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[发明专利]基于图隐式非线性扩散和相似性预测miRNA-疾病关联性方法、装置及设备-CN202310323968.7在审
发明人：黄辛迪;储爽;严承 -专利权人：湖南中医药大学
申请日： 2023-03-29 - 公布日： 2023-09-29 - 主分类号： G16H50/70 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于图隐式非线性扩散和相似性预测miRNA‑疾病关联性方法，包括如下步骤：构建miRNA‑疾病关联矩阵，利用miRNA和疾病的多源信息构建miRNA集成相似性矩阵和疾病集成相似性矩阵，并将miRNA集成相似性矩阵和疾病集成相似性矩阵分别与miRNA‑疾病关联矩阵拼接构成miRNA和疾病的初始特征矩阵；利用基于非线性扩散的图神经网络模型从miRNA‑疾病关联网络学习miRNA和疾病的嵌入特征；拼接miRNA和疾病的嵌入特征，并利用多层感知机预测miRNA和疾病之间的关联性。本发明提供的预测miRNA‑疾病关联性方法，能有效提高miRNA‑疾病关联预测的准确性。本发明还提供一种基于图隐式非线性扩散和相似性预测miRNA‑疾病关联性装置及设备。
基于图隐式非线性扩散相似性预测 mirna 疾病关联性方法装置设备

[发明专利]基于路径学习的图卷积神经网络预测miRNA-疾病关联性方法、装置及设备-CN202310323875.4在审
发明人：严承;储爽 -专利权人：湖南中医药大学
申请日： 2023-03-29 - 公布日： 2023-07-07 - 主分类号： G16H50/70 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于路径学习的图卷积神经网络预测miRNA‑疾病关联性方法，包括如下步骤：利用miRNA和疾病的多源信息构建miRNA集成相似性网络和疾病集成相似性网络，并利用miRNA‑疾病关联关系数据构建miRNA‑疾病关联网络；利用基于路径学习的图卷积神经网络模型分别从miRNA集成相似性网络，疾病集成相似性网络和miRNA‑疾病关联网络中学习miRNA以及疾病的不同嵌入特征；集成miRNA和疾病的不同嵌入特征，获得miRNA‑疾病对特征，利用多层感知机预测miRNA‑疾病对的关联性。本发明提供的预测miRNA‑疾病关联性方法，能有效提高miRNA‑疾病关联预测的准确性。本发明还提供一种基于路径学习的图卷积神经网络预测miRNA‑疾病关联性装置及设备。
基于路径学习图卷神经网络预测 mirna 疾病关联性方法装置设备

[发明专利]基于深度学习的关键miRNA识别方法及系统-CN202210780583.9在审
发明人：严承;张蕾;黄辛迪 -专利权人：湖南中医药大学
申请日： 2022-07-04 - 公布日： 2023-05-02 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明公开了基于深度学习的关键miRNA识别方法及系统，通过获取多个miRNA对应的pre‑miRNA剪切形成的核苷酸序列统计特征、结构特征以及深度学习特征，并计算每个深度学习特征对其对应的统计特征、结构特征的注意力分配特征，将计算得到的注意力分配特征及其对应的统计特征、结构特征进行拼接，得到综合特征，再基于所述综合特征构建训练集，并使用所述训练集训练构建好的分类预测模型，相比现有技术，本发明中的分类预测模型考虑了每个深度学习特征对其对应的统计特征、结构特征的注意力分配特征，能大大提高预测的准确性。
基于深度学习关键 mirna 识别方法系统

[发明专利]一种基于交叉融合卷积与可变形注意力Transformer的3D医学图像分割方法-CN202211526007.8在审
发明人：严承;丁长松;许志祥;梁杨;黄辛迪 -专利权人：湖南中医药大学
申请日： 2022-12-01 - 公布日： 2023-03-21 - 主分类号： G06T7/11 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于交叉融合卷积与可变形注意力Transformer的3D医学图像分割方法，包括以下步骤：S1，数据收集和预处理模块：获取3D医学图像数据，按照体素值截断的方法过滤不相关区域，对过滤后的3D医学图像数据进行标准化处理，然后划分训练集、验证集和测试集；S2，编码器模块：交叉使用卷积层和可变形注意力Transformer层来获取3D医学图像的低分辨率特征。利用残差卷积块中卷积层的卷积操作获取3D医学图像的局部特征，减小特征图分辨率，利用可变形注意力Transformer层的可变形多头自注意力对所述局部特征进行全局关系建模，在编码器中使用残差结构来增强特征信息，使用卷积注意力模块对关键分割区域进行关注；S3，解码器模块：使用反卷积操作对编码器提取到的低分辨率特征进行还原，对应于编码器每层次的特征图大小并作跳跃连接，逐步上采样到输入图像分辨率大小，得到带标记的3D医学图像。
一种基于交叉融合卷积变形注意力 transformer 医学图像分割方法

[发明专利]一种基于多头自注意力机制和序列的关键miRNA识别方法-CN202210838647.6在审
发明人：严承;黄辛迪;张蕾;刘佳俊 -专利权人：湖南中医药大学
申请日： 2022-07-18 - 公布日： 2022-10-18 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于多头自注意力机制和序列的关键miRNA识别方法，包括以下步骤：步骤S1，根据成熟miRNA都来源于pre‑miRNA剪接产生且pre‑miRNA所具有的茎环发夹结构的特点，基于pre‑miRNA、miRNA序列信息构建pre‑miRNA的核苷酸序列统计结构特征Fs；步骤S2，根据pre‑miRNA序列所具有的核苷酸序列的时序特征，构建基于BiLSTM的miRNA深度学习初始特征Fdo；步骤S3，基于多头自注意力机制和BiLSTM的miRNA深度学习初始特征Fdo获取miRNA多头自注意力特征Fdm；步骤S4，根据pre‑miRNA序列中的核苷酸子序列对核苷酸序列统计结构特征Fs的重要性，计算基于权重注意力机制的miRNA深度学习最终特征表示Fd；步骤S5，将获取的miRNA核苷酸序列统计结构特征Fs和miRNA深度学习最终特征表示Fd进行拼接得到最终的miRNA特征Ff并输入到MLP模型，基于已有的关键miRNA样本基础数据集进行关键miRNA识别。
一种基于多头注意力机制序列关键 mirna 识别方法

[发明专利]一种基于网络爬虫和多模态特征的成分-靶点相互作用预测方法-CN202210703362.1在审
发明人：丁长松;黄群富;严承;李力松;黄辛迪;梁杨;刘佳俊;程宁 -专利权人：湖南中医药大学
申请日： 2022-06-21 - 公布日： 2022-08-26 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于网络爬虫和多模态特征的成分‑靶点相互作用预测方法，包括以下步骤：S1，数据收集模块：利用网络爬虫自动获取中药的成分和靶点相关数据；S2，数据预处理模块：融合成分和靶点相关数据，构建成分表、靶点表、成分‑靶点关系表；S3，多模态特征提取模块：分别将成分和靶点的描述符特征、序列相似性特征、网络拓扑特征进行跨模态融合，获取成分和靶点特征；S4，可靠负样本构建模块：利用PU学习和已知的成分‑靶点相互作用关系构建可靠负样本集；S5，分类模型构建模块：成分‑靶点特征结合正负样本集训练二分类模型。
一种基于网络爬虫多模态特征成分相互作用预测方法

[发明专利]基于相似性的病毒-受体相互作用关系预测方法和装置-CN201911108401.8有效
发明人：王建新;严承;李洪东 -专利权人：中南大学
申请日： 2019-11-13 - 公布日： 2022-08-16 - 主分类号： G16B35/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于相似性的病毒‑受体相互作用关系预测方法和装置，所述方法首先基于已知的病毒‑受体相互作用关系数据分别构建病毒和受体的高斯核相似性矩阵；利用受体的序列信息构建受体的序列相似性矩阵；并基于受体序列相似性矩阵和高斯核相似性矩阵集成最终的受体相似性。然后根据邻接信息对不存在相互作用关系的病毒和受体的相互作用关系进行初始化处理。最后利用拉普拉斯正则化最小二乘法来计算病毒‑受体对的相互作用关系分数。本发明能够对病毒‑受体相互作用关系进行有效的预测。
基于相似性病毒受体相互作用关系预测方法装置

[发明专利]一种基于相似性和张量分解的微生物-疾病关联关系预测方法-CN202210206471.2在审
发明人：严承;黄辛迪;刘佳俊 -专利权人：湖南中医药大学
申请日： 2022-03-03 - 公布日： 2022-06-03 - 主分类号： G16H70/60 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于相似性和张量分解的微生物‑疾病关联关系预测方法，包括以下步骤：步骤S1，构建疾病功能相似性矩阵Dfunsim和疾病表征相似性矩阵Dsymsim，并对所述疾病功能相似性矩阵Dfunsim和所述疾病表征相似性矩阵Dsymsim进行均值集成得到最终的疾病相似性矩阵Sd；步骤S2，根据微生物的序列信息得到微生物的序列相似性Sm；步骤S3，利用已知的微生物‑疾病关联关系和关联类型构建一个微生物疾病关联的三维二进制关联矩阵；步骤S4，利用微生物相似性、疾病相似性和微生物疾病关联的三维二进制关联矩阵采用张量分解的模型对微生物‑疾病的深层次关联关系进行预测。
一种基于相似性张量分解微生物疾病关联关系预测方法

[发明专利]一种基于属性动态选择与灰度关联分析的缺失值填补方法-CN202110454133.6在审
发明人：朱粤婕;王建新;严承;张志 -专利权人：中南大学
申请日： 2021-04-26 - 公布日： 2021-07-23 - 主分类号： G06K9/62 文献下载
摘要：本发明公开一种基于属性动态选择与灰度关联分析的缺失值填补方法，所述方法包括以下步骤：1.对包含缺失值的原始数据集基于朴素方法进行初始填补；2.执行属性动态选择，对每个待填补属性筛选出相关性较大的属性用于后续计算；3.执行K近邻距离计算，将高斯核函数优化后的属性间关联系数作为相关权重，得到待填补样本与其他样本间的灰度关联距离，由此距离排序获得最相近的K个邻居；4.根据待填补属性，对K个邻居的对应属性值进行加权计算，将其作为下一次填补初始值并继续迭代，直到两次填补结果收敛于某一阈值，将最后一次填补值作为最终填补值保存。本发明可实现数据处理中缺失值填补，具有适用性广，准确度高等优点。
一种基于属性动态选择灰度关联分析缺失填补方法

[发明专利]一种CRISPR诱导RNA文库设计方法-CN201910712069.X有效
发明人：王建新;李涛;王劭恺;严承;李敏 -专利权人：中南大学
申请日： 2019-08-02 - 公布日： 2021-04-09 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种CRISPR诱导RNA文库设计方法，包括以下步骤：步骤一、根据参考基因组生成kmer集合；步骤二、将kmer切分成kmer1和kmer2两部分，将对应的kmer1相同的kmer2分成一个类别；再将同一类别的kmer2构建到同一个检索树中，各检索树的键序列为其中kmer2对应的kmer1；步骤三、并行获取诱导RNA及其脱靶序列，该步骤中，在比对一个kmer与检索树的键序列和其中的kme2连接成的kmer时，首先将该kmer的kmer1与检索树的键序列比对，看是否满足设定条件，满足则继续比对kmer的kmer2与检索树中的kmer2。本发明提高了计算效率。
一种 crispr 诱导 rna 文库设计方法

[发明专利]一种基于相似性和低秩矩阵填充的微生物-疾病关系预测方法-CN201910173280.9有效
发明人：王建新;严承;张雅妍;朱粤婕 -专利权人：中南大学
申请日： 2019-03-07 - 公布日： 2020-12-08 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于相似性和低秩矩阵填充的微生物‑疾病关系预测方法，首先通过疾病高斯核相似性、疾病表征相似性和疾病功能相似性均值集成方式得到最终的疾病相似性。利用已知的微生物‑疾病关联关系计算微生物的高斯核相似性，再根据微生物的寄生组织信息对高斯核相似性进行调节处理，得到最终的微生物相似性。最终通过已知微生物‑疾病关联关系将微生物相似性网络和疾病相似性网络进行连接，构建一个微生物和疾病的异构网络。根据此异构网络的关联关系矩阵，采用低秩矩阵填充的方法来进行微生物‑疾病关联关系的预测，并在填充之前增加了关联关系初始化处理过程提高了其预测精度。本发明能够有效预测微生物‑疾病关联关系。
一种基于相似性矩阵填充微生物疾病关系预测方法

[发明专利]一种基于多元信息集成和最小二乘法的药物关系预测方法-CN201810472698.5有效
发明人：王建新;严承;李敏;张雅妍;王劭恺 -专利权人：中南大学
申请日： 2018-05-17 - 公布日： 2020-10-23 - 主分类号： G16C20/50 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于多元信息集成和最小二乘法的药物关系预测方法，包括步骤1：获取待研究的药物集合的药物关系矩阵；步骤2：计算每个药物与其余药物的高斯核相似性；步骤3：根据药物集合中所有药物的特征信息采用余弦角相似性方法计算每个药物与其余药物的特征相似性；特征信息包括化学信息、生物信息以及表征信息；步骤4：计算每两个药物之间的高斯核相似性和特征相似性的均值得到每两个药物之间的药物相似性，并基于每两个药物之间的药物相似性构成出药物集合的药物相似性矩阵；步骤5：基于药物相似性矩阵以及药物关系矩阵采用最小二乘法进行药物对的关联关系分数计算得到药物关系预测矩阵。
一种基于多元信息集成最小二乘法药物关系预测方法

[发明专利]一种环状RNA与疾病的关联关系预测方法-CN201810652133.5有效
发明人：王建新;严承;李敏;张雅妍 -专利权人：中南大学
申请日： 2018-06-22 - 公布日： 2020-08-07 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种环状RNA与疾病的关联关系预测方法，包括步骤1：构建环状RNA高斯核相似性第一矩阵以及疾病高斯核相似性第一矩阵；步骤2：基于递减权重方法计算全新环状RNA与每种疾病、全新疾病与每种环状RNA的关系初始值；步骤3：再构建环状RNA高斯核相似性第二矩阵以及疾病高斯核相似性第二矩阵；步骤4：构建环状RNA相似性矩阵、疾病相似性矩阵；步骤5：采用克罗内克积最小二乘法计算出环状RNA与疾病关联分数矩阵，再获取全新环状RNA与所有疾病的关联分数以及全新疾病与所有环状RNA的关联分数。本发明通过计算预测模型来对环状RNA疾病的关联关系进行预测，填补当前没有预测环状RNA与疾病关系的计算模型的空缺。
一种环状 rna 疾病关联关系预测方法

[发明专利]云终端升级处理方法及装置-CN201310596783.X有效
发明人：朱国龙;胡泊;严承 -专利权人：南京中兴新软件有限责任公司
申请日： 2013-11-22 - 公布日： 2020-03-27 - 主分类号： H04L29/08 文献下载
摘要：本发明提供了一种云终端升级处理方法及装置，该方法包括：组播服务器接收到网管服务器发送的对至少两个云终端进行升级的组播升级参数及升级镜像文件信息；组播服务器依据组播升级参数以及升级镜像文件信息确定对至少两个云终端进行组播升级的端口信息和镜像分区信息；组播服务器依据确定的端口信息和镜像分区信息对至少两个云终端进行组播升级，通过本发明，解决了在相关技术中，存在升级速度慢，升级效率低的问题，进而达到了提升升级速度，升级效率的效果。
终端升级处理方法装置

[发明专利]资源内容发布处理方法、装置及系统-CN201310366863.6有效
发明人：严承;周志军;彭刚;梅世飞 -专利权人：中兴通讯股份有限公司
申请日： 2013-08-21 - 公布日： 2020-02-14 - 主分类号： H04L29/08 文献下载
摘要：本发明提供了一种资源内容发布处理方法、装置及系统，该方法包括：确定用于在一个或多个阅读业务平台同步发布所述资源内容时对应的一个或多个发布规则配置信息；根据所述一个或多个发布规则配置信息在所述一个或多个阅读业务平台同步发布所述资源内容。通过本发明，解决了相关技术中存在的在各个业务平台上单独发布资源内容时，不仅发布者工作量大，准确度低，而且用户也不能在第一时间分享发布的内容的问题，进而达到了提高发布者发布内容的准确率，极大的降低发布者的工作量，也使得用户能够第一时间在不同的阅读平台上阅读到相同的更新内容，提高了用户的阅读体验的效果。
资源内容发布处理方法装置系统

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