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- [发明专利]基于支持向量机的剪接位点识别方法-CN201210572684.3有效
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魏丹;姜青山;魏彦杰
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中国科学院深圳先进技术研究院
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2012-12-25
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2014-07-02
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G06F19/24
- 本发明涉及一种基于支持向量机的剪接位点识别方法,包括:构建数据集,数据集包括训练数据集及测试数据集;提取训练数据集的剪接位点序列的特征向量,记为第一特征向量;提取训练数据集的剪接位点上游序列及下游序列的特征向量,记为第二特征向量;根据第一特征向量及第二特征向量选取所述训练数据集的特征向量,记为第三特征向量;根据第三特征向量,构建SVM分类器;根据分类器识别所述测试数据集的剪接位点。本发明采用训练数据集构建马尔可夫模型,用该模型参数将训练数据集及测试数据集转换成特征向量,并将该特征向量和剪接位点上、下游密码子使用偏性的特征向量,进行线性组合,以提取剪接位点邻近序列中更多信息,从而提高分类精度
- 基于支持向量剪接识别方法
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