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[发明专利]确定待测样本类型的方法及系统-CN201880094581.6在审
发明人：梁瀚;李甫强;吴逵;赵鑫;乔斯坦;周鑫兰 -专利权人：深圳华大生命科学研究院
申请日： 2018-06-11 - 公布日： 2021-04-30 - 主分类号： C12Q1/6827 文献下载
摘要：本发明提出了一种针对候选归类区域确定有效错配类型的方法。所述候选归类区域用于区分多种样本类型，该方法包括：(1)针对已知样本类型的多个样本，分别构建所述多个样本各自相应的多个第一错配集合，所述错配集合分别由至少一个错配信息构成；(2)针对所述多个样本的全部所述多个第一错配集合中的每一个所述错配信息，分别确定各所述错配信息的区分度；(3)基于所述各所述错配信息的区分度，确定所述有效错配类型。
确定样本类型方法系统

[发明专利]去除错配DNA的方法、装置及装置的制备方法和试剂盒-CN202211552220.6在审
发明人：洪泂;贾丽婷;王冬梅;江会锋 -专利权人：中国科学技术大学;中国科学院天津工业生物技术研究所
申请日： 2022-12-05 - 公布日： 2023-03-21 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种去除DNA合成中错配DNA的方法、装置及装置的制备方法和试剂盒，该除去合成的DNA样品中错配DNA的方法，包括：通过在DNA样品中添加错配融合蛋白，使错配融合蛋白与DNA样品中的错配DNA结合；使用包括无定形纤维素的离心柱去除错配DNA与错配融合蛋白；其中，错配融合蛋白为将纤维素结合域融合蛋白和错配结合蛋白进行融合表达后得到的。本发明提供的去除DNA合成中错配DNA的方法，纠错过程快捷，使用错配结合蛋白少。
除错 dna 方法装置制备试剂盒

[发明专利]一种高灵敏度高特异性错配核酸序列的设计方法-CN201810963038.7在审
发明人：戴宗;徐梦菲;陈俊;王洋;邹小勇 -专利权人：中山大学
申请日： 2018-08-22 - 公布日： 2019-01-04 - 主分类号： C12Q1/6811 文献下载
摘要：本发明公开了一种高灵敏度高特异性错配核酸序列的设计方法，通过计算错配序列和目标序列和同源干扰序列的ΔMFE值，确定候选错配核酸序列。本发明的方法，避免了错配核酸序列设计依赖于经验，大大减少了错配核酸序列，特别是错配引物的设计工作量，可以快速从大量错配核酸序列中获得少量的候选核酸序列，有利于从少量候选核酸序列中确定最佳的核酸序列。基于本方法设计的错配引物，在目标序列浓度低时，依然可以与目标序列保持较高的亲和力，同时与干扰同源序列的亲和力较差，有效提高了目标序列的扩增灵敏度，可以更好地用于高度同源核酸序列，特别是miRNA的扩增。
核酸序列错配目标序列候选核酸序列错配引物高灵敏度扩增亲和力同源核酸序列错配序列同源序列灵敏度工作量

[发明专利]检测DNA聚合酶对测序过程中形成的错配碱基的容错能力的方法和试剂-CN201611263067.X有效
发明人：李卓坤;杨晋;陈奥;徐崇钧;章文蔚 -专利权人：深圳华大智造科技股份有限公司
申请日： 2016-12-30 - 公布日： 2021-10-08 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明公开了一种检测DNA聚合酶对测序过程中形成的错配碱基的容错能力的方法和试剂，所述方法包括：提供至少一装载有核酸的芯片和至少一错配引物，该错配引物在其3’末位与核酸错配，其它部分中至少有部分碱基与核酸正确配对，以便错配引物能够以核酸为模板进行延伸；提供至少一待测DNA聚合酶和至少一带荧光的dNTP，带荧光的dNTP与3’末位对应在核酸上的碱基的下一个碱基互补；将装载有核酸的芯片、错配引物、待测DNA聚合酶和带荧光的dNTP在适于引物延伸的条件下进行孵育，并采集孵育产物的荧光信号，根据荧光信号计算待测DNA聚合酶对测序过程中形成的错配碱基的容错能力。本发明的方法能够检测错配已经产生时，DNA聚合酶对错配后的下一位碱基的聚合能力。
检测 dna 聚合过程形成碱基容错能力方法试剂

[发明专利]错配sgRNA选取方法及其在DNA特定位点上CRISPR系统中的应用-CN202310397466.9在审
发明人：郭燕;胡维欣;荣誉;董珊珊;杨铁林 -专利权人：西安交通大学
申请日： 2023-04-13 - 公布日： 2023-09-22 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明涉及一种错配sgRNA选取方法及其在DNA特定位点上CRISPR系统中的应用，涉及基因编辑领域，该方法包括：搭建sgRNA脱靶错配活性预测模型、给定DNA位点上错配sgRNA活性的预测与挑选、挑选出的错配本发明通过分析sgRNA‑DNA序列对在不同匹配情况下错配sgRNA活性的改变规律，建立基于深度学习模型的sgRNA错配活性预测模型，并对给定DNA位点上与之结合的错配sgRNA进行活性预测与脱靶效应分析本发明将与目标DNA位点有错配关系的sgRNA列入备选，扩大了sgRNA设计的可能性，能够有效降低该位点上CRISPR系统的脱靶效应，适用于所有需要CRISPR/Cas9系统降低脱靶效应的情形，例如基因敲除
错配 sgrna 选取方法及其 dna 定位 crispr 系统中的应用

[发明专利]采用d8正方平面金属配合物靶向错配DNA的方法-CN201680048649.8有效
发明人：支志明;冯善琪;邹滔滔 -专利权人：香港大学
申请日： 2016-06-22 - 公布日： 2020-11-06 - 主分类号： G01N21/63 文献下载
摘要：公开了采用含有三齿π‑共轭配体和N‑杂环卡宾或双膦配体的辅助配体的d8正方平面金属配合物靶向错配DNA的方法。通过监测金属配合物对错配DNA和配对DNA的发射增强的差异，或当配合物结合于错配DNA时自等温滴定量热法(ITC)的逐渐热放出，或加入配合物后错配DNA的解链温度的显著增加，可揭示错配DNA的靶向。
采用 d8 正方平面金属配合靶向 dna 方法

[发明专利]用于确定阳性断点的方法、计算设备和计算机存储介质-CN202210073366.6在审
发明人：王凯;陈惠 -专利权人：至本医疗科技（上海）有限公司;上海至本医学检验所有限公司
申请日： 2022-01-21 - 公布日： 2022-05-13 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：该方法包括：获取跨同一断点的、一端比对上第一基因组并且另一端未比对上第二基因组的所有支持读长，以便在支持读长中确定符合错配序列一致性条件的读长；记录符合预定错配序列一致性条件的读长中的每一读长的错配序列长度，以便确定与预定错配序列相匹配的读长，预定错配序列是基于所记录的错配序列长度而确定的；基于错配序列长度，针对与预定错配序列相匹配的读长进行排序，以便计算关于同一断点的斜率；以及基于所计算的斜率和与预定错配序列相匹配的读长的数量
用于确定阳性断点方法计算设备计算机存储介质

[发明专利]耐热的错配核酸内切酶变体-CN202180021831.5在审
发明人：松本裕之;上森隆司;白井刚;石野良纯;石野园子 -专利权人：宝生物工程株式会社;学校法人关西文理综合学园;国立大学法人九州大学
申请日： 2021-03-18 - 公布日： 2022-10-18 - 主分类号： C12N15/55 文献下载
摘要：本发明提供了GG‑特异性错配核酸内切酶变体、TT‑特异性错配核酸内切酶变体，和GT/TG‑特异性错配核酸内切酶变体。本发明还提供了使用所述变体的错配特异性切割反应、使用错配核酸酶去除核酸扩增反应中的错误的方法、在核酸扩增反应期间抑制具有特定碱基序列的核酸扩增的方法，以及使用所述抑制方法检测具有单碱基多态性突变的核酸的方法
耐热核酸内切酶变体

[发明专利]用于鉴定导致测试样品中目的表型的致病突变的方法或系统-CN201980054436.X有效
发明人： C·钱皮恩;L·多兰 -专利权人：牛津大学科技创新有限公司
申请日： 2019-09-05 - 公布日： 2023-02-17 - 主分类号： A01H1/04 文献下载
摘要：一种用于鉴定与非维管植物中的目的表型相关的突变的方法，其中所述方法包含(a)将参照DNA序列的DNA序列进行比对并且鉴定所述两个序列之间的第一组序列错配；其中测试样品来自诱变的非维管植物；(b)将至少一个比较样品的DNA序列与所述参照DNA序列进行比对并且鉴定所述两个序列之间的第二组序列错配；(c)相对于所述第二组错配过滤所述第一组错配以鉴定所述第一组错配所特有的错配子集，其中所述错配子集是致病突变的候选突变；其中所述测试样品来自表现出所述目的表型的非维管植物并且其中所述至少一个比较样品来自不表现出出所述目的表型的相同属的独立非维管植物另外，一种用于鉴定与非维管植物中目的表型相关的突变的方法，其中所述方法包含a)将参照DNA序列的DNA序列进行比对并且鉴定所述两个序列之间的第一组序列错配；其中所述测试样品来自诱变的非维管植物；(b)将至少一个比较样品的DNA序列与所述参照DNA序列进行比对并且鉴定所述两个序列之间的第二组序列错配；(c)相对于所述第二组序列错配过滤所述第一组错配以鉴定所述第一组序列错配和所述第二组序列错配共有的错配子集，其中所述测试样品和所述比较样品来自表现出所述目的表型的独立非维管植物并且其中所述独立非维管植物是相同属
用于鉴定导致测试样品目的表型致病突变方法系统

[发明专利]通过已出生孩子对胎儿进行亲子鉴定的方法-CN202211407920.6在审
发明人：熊茜;黄奎匀;杨功达;曾丰波 -专利权人：武汉蓝沙医学检验实验室有限公司;上海蓝沙生物科技有限公司
申请日： 2022-11-10 - 公布日： 2023-05-16 - 主分类号： C12Q1/6876 文献下载
摘要：DNA样本的二态性位点进行测序分别得到DNA数据Z和S；获取样本S中含有胎儿信号的分型位点集X(S)，获取样本Z的位点集Y(Z)；统计位点集X(S)∩Y(Z)中的位点作为有效位点，统计有效位点中Z与S的错配位点，根据错配位点与有效位点计算胎儿与已出生孩子的错配率；判断错配率是否符合模拟计算得到的异父同母关系下的错配率分布M1或同父同母关系下的错配率分布M2；若错配率符合M1，则判断胎儿与已出生孩子的生父排除亲子关系；若错配率符合M2，则判断胎儿与已出生孩子的生父为亲子关系。
通过出生孩子胎儿进行亲子鉴定方法

[发明专利]一种基于区域邻近点搜索的密集匹配错配点处理方法-CN202110250100.X有效
发明人：吴春;郑振华;宋洁;张翼峰;孙佳;黄文 -专利权人：武汉市土地利用和城市空间规划研究中心
申请日： 2021-03-08 - 公布日： 2022-11-18 - 主分类号： G06T7/30 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于区域邻近点搜索的密集匹配错配点处理方法，包括如下步骤：步骤1，完成初始双目立体密集匹配，通过“左、右一致性检查”识别待匹配基准影像和参考影像上的错配点；步骤2，对待匹配基准影像进行边缘检测并标记边缘点；步骤3，针对待匹配基准影像上的每一个错配点，先后按照通过该错配点的特定角度的直线两端的方向上搜索对应的“最近边缘点”，若搜索成功则终止后续角度的搜索，并计算错配点到2个对应边缘像素点的距离值d；步骤4，在“最近边缘点”覆盖的范围内，错配点沿着d值较大的边缘点方向搜索对应最近成功匹配点，并将视差值赋于该错配点。与大量研究文献中“改进密集匹配算法”的间接处理方法不同，本发明通过区域邻近点搜索进一步识别、区分错误匹配点，能够更加有效减少视差图中的最后错配点数量。
一种基于区域邻近搜索密集匹配错配点处理方法

[发明专利]利用热稳定性错配内切核酸酶的方法-CN201580048826.8在审
发明人：上森隆司;石野良纯;相良武宏;石野园子;山上健;白井刚 -专利权人：宝生物工程株式会社;国立大学法人九州大学;学校法人关西文理综合学园
申请日： 2015-09-09 - 公布日： 2017-08-01 - 主分类号： C12N15/09 文献下载
摘要：本发明涉及具有识别错配并切割错配的错配内切核酸酶活性的多肽；使用所述多肽的错配特异性切割反应；使用所述多肽去除核酸扩增反应中的错误的方法；在核酸扩增反应期间抑制包含特定核苷酸序列的核酸的扩增的方法；以及利用该抑制方法检测具有单核苷酸多态性突变的核酸的方法
利用热稳定性错配内切核酸酶方法

[发明专利]界面关系判断方法及装置-CN202010723127.1在审
发明人：张志波;温丽涛 -专利权人：广东省材料与加工研究所
申请日： 2020-07-24 - 公布日： 2020-11-27 - 主分类号： G06F16/21 文献下载
摘要：本发明提供一种界面关系判断方法及装置，该方法包括：获取两相晶体结构；根据两相晶体结构选取两相晶面；根据两相晶面计算界面错配度；根据界面错配度判断界面关系。本发明通过获取两相晶体结构，选取两相晶面，根据错配度计算公式计算错配度，从而判断两相界面关系。
界面关系判断方法装置

[发明专利]营养组合物在制备恢复错配修复基因损伤药物中的应用-CN201010129033.8有效
发明人：吴文国;李恕;董锋 -专利权人：珍奥集团股份有限公司
申请日： 2010-03-22 - 公布日： 2010-07-21 - 主分类号： A61K36/87 文献下载
摘要：本发明公开一种营养组合物在制备恢复错配修复基因损伤药物中的应用，本发明作为药物可为错配修复基因损伤的恢复提供基本营养条件，即增强错配修复蛋白的活性，从而达到恢复错配修复基因损伤的目的。
营养组合制备恢复修复基因损伤药物中的应用

[发明专利]一种DNA银纳米簇检测单碱基错配位置的方法及其试剂盒-CN201610016177.X有效
发明人：张新荣;刘杰;张四纯 -专利权人：清华大学
申请日： 2016-01-11 - 公布日： 2019-10-25 - 主分类号： C12Q1/6827 文献下载
摘要：本发明公开了一种DNA银纳米团簇检测单碱基错配位置的方法及其试剂盒。该方法包括如下步骤：(1)按照完全匹配的目标DNA设计合成一系列不同错配位置的目标DNA；(2)将DNA银纳米簇探针Ⅰ、DNA银纳米簇探针Ⅱ与不同错配位置的目标DNA杂交，激发测量得到的不同杂交体系的荧光强度，建立错配位置和荧光强度的工作曲线；(3)将DNA银纳米簇探针Ⅰ、DNA银纳米簇探针Ⅱ与待测目标DNA杂交，激发测量得到的杂交体系的荧光强度，根据工作曲线即可得到待测目标DNA的错配位置。本发明整个过程不涉及酶促反应，一次杂交反应即可，步骤简单，快速方便，价格低廉；相比较与传统的DNA生物传感器，本发明不仅能确定是否存在单碱基错配，而且还能精确检测出单碱基错配的位置。
一种 dna 纳米检测碱基位置方法及其试剂盒

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