本申请属于甜瓜基因育种开发技术领域,具体涉及一个与甜瓜绿色果皮性状相关的APRR2基因。该基因长度为1134bp,与甜瓜果皮的绿色性状相关,碱基序列如SEQ ID NO.1所示。本申请以黄皮和绿皮材料构建的六世代遗传群体为基础,初步解析了甜瓜果皮颜色的遗传规律,并最终确定了一个与甜瓜绿色果皮形成密切相关的基因。进一步的基因克隆发现该基因在甜瓜白色和黄色果皮材料中存在一个13bp的碱基插入,据此进一步设计了indel标记。总之,该分子标记可用于甜瓜皮色育种中的早期选择。而基于本申请相关研究结果,也可为新的甜瓜品种的培育奠定一定基础。