本发明公开了玉米干旱响应基因miR528b启动子的Indel标记及其应用，涉及分子遗传学领域。本发明提供了一种玉米干旱响应基因miR528b启动子的Indel标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。本发明还提供了一种扩增上述的Indel标记的引物对，包括如SEQ ID NO.6所示的上游引物和如SEQ ID NO.7所示的下游引物。本发明提供的Indel标记在干旱条件下与玉米材料的存活率显著相关，该Indel标记可以增强玉米材料的耐旱性，进而提高干旱后玉米植株存活率。本发明的Indel标记可用于玉米分子辅助育种和优质种质资源鉴定，加速玉米耐旱材料的创制和新品种选育进程。
本发明公开了一种玉米基因ZmPOP10的Indel分子标记及其应用，属于分子遗传学领域。所述Indel分子标记包括Indel‑1和Indel‑2，所述Indel‑1的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示，所述Indel‑2的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示。本发明还提供了一种扩增上述Indel分子标记的引物组合，包括如SEQ ID NO.1‑2所示的引物对和如SEQ ID NO.3‑4所示的引物对。本发明提供的Indel分子标记在干旱条件与正常浇水下均与玉米材料的根尖数显著相关，可用于玉米分子辅助育种和优质种质资源鉴定，加速玉米耐旱材料的创制和新品种选育进程。
