本发明提供了一种检测乳腺癌复发转移基因HER2扩增的引物探针及其应用,所述引物探针序列分别为目的基因上游引物序列FZD2‑F:SEQ ID No:1 5’‑GTGTGGCAGTTCAGCCCTAT‑3’、目的基因下游引物序列FZD2‑R:SEQ ID No:2 5’‑AATGTGTGCCACGAAACTGC‑3’、目的基因探针序列FZD2‑P:SEQ ID No:3 5’‑FAM‑GGCTGATGGCTCGCGCTGGGCA‑BHQ1‑3’、内参基因上游引物序列EFTUD2‑F:SEQ ID No:4 5’‑CTCAAAGTGCGGGGACTGAT‑3’、内参基因下游引物序列EFTUD2‑R:SEQ ID No:5 5’‑GGCATCAGGGTGACTCCAAA‑3’、内参基因探针序列EFTUD2‑P:SEQ ID No:6 5’‑HEX‑AGCCTGCTTCCTGGGAATGTGCTGCT‑BHQ1‑3’。上述引物探针用于数字PCR试剂盒,试剂盒能快速、特异、灵敏地检测HER2基因扩增。
本发明提供了一种检测神经母细胞瘤复发转移基因WNT2扩增的引物探针及其应用,所述引物探针序列分别目的基因上游引物序列WNT2‑F:SEQ ID No:1 5’‑GCGTGGACTTACCACCATGA‑3’、目的基因下游引物序列WNT2‑R SEQ ID No:2 5’‑CTCTCGGTGGAATCTGGCTC‑3’、目的基因探针序列WNT2‑P:SEQ ID No:3 5’‑FAM‑TGACCTCGGGGGTGAGCCAGGTCA‑BHQ1‑3’、内参基因上游引物序列EFTUD2‑F:SEQ ID No:4 5’‑CTCAAAGTGCGGGGACTGAT‑3’、内参基因下游引物序列EFTUD2‑R:SEQ ID No:5 5’‑GGCATCAGGGTGACTCCAAA‑3’、内参基因探针序列EFTUD2‑P:SEQ ID No:6 5’‑HEX‑AGCCTGCTTCCTGGGAATGTGCTGCT‑BHQ1‑3’。本发明试剂盒能快速、特异、灵敏地检测WNT2基因扩增,该试剂盒一步法扩增方法简单、成本低廉,非常适用于肿瘤组织、循环肿瘤细胞、循环肿瘤DNA等各种样本中的基因拷贝数变异情况,适合大范围推广应用。
本发明提供了一种检测神经母细胞瘤复发转移基因FZD2扩增的引物探针及其应用,所述引物探针序列分别为目的基因上游引物序列FZD2‑F:SEQ ID No:1 5’‑TTTCTGTCGGGCTGCTACAC‑3’、目的基因下游引物序列FZD2‑R:SEQ ID No:2 5’‑GTAACCGTCCTCGGAGAAGC‑3’、目的基因探针序列FZD2‑P:SEQ ID No:3 5’‑FAM‑GCTCCAGGAGCGCGTGGTGTGCA‑BHQ1‑3’、内参基因上游引物序列EFTUD2‑F:SEQ ID No:4 5’‑CTCAAAGTGCGGGGACTGAT‑3’、内参基因下游引物序列EFTUD2‑R:SEQ ID No:5 5’‑GGCATCAGGGTGACTCCAAA‑3’、内参基因探针序列EFTUD2‑P:SEQ ID No:6 5’‑HEX‑AGCCTGCTTCCTGGGAATGTGCTGCT‑BHQ1‑3’。本发明试剂盒能快速、特异、灵敏地检测FZD2基因扩增,该试剂盒一步法扩增方法简单、成本低廉,非常适用于肿瘤组织、循环肿瘤细胞、循环肿瘤DNA等各种样本中的基因拷贝数变异情况,适合大范围推广应用。
本发明公开了一种用于检测HER2拷贝数变异的引物探针、数字PCR试剂盒及检测方法,包含序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的HER2基因检测引物对和序列如SEQ ID NO:3所示的MGB探针,序列如SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5所示的内参基因EFTUD2检测引物对和序列如SEQ ID NO:6所示的内参基因MGB探针。本发明仅通过一组HER2引物以及内参基因引物探针就能达到精准判读HER2拷贝数是否发生变异,具有简便易行,高灵敏度和稳定性、可重复的特点。