本发明公开了一种水稻叶绿体核糖体蛋白及其编码基因和应用,所述蛋白具有如SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列,所述编码基因的DNA序列如SEQ ID NO.2所示,全长3963bp,CDS序列如SEQ经基因预测和功能鉴定发现,该蛋白为叶绿体核糖体小亚基蛋白S1,将该蛋白的编码基因导入叶绿体发育异常的突变体植株中,可以培育成含正常色素且发育正常的植株,而它的缺失突变可导致水稻幼苗白化致死。
本发明公开了一种菊花叶绿体基因组SSR标记库、其获得方法及其应用,SSR标记库包括SSR标记序列SEQ ID NO.1,还包括SEQ ID NO.2‑40中的至少一个;SSR标记库的获得方法包括,将菊花品种叶绿体基因组DNA,进行SSR分析,获得SSR标记,将同一品种的SSR标记拼接为SSR标记序列,得到SSR标记库;SSR标记库的应用,其特征在于,将SSR标记库用于构建系统发育树或用于鉴别菊花的品种;SSR标记库可以用于有效而准确地鉴定菊花品种
本发明公开了一种阳春砂和海南砂种间杂交种及其亲本的鉴定方法,提供了阳春砂和海南砂的单倍型分子标记,所述单倍型分子标记含有4个SNP位点;所述鉴定方法为:提取被鉴定的样本的基因组DNA;对基因组DNA进行高通量测序;以核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示的序列作为参比序列,检测高通量测序数据的单倍型分子标记类型,判定被鉴定的样本的品种;还根据被鉴定的样本及其相近物种的叶绿体基因组构建系统发生树,判定被鉴定的样本的母本本发明提供了一种简便、高效的阳春砂和海南砂种间杂交物种分子鉴定的方法,根据ITS2基因的单倍型鉴定植物种间杂交种,同时结合叶绿体基因组分析,有效判定杂交种的亲本来源,解决了种间杂交种不易区分鉴定的技术难题
本引物包括3个叶绿体和3个线粒体引物对:SEQ ID NO:7、8,SEQ ID NO:9、10,SEQ ID NO:11、12,SEQ ID NO:13、14,SEQ ID NO:15、16,SEQ 本方法是:①基因组DNA提取;②PCR扩增;③DNA测序;④序列分析;⑤杂交子代的鉴定。与现有技术相比,本发明操作简单、重复性好、稳定性高、不受环境影响;节省育种成本。
本发明提供一种基于DNA条形码鉴定黑果枸杞的方法。所述鉴定黑果枸杞的DNA条形码基因序列为LRITS2(the second internal transcribed spacer,第二个核糖体RNA内转录间隔区)/LRpsbA‑trnH(叶绿体基因psbA所述鉴定黑果枸杞的DNA条形码序列LRITS2/LRpsbA‑trnH可以同时应用或任选其中之一。本发明能高效、精准地鉴定黑果枸杞原料。