本发明公开了一种荧光定量PCR鉴定菊花内、外源基因拷贝数的引物对及方法。PGK基因作为内参基因在荧光定量PCR鉴定菊花内、外源基因拷贝数中的应用。一种应用于荧光定量PCR鉴定菊花内、外源基因拷贝数的内源基因扩增引物对，正向引物序列如SEQ ID NO.1所示，反向引物序列如SEQ ID NO.2所示。本发明可以快速、准确、高效的鉴定菊花内源基因拷贝数和转基因菊花转内源、转外源基因拷贝数。通过本发明提供的检测引物和方法，以菊花和转基因菊花为实验材料，根据待检测拷贝数的基因和内源参照基因PGK的CT值比较分析，即可得出菊花内源基因拷贝数和转基因菊花所转基因拷贝数。该检测方法为复杂基因组基因的拷贝数鉴定提供了新思路，大大提高了检测基因拷贝数的效率。
本发明提供一种适合甘蔗外源基因拷贝数鉴定的内源基因筛选与应用，采用的引物和探针的核苷酸序列分别为SEQ ID No.1、SEQ ID No.2和SEQ ID No.3，所述内源基因PCR扩增长度为95 鉴于目前甘蔗外源基因拷贝数鉴定方法复杂、工作量大、效率低下、准确性低等问题，提供一种适合甘蔗外源基因拷贝数鉴定的内源基因筛选与应用，所建立的内源基因和外源基因标准曲线的构建方法，操作简单、灵敏度高、特异性强、准确度高及可重复性高，为转基因甘蔗外源基因拷贝数鉴定提供科学、准确、实用的检测方法。
