的检测-CN201710211013.7在审
发明人：陈谦;张建民;李新新;贾海雪;刘芳;周瑜 -专利权人：索真（北京）医学科技有限公司
申请日： 2017-03-31 - 公布日： 2018-07-24 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明提出了尿液ctDNA中PIK3CA基因突变位点的检测，具体提出了从尿液样本中分离ctDNA的方法、基于尿液样本构建测序文库的方法、测序文库、基于尿液样本进行核酸测序方法、用于从尿液样本中分离ctDNA从尿液样本中分离ctDNA的方法包括：向尿液样本中加入EDTA，以便得到第一混合液；将混合液进行离心处理，收集上清液；将上清液进行浓缩处理，以便得到浓缩液；将浓缩液与阴离子交换树脂进行混合处理，以便得到第二混合液；将第二混合液进行色谱分离处理，以便得到洗脱液；以及将洗脱液进行纯化处理，以便得到ctDNA。本发明能够从大量尿液样本中快速、大量地提取出ctDNA，并能够对其进行核酸测序，还可以确定个体药物敏感性，从而提高了尿液ctDNA的应用前景。
尿液样本混合液尿液药物敏感性测序文库核酸测序突变位点浓缩液上清液洗脱液阴离子交换树脂纯化处理混合处理离心处理浓缩处理色谱分离检测构建应用

[发明专利]尿液ctDNA中BRAF基因突变位点的检测-CN201710211468.9在审
发明人：张建民;陈谦;李新新;贾海雪;刘芳;周瑜 -专利权人：索真（北京）医学科技有限公司
申请日： 2017-03-31 - 公布日： 2018-07-24 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明涉及尿液ctDNA中BRAF基因突变位点的检测，具体为从尿液样本中分离ctDNA的方法、基于尿液样本构建测序文库的方法、测序文库、基于尿液样本进行核酸测序方法、用于从尿液样本中分离ctDNA的设备以及确定个体药物敏感性的系统从尿液样本中分离ctDNA的方法包括：向尿液样本中加入EDTA，以便得到第一混合液；将混合液进行离心处理，收集上清液；将上清液进行浓缩处理，以便得到浓缩液；将浓缩液与阴离子交换树脂进行混合处理，以便得到第二混合液；将第二混合液进行色谱分离处理，以便得到洗脱液；以及将洗脱液进行纯化处理，以便得到ctDNA。本发明能够从大量尿液样本中快速、大量地提取出ctDNA，并能够对其进行核酸测序，还可以确定个体药物敏感性，从而提高了尿液ctDNA的应用前景。
尿液样本混合液尿液药物敏感性测序文库核酸测序突变位点浓缩液上清液洗脱液阴离子交换树脂纯化处理混合处理离心处理浓缩处理色谱分离检测构建应用

[发明专利]一种无标记快速灵敏检测ctDNA的生物传感方法-CN202310701832.5在审
发明人：杨眉;杨潇;黄杨;杨思义;刘娟;侯长军 -专利权人：重庆大学
申请日： 2023-06-13 - 公布日： 2023-09-22 - 主分类号： C12Q1/6825 文献下载
摘要：本发明涉及一种无标记快速灵敏检测ctDNA的生物传感方法，属于ctDNA的检测技术领域。本发明的生物传感方法是首次提出采用荧光聚多巴胺纳米粒子作为荧光信号用于ctDNA的快速灵敏检测，为ctDNA检测提供了新的思路；另外，由于大多数方法使用有机染料和发光材料作为信号分子来标记ctDNA，或者需要复杂的生物放大技术来检测ctDNA，相比之下本发明采用荧光聚多巴胺纳米粒子作为生物传感器的荧光信号进行无标记检测具有不低于其他方法的检出限和检测范围和无需复杂修饰和放大的特点；同时本发明的生物传感方法除了成功应用于血清样本中的检测
一种标记快速灵敏检测 ctdna 生物传感方法

[发明专利]一种血液ctDNA的检测方法-CN202210051351.X在审
发明人：朱律韵;李明;谢斯思;朱凌云;匡静宇;邵彤;张海洋;鲁晨瑜 -专利权人：中国人民解放军国防科技大学
申请日： 2022-01-17 - 公布日： 2022-05-06 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种血液ctDNA的检测方法，包括以下步骤：对TCGA数据库中基于全外显子测序的HNSC、DLBC和SARC数据集中的突变进行迭代，生成初始的捕获器；过滤良性突变频发的基因组区域获得背景噪音优化的捕获器；采用所述背景噪音优化的捕获器对ctDNA进行捕获。本发明在保证提高ctDNA捕获率和抑制背景噪音的同时，开发一种不依赖于并行WBC测序的ctDNA捕获方法，并通过使用一种比现有指标更能真实反映肿瘤基因组突变负荷的评估指标，提高ctDNA的临床适用性。
一种血液 ctdna 检测方法

[发明专利]尿液ctDNA中K-ras基因突变位点的检测-CN201710210153.2在审
发明人：张建民;陈谦;李新新;贾海雪;刘芳;周瑜 -专利权人：索真（北京）医学科技有限公司
申请日： 2017-03-31 - 公布日： 2018-07-24 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明提出了从尿液样本中分离ctDNA的方法、基于尿液样本构建测序文库的方法、测序文库、基于尿液样本进行核酸测序方法、用于从尿液样本中分离ctDNA的设备以及确定个体药物敏感性的系统。从尿液样本中分离ctDNA的方法包括：向尿液样本中加入EDTA，以便得到第一混合液；将混合液进行离心处理，收集上清液；将上清液进行浓缩处理，以便得到浓缩液；将浓缩液与阴离子交换树脂进行混合处理，以便得到第二混合液；将第二混合液进行色谱分离处理，以便得到洗脱液；以及将洗脱液进行纯化处理，以便得到ctDNA。本发明能够从大量尿液样本中快速、大量地提取出ctDNA，并能够对其进行核酸测序，还可以确定个体药物敏感性，从而提高了尿液ctDNA的应用前景。
尿液样本混合液药物敏感性测序文库核酸测序浓缩液上清液洗脱液尿液阴离子交换树脂纯化处理混合处理离心处理浓缩处理色谱分离突变位点构建检测应用

[发明专利]一种介孔材料及其修饰方法和用途-CN201710059070.8有效
发明人：张龙;张蓓 -专利权人：张龙;张蓓
申请日： 2017-01-23 - 公布日： 2018-08-21 - 主分类号： B01J20/22 文献下载
摘要：另外，本发明还公开了采用所述修饰方法修饰得到的介孔材料，以及所得介孔材料在用于捕获分离ctDNA中的用途。本发明所公开的采用介孔材料分离ctDNA的方法，能够实现对ctDNA样品的快速高效捕获，同时简单快捷，可以有效解决ctDNA已被分解和需要较长预处理时间的瓶颈，为ctDNA更广泛的产业化应用奠定了基础。
一种材料及其修饰方法用途

[发明专利]用于血浆ctDNA非特异复制的试剂盒-CN201611259957.3有效
发明人：张介中;姜锋;杜洋;玄兆伶;李大为;梁峻彬;陈重建 -专利权人：浙江安诺优达生物科技有限公司;安诺优达基因科技（北京）有限公司;安诺优达（义乌）医学检验有限公司
申请日： 2016-12-30 - 公布日： 2022-03-29 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明涉及一种用于血浆ctDNA非特异性复制的试剂盒。本发明的试剂盒包括用于加接头的试剂、用于PCR扩增的试剂、用于切割的试剂。应用本发明的试剂盒进行血浆ctDNA复制具有以下优点：获得大量与血浆ctDNA基本相同的可利用DNA片段。
用于血浆 ctdna 特异复制试剂盒

[发明专利]一种基于ddPCR定量检测ctDNA的方法-CN201710570752.5在审
发明人：廖兴华;余承熙;项园;郭玮;李馥正;王宁;刘义;张同存 -专利权人：深圳瑞科生物科技有限公司
申请日： 2017-07-13 - 公布日： 2017-09-01 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种基于数字PCR检测ctDNA的方法。本发明的一种基于数字PCR定量检测病毒的方法，包括(1)使用循环游离DNA提取试剂盒提取血浆循环游离DNA；(2)循环游离DNA的富集及分离；(3)以步骤(2)中分离出的ctDNA为模板的PCR扩增反应本发明针对ctDNA在外周血中的含量非常低的特点，采用PCR方法对ctDNA进行富集以及有效的捕获，以捕获的ctDNA为模板进行数字PCR扩增检测，大大提高了检测的灵敏度，从而提高了诊断的准确性，在癌症检测方面
一种基于 ddpcr 定量检测 ctdna 方法

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