本发明涉及玉米IPE1突变体及其检测方法与应用,本发明提供的玉米IPE1突变体的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明提供的玉米IPE1突变体能够导致玉米雄性的完全不育,而且仅影响玉米的雄性育性性状,对雌性育性性状以及各种农艺性状均没有影响;同时,IPE1突变体为基因内部点突变,不会影响IPE1基因两侧相邻基因的功能因此,玉米IPE1突变体能够直接用于杂交玉米选育、不育系改良等玉米的遗传育种和种质改良,具有极大的推广应用潜力和经济价值。本发明还提供了的IPE1突变体的检测方法,能够实现快速准确的IPE1突变体和玉米雄性育性性状的检测。