本发明提供了一种扬子鳄微卫星多态位点、鉴定方法及特异引物序列，及在此基础上筛选出的13对特异引物序列，其序列如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.26所示。鉴定扬子鳄微卫星多态位点的方法利用扬子鳄基因组筛选出微卫星位点及高质量引物；将扬子鳄基因组测序read数据比对到扬子鳄参考基因组鉴定INDEL，根据INDEL鉴定结果和微卫星筛选结果，筛选出具有多态性的微卫星位点利用这套微卫星引物，可经济、快速、正确地用于扬子鳄的亲子鉴定，有助于对扬子鳄种群进行家族谱系重建和信息完善，从而制定科学的管理方案指导扬子鳄的后期保护工作。
本发明涉及一对用于扩增扬子鳄抗细菌潜力检测的Ⅱ类主要组织相容性复合物基因的单位点特异性引物及分型方法，引物的具体序列如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.2所示。本发明的扩增引物，在扬子鳄种群内具有稳定的单位点特异扩增能力，其扩增得到产物可以通过后续的单链构象多态性检测(single strand conformation polymorphism,SSCP)实验对不同的个体进行基因分型，实现对种群中扬子鳄个体Ⅱ类MHC基因多态性的评估，检测其抵抗细菌性疾病的潜力，为扬子鳄保护工作中的新种群奠基者选择、野化放归个体选择以及人工配对等工作提供重要参考。
本发明涉及用于一套扩增扬子鳄抗病毒潜力检测的Ⅰ类主要组织相容性复合物基因序列的单位点特异性引物及分型方法，引物的具体序列如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.8所示。本发明的扩增引物，在扬子鳄种群内具有稳定的单位点特异扩增能力，其扩增得到产物可以通过后续的单链构象多态性检测(single strand conformation polymorphism,SSCP)实验对不同的个体进行基因分型，实现对种群中扬子鳄个体Ⅰ类MHC基因多态性的评估，检测其抵抗病毒性疾病的潜力，为扬子鳄保护工作中的新种群奠基者选择、野化放归个体选择以及人工配对等工作提供重要参考。
本发明公开了一种扬子鳄抗菌肽Alligatorin6及其氨基酸序列和在抗菌方面的应用。本发明的抗菌肽Alligatorin6是通过检索扬子鳄基因数据库，筛选分析获得抗菌肽成熟肽序列，其氨基酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示。通过分析对比，该扬子鳄抗菌肽Alligatorin6与目前已知所有抗菌肽的氨基酸序列存在明显差异，属于一种新型抗菌肽。通过抗菌实验表明，本发明的扬子鳄抗菌肽Alligatorin6对革兰氏阳性细菌和革兰氏阴性细菌具有极强的抗菌活性，抗菌作用广谱高效，此外具有溶血活性低、盐耐受性、热耐受性和热稳定性好的特点，可应用于医药
本发明的抗菌肽Alligatorin5来源于扬子鳄，通过检索扬子鳄基因数据库，筛选分析获得抗菌肽成熟肽序列，抗菌肽Alligatorin5氨基酸序列如序列表中SEQ ID NO.1所示。通过抗菌实验表明，本发明的扬子鳄抗菌肽Alligatorin5对革兰氏阳性细菌、革兰氏阴性细菌和真菌具有极强的抗菌活性，抗菌作用广谱高效，此外具有溶血活性低、盐耐受性、热耐受性和热稳定性好的等特点，可应用于医药
