本发明提供了一种FocSP1基因抑制剂在防治香蕉枯萎病中的应用,属于基因工程技术领域,FocSP1基因的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。该FocSP1基因是香蕉枯萎病菌中新的效应蛋白,且FocSP1基因在FocTR4侵染过程中被显著诱导,因此在FocTR4侵染香蕉过程中起着关键作用。结果表明,接种WT和ΔFocSP1‑C菌株的植株球茎呈现明显的褐变症状,接种5周后发病率达到100%,而接种ΔFocSP1菌株的植株在5周后,只有50%的植株出现较弱的疾病症状,说明ΔFocSP1菌株的毒力明显受损。本发明有助于阐明香蕉枯萎病菌的致病机理,为抗病分子育种及综合防控措施研究奠定基础。