本发明涉及植物分子育种技术领域,特别涉及调控番茄果实可溶性固形物含量的基因组结构变异及相关产品和应用。该基因组结构变异为如下序列中的至少一种:SEQ ID NO:1和/或SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列;上述序列的互补序列、简并序列或同源序列;在严紧条件下与上述序列杂交的核苷酸序列或其互补序列;gDNA序列。上述基因组结构变异丰富和完善了现有控制番茄果实SSC相关的关键遗传变异信息,为SSC遗传分子调控机制等基础理论研究提供了新的证据或方向,同时为SSC等番茄果实品质、产量育种改良等应用研究提供了新的支撑。