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[发明专利]一种针对SARS-CoV-2病毒的全基因组扩增方法及应用及测序方法及试剂盒-CN202010487939.0在审
发明人：曹亮;金桃;张智闵;林德春;黄艳艳;吴海滨;蒋华;束文圣 -专利权人：广东美格基因科技有限公司
申请日： 2020-06-01 - 公布日： 2020-12-01 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明公开了一种针对SARS‑CoV‑2病毒的全基因组扩增方法，包括步骤：S1、根据SARS‑CoV‑2全基因组序列，设计全基因组扩增引物组合，全基因组扩增引物组合用于对病毒反转录产物进行全基因组扩增以获得完全覆盖SARS‑CoV‑2全基因组的全基因组扩增产物；S2、从待检测样品中提取核酸，结合反转录引物进行反转录；S3、以步骤S2获得的反转录产物作为模板，结合全基因组扩增引物进行多重PCR扩增，获得全基因组扩增产物本发明能够高效富集扩增SARS‑CoV‑2病毒的全基因组片段，基于本发明全基因组扩增产物的测序方法仅需少数据量的测序就能获取病毒全基因组的信息，相较于现有技术更高效、快捷和廉价。
一种针对 sars cov 病毒基因组扩增方法应用试剂盒

[发明专利]全基因组扩增方法及其应用-CN201280069843.6在审
发明人：吴逵;吴汉杰;侯勇;徐讯;王俊 -专利权人：深圳华大基因科技服务有限公司
申请日： 2012-03-30 - 公布日： 2014-10-22 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明提出了对全基因组样本进行扩增的方法、对全基因组进行测序的方法、确定全基因组中是否存在异常状态的方法、对全基因组样本进行扩增的装置、对全基因组进行测序的设备、确定全基因组中是否存在异常状态的系统。其中，对全基因组样本进行扩增的方法包括：将全基因组样本进行第一扩增反应，以便获得第一扩增产物；将第一扩增产物进行第二扩增反应，以便获得第二扩增产物，其中，第一扩增反应是基于PCR的扩增反应和恒温扩增反应的一种
基因组扩增方法及其应用

[发明专利]胚胎植入前DNA分析检测方法及装置-CN202211637483.7在审
发明人：姚雪龙;伊丽祉 -专利权人：广州女娲生命科技有限公司
申请日： 2022-12-15 - 公布日： 2023-04-04 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明实施例涉及全基因组数据库构建技术领域，公开了一种胚胎植入前DNA分析检测方法，包括：获取经全基因组甲基化测序的胚胎样本细胞的样本全基因组序列，并基于样本全基因组序列中每个碱基的质量分数筛选符合预设条件的全基因组序列；将符合条件的全基因组序列比对到参考基因组序列上以得到具有位置信息的基因组序列；对比对后的基因组序列进行序列筛查操作以得到待测试基因组序列；提取待测试基因组序列所有CpG位点的甲基化状态数据并确定状态分析内容本发明实施例中的胚胎植入前DNA分析检测方法通过对测序后得到的全基因组序列进行数据筛查操作，使得得到的数据质量更高且更准确，进而为胚胎移植提供更准确的数据。
胚胎植入 dna 分析检测方法装置

[发明专利]一种菌株及其在提高微生物次级代谢产物的产量中的应用-CN201810764818.9在审
发明人：元英进;贾斌;王娟 -专利权人：天津大学
申请日： 2018-07-12 - 公布日： 2018-11-30 - 主分类号： C12N1/19 文献下载
摘要：本发明涉及合成生物学领域，特别涉及全基因组加倍及其应用、全基因组加倍的菌株及其在提高微生物次级代谢产物的产量中的应用。本申请人基于LoxPsym位点特异性重组的合成型基因组重排系统(SCRaMbLE)在单倍体合成型酿酒酵母中进行基因组重排发现全基因组加倍对脱氧紫色杆菌素前体产量的增加有影响。并且通过定量PCR及构建基因组中相关基因加倍的菌株验证了全基因组加倍与脱氧紫色杆菌素前体生产相关。因此本发明提供了全基因组加倍及其应用、全基因组加倍的菌株及其在提高微生物次级代谢产物的产量中的应用。
全基因组微生物次级代谢产物菌株应用基因组重排紫色杆菌脱氧前体成型位点特异性重组合成生物学酿酒酵母相关基因定量PCR 单倍体基因组构建验证发现生产

[发明专利]用于检测RNA水平基因融合的方法、电子设备和计算机存储介质-CN202010066733.0有效
发明人：王凯;陈惠 -专利权人：至本医疗科技（上海）有限公司;上海至本医学检验所有限公司
申请日： 2020-01-20 - 公布日： 2021-03-16 - 主分类号： G16B40/20 文献下载
摘要：本公开涉及一种用于检测RNA水平基因融合的方法、电子设备和计算机存储介质。该方法包括：接收全基因组比对信息和全转录组比对信息；针对成对失调读长进行聚类，以生成多个大簇；针对符合第一预定条件的大簇进行全基因组层面的基因注释，以便基于对应基因生成用于标识大簇的第一基因组合名称；基于全转录组比对信息，针对多个成对读长进行全转录组层面的基因注释，以便基于对应基因生成用于标识多个成对读长的第二基因组合名称；以及识别第一基因组合名称和第二基因组合名称所关联的相同的对应基因，以便将相同的对应基因确定为潜在的融合基因本公开有助于对假阳性的快速正确识别，能够明显降低基因融合检测结果的假阳性。
用于检测 rna 水平基因融合方法电子设备计算机存储介质

[发明专利]基于牛全基因组CRISPR-Cas9敲除文库、敲除细胞库及筛选目标基因的方法-CN202310322676.1在审
发明人：张文广;石彩霞;刘斌;戴伶俐;刘在霞;郭丽丽;鲍艳春 -专利权人：内蒙古农业大学;内蒙古犇牛科技有限公司
申请日： 2023-03-30 - 公布日： 2023-06-30 - 主分类号： C40B50/06 文献下载
摘要：本发明提供了基于牛全基因组CRISPR‑Cas9敲除文库、敲除细胞库及筛选目标基因的方法，涉及文库构建技术领域。本发明提供了一种牛全基因组编码基因CRISPR‑Cas9文库的构建方法，并基于构建得到的牛全基因组CRISPR/Cas9敲除文库，首次构建了MDBK牛肾上皮细胞全基因组敲除细胞库。本发明基于牛全基因组CRISPR/Cas9敲除文库策略，首次筛选并鉴定了9个与β羟丁酸(BHBA)作用相关的候选基因，可作为药物筛选、标记辅助管理的分子标记或制备基因编辑抗病动物模型的分子靶点。
基于基因组 crispr cas9 文库细胞筛选目标基因方法

[发明专利]泥东风螺线粒体全基因组序列及其扩增引物-CN201410089717.8在审
发明人：王晓清;熊钢;曾志南;秦溱;巫旗生;朱丹丽 -专利权人：湖南农业大学
申请日： 2014-03-12 - 公布日： 2014-07-02 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：泥东风螺线粒体全基因组序列及其扩增引物，它涉及一种线粒体全基因组序列及其扩增引物。本发明确定泥东风螺线粒体全基因组序列和其扩增引物，为泥东风螺的保护遗传学、进化遗传学及优良养殖品种的分子标记辅助选择提供物质基础。泥东风螺线粒体全基因组序列和基因结构如图1和表1所示。泥东风螺线粒体全基因组序列的扩增引物为14对。
东风螺线粒体全基因组序列及其扩增引物

[发明专利]一种识别基因编辑动物全基因组变异的方法-CN202210609250.X在审
发明人：杨化强;吴珍芳;何健宇;杨杰;赵鑫;蔡更元;张献伟 -专利权人：华南农业大学
申请日： 2022-05-31 - 公布日： 2022-07-29 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明公开了一种识别基因编辑动物全基因组变异的方法。通过分析供体细胞和基因编辑后新生克隆猪的全基因组，使用mutect2、strelka2和/或lofreq分析识别基因编辑造成的全基因组范围内的变异位点。本发明的分析方法用以分析全基因组范围内的所有突变，不以sgRNA同源性预测作为依据，能最大限度地检测所有存在的变异位点；以无偏的方式直接分析基因编辑猪与供体细胞的基因差异，不受遗传学影响，且操作方便，高效处理批量样品；适用于所有克隆动物全基因组比较分析，适用于任何工具和方法对供体细胞造成变异的检测，包括克隆操作自身对克隆动物造成变异的检测。
一种识别基因编辑动物基因组变异方法

[发明专利]一种全基因组高效基因区富集测序方法-CN201611199575.6有效
发明人：夏志强;邹枚伶;王文泉;张圣奎;冯素彬 -专利权人：中国热带农业科学院热带生物技术研究所
申请日： 2016-12-22 - 公布日： 2021-12-14 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明提供一种全基因组高效基因区富集测序方法，包括步骤：A）样品进行全基因组DNA的提取；B）全基因组mRNA的提取；C）全基因组mRNA反转录为cDNA；D）全基因组cDNA的碎片化；E）分批回收短序列片段酶切片段末端可增加barcode接头连接；H）DNA酶切片段装入环形质粒中，构建DNA文库；I）根据质粒两端序列分别设计两对引物为右引物；J）对H中构建好的DNA文库进行PCR扩增；K）扩增片段进行高通量测序，获得基因区富集序列本发明对于真核生物的复杂基因组，通过本方法构建的文库，可以极大的降低测序成本，同时得到更有效的基因组基因区数据。
一种基因组高效基因富集方法

[发明专利]基因捕获载体及建立全基因组突变胚胎干细胞库的方法-CN200810151947.7无效
发明人：马越;朱启超;武洲;钟伶桃;李明 -专利权人：天津彰科科技有限公司
申请日： 2008-09-28 - 公布日： 2009-06-03 - 主分类号： C12N15/63 文献下载
摘要：本发明属于生物技术领域，涉及一种可进行全基因组基因捕获的捕获载体组，并利用该捕获载体组建立突变胚胎干细胞库的方法。本发明中涉及的四个捕获载体可分别捕获细胞中正常表达基因、诱变和捕获正常细胞中不表达基因和胚胎致死基因，从而可以对全基因组基因进行捕获和基因突变，建立覆盖全基因组单基因突变的胚胎干细胞库。
基因捕获载体建立基因组突变胚胎干细胞方法

[发明专利]基于全外显子测序的非靶向区域基因型填充方法-CN202211684704.6在审
发明人：于晓光;杜政霖;邢世来 -专利权人：温州谱希医学检验实验室有限公司
申请日： 2022-12-27 - 公布日： 2023-04-04 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明公开了基于全外显子测序的非靶向区域基因型填充方法、系统、设备和计算机可读存储介质，方法其包括：获取目标队列的全外显子测序数据、参考全基因组测序数据集；对参考全基因组测序数据集中的位点进行过滤，输出参考全基因组测序数据集的SNP位点信息；基于SNP位点信息和全外显子测序数据，计算每个样本SNP位点的GL，并得到每个样本的GL；合并每个样本的GL，得到全部样本的GL；对参考全基因组测序数据集进行片段化分割处理得到基因组片段信息；基于全部样本的GL、SNP位点信息、基因组片段信息，利用机器学习算法对目标队列中单个样本非靶向区域的基因型进行估算，得到单个样本非靶向区域的基因型估算结果。
基于全外显子测序靶向区域基因型填充方法

[发明专利]一种针对超大基因组物种全基因组基因型鉴定的方法与应用-CN202211354321.2在审
发明人：马志岗;常玉晓;刘金栋 -专利权人：中国农业科学院农业基因组研究所
申请日： 2022-11-01 - 公布日： 2023-09-12 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明提供了一种针对超大基因组物种全基因组基因型鉴定的方法与应用。本发明针对超大基因组物种全基因组基因型鉴定的方法包括：对全基因组重测序文库进行限制性内切酶酶切；筛选掉酶切后片段长度小于目标片段长度的文库；对筛选后的文库进行二次限制性内切酶酶切；并以二次酶切后的文库为模板进行PCR扩增，富集目标文库；分选出不含酶切位点的目标长度的文库；进行低覆盖度测序；鉴定基因型。本发明在全基因组重测序文库的基础上，利用反向简化基因组测序和低覆盖度测序策略对超大基因组进行二次简化，约0.03～0.06×的数据即可满足超大基因组物种全基因组基因型鉴定的需要，效率高，成本低。
一种针对超大基因组物种基因型鉴定方法应用

[发明专利]一种磁性纳米材料及其在提取人全血基因组DNA中的应用-CN202010320582.7在审
发明人：陈毓;王旭;徐如嫣 -专利权人：杭州医学院
申请日： 2020-04-22 - 公布日： 2020-08-18 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种磁性纳米材料及其在提取人全血基因组DNA中的应用，发明的磁性纳米材料由零价纳米铁和氧化石墨烯经分散、包被和烘干制备而成，且本发明的一种磁性纳米材料从100μl人全血基因组中提取的基因组DNA浓度约为1μg，而常规的试剂盒法从100μl人全血基因组中提取的基因组DNA浓度约为0.5μg，本发明的磁性纳米材料提取的人全血基因组的浓度更高。将使用本发明制备的一种磁性纳米材料提供的人全血基因组中提取的基因组DNA进行PCR扩增实验，PCR扩增了线粒体细胞色素氧化酶COI基因约680bp的DNA片段。该新型磁性纳米材料提取的人全血基因组DNA不影响后续的PCR实验。
一种磁性纳米材料及其提取人全血基因组 dna 中的应用

[发明专利]一种蜘蛛线粒体COIII基因全序列扩增引物及鉴定方法-CN201410753854.7在审
发明人：王正亮;俞晓平;李超 -专利权人：中国计量学院
申请日： 2014-12-11 - 公布日： 2015-03-25 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本发明公开了一种蜘蛛的线粒体COIII基因全序列扩增引物，并利用其全序列测序信息快速鉴定蜘蛛种类的方法，包括蜘蛛基因组总DNA的提取，COIII基因全序列扩增引物的设计，PCR扩增，测序以及基于COIII基因全序列进行蜘蛛种类的快速鉴定。采用本发明的通用扩增引物可以快速高效地扩增多种蜘蛛的线粒体COIII基因的全序列，为蜘蛛种类的快速鉴定，种群多样性分析，种质资源保护利用等研究提供一种有力的工具，也为蜘蛛线粒体全基因组测序和不同分类阶元系统进化的分析研究奠定基础
一种蜘蛛线粒体 coiii 基因序列扩增引物鉴定方法

[发明专利]基于病毒全基因组序列的快速识别方法、系统及终端-CN202211099884.1在审
发明人：陆思彤;雷俊卿 -专利权人：上海飞瀑智能科技有限公司
申请日： 2022-09-07 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明的基于病毒全基因组序列的快速识别方法、系统及终端，通过获取下载的公开的病毒核苷酸数据，对所述病毒核苷酸数据进行预处理，以获得病毒识别训练样本数据；利用所述病毒识别训练样本数据训练神经网络模型，获得病毒全基因组序列识别模型；将待识别的核苷酸序列数据输入所述病毒全基因组序列识别模型，获得对应的病毒全基因组序列识别结果。本发明实现了对病毒全基因组序列的自动识别，并且保证了准确度，大大提高病毒全基因组序列识别效率。
基于病毒基因组序列快速识别方法系统终端

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