[发明专利]一种马铃薯M病毒基因组全序列及其应用有效
申请号: | 201611082352.1 | 申请日: | 2016-11-30 |
公开(公告)号: | CN106701799B | 公开(公告)日: | 2019-11-12 |
发明(设计)人: | 董家红;苏晓霞;吴阔;张仲凯;张丽珍 | 申请(专利权)人: | 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所 |
主分类号: | C12N15/40 | 分类号: | C12N15/40;C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11;C07K16/10 |
代理公司: | 昆明知道专利事务所(特殊普通合伙企业) 53116 | 代理人: | 姜开侠;姜开远 |
地址: | 650223*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | 本发明公开了一种马铃薯M病毒基因组全序列及其应用。核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示或其反义序列。应用为所述的核酸分子用于制备检测马铃薯M病毒的引物、探针或试剂盒,或用于制备抗马铃薯M病毒的抗体。发明人通过常规的病样总RNA的提取和利用多对简并引物进行RT‑PCR扩增、测定了侵染云南马铃薯的马铃薯M病毒基因组全序列。分析发现其基因组为线状、单链正义RNA,不含poly(A)全长8530nt,含6个开读框(ORF),具香石竹潜隐病毒属(Carlavirus)典型结构特征。其中病毒编码的223kDa、25kDa、12 kDa、7 kDa、34 kDa(外壳蛋白)、11kDa蛋白与其分离物的核苷酸同源性分别低于72%、75.1%、71.6%、59.1%、94.6%、97%,根据病毒株系分类标准,马铃薯M病毒云南马铃薯分离物属于一个远缘株系。 | ||
搜索关键词: | 马铃薯M病毒 基因组全序列 核酸分子 分离物 制备 马铃薯 应用 核苷酸同源性 核苷酸序列 病毒编码 病毒株系 典型结构 反义序列 分类标准 简并引物 潜隐病毒 外壳蛋白 正义RNA 常规的 基因组 试剂盒 总RNA 病样 单链 抗体 侵染 探针 线状 引物 远缘 株系 蛋白 检测 发现 分析 | ||
【主权项】:
1.一种分离的核酸分子,其特征在于所述核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示或其反义序列。
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- 潘兹书;吴锐;李玲;庞会宁;赵昱 - 武汉大学
- 2015-02-02 - 2017-10-24 - C12N15/40
- 本发明属兽用生物制品技术领域。具体涉及一种包含猪瘟疫苗C株感染性cDNA克隆及在该基因组cDNA的5′末端融合猪RNA聚合酶I启动子序列,在3′末端插入鼠RNA聚合酶I终止子序列的质粒pASPITI‑CS的构建。该质粒转染到猪源细胞PK15能直接产生猪瘟疫苗C株病毒。转化质粒pASPITI‑CS的大肠杆菌DH10B/pASPITI‑CS,Escherichia coli DH10B/pASPITI‑CS,送中国典型培养物保藏中心保藏,保藏号为CCTCC NOM2015062。这种猪瘟疫苗C株感染性cDNA克隆可用于遗传改造制备高效价猪瘟疫苗或构建基于猪瘟疫苗载体的双价疫苗。
- 携带绿色荧光蛋白基因的乙型脑炎病毒全长感染性克隆及制备方法和应用-201410618042.1
- 贾凡;朱续涛;徐富强 - 中国科学院武汉物理与数学研究所
- 2014-11-04 - 2017-06-16 - C12N15/40
- 本发明公开了一种携带绿色荧光蛋白基因的乙型脑炎病毒全长感染性克隆及制备方法和应用。一种携带绿色荧光蛋白基因的乙型脑炎病毒全长感染性克隆,其序列为SEQ ID NO.22所示。该全长感染性克隆成功制备出携带绿色荧光蛋白的重组乙型脑炎病毒。本发明成功获得的携带绿色荧光蛋白基因的重组乙型脑炎病毒,在神经环路标记、药物筛选平台的建立、药物抑制乙型脑炎病毒作用机制的分析、乙型脑炎病毒疫苗和诊断试剂的研发、动物模型的建立、病毒复制和致病机制的分析等方面具有广泛的应用价值。
- 以乙脑病毒减毒株为基因骨架的乙脑/登革嵌合病毒及其应用-201110140225.3
- 秦成峰;李玉华;李晓峰;于学东;杨会强;秦鄂德 - 中国人民解放军军事医学科学院微生物流行病研究所;成都生物制品研究所
- 2011-05-27 - 2017-05-24 - C12N15/40
- 本发明公开了以乙脑病毒减毒株为基因骨架的乙脑/登革嵌合病毒及其应用。本发明提供了一个DNA分子,是将乙脑病毒的基因组RNA对应的cDNA中的蛋白质A的编码基因替换为蛋白质B的编码基因得到的重组DNA;所述蛋白质A为由序列表中序列1所示的氨基酸序列组成的蛋白质;所述蛋白质B为由序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白质。本发明所提供的以乙脑病毒减毒株为基因骨架的乙脑/登革嵌合病毒为含有所述DNA分子的重组病毒。本发明所提供的乙脑/登革2型嵌合病毒作为登革疫苗用于预防登革病毒感染也具有良好的应用前景。
- 汉坦病毒S基因克隆、表达、单克隆抗体的制备方法及其应用-201710054599.0
- 蔡亮 - 蔡亮
- 2017-01-24 - 2017-05-10 - C12N15/40
- 一种汉坦病毒S基因克隆、表达、单克隆抗体制备方法,包括设计扩增汉坦病毒S基因完整开放阅读框特异性引物,扩增汉坦病毒S基因;将扩增的汉坦病毒S基因克隆到pGM-T载体,转化Ecoli.TOP10感受态细胞,得到TA克隆阳性质粒,克隆到pGEX-6p-2原核表达载体,得到重组质粒pGEX-6P-2/S;将重组质粒pGEX-6P-2/S转化Ecoli.BL21菌体中,经IPTG诱导表达,得到包涵体;包涵体经溶解与复性得到重组蛋白;重组蛋白免疫Balb/c小鼠;小鼠脾细胞与骨髓瘤细胞融合,选择性培养;阳性克隆筛选;单克隆抗体制备、亚型鉴定及效价检测。同时提供一种汉坦病毒S基因单克隆抗体应用。
- 棉蚜病毒全基因序列及其检测、分离和应用-201410489557.6
- 张帅;崔金杰;王春义;雒珺瑜;吕丽敏;李春花 - 中国农业科学院棉花研究所
- 2014-09-23 - 2017-01-04 - C12N15/40
- 本发明涉及一种分离的DNA分子或其功能片段,其特征在于所述分离的DNA分子的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。所述的分离的DNA分子及其功能片段可用于防治棉蚜虫害的用途。本发明还涉及一种棉蚜病毒,其特征在于所述棉蚜病毒的基因组序列如SEQ ID NO.1所示,以及产生所述棉蚜病毒的方法,和用于检测所述棉蚜病毒的引物、探针和试剂盒。棉蚜病毒基因信息的获得为开发棉蚜检测技术,棉蚜病毒应用技术的开发提供坚实的基础。对棉蚜病毒基因组的解析和相关检测方法的开发将能促进对该类病毒的研究和应用。
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