本发明公开了一种表达黑芥子酶TGG4的重组解脂耶氏酵母菌,其基因组中包含有编码黑芥子酶TGG4的基因。编码黑芥子酶TGG4的基因如SEQ ID NO.1所示;黑芥子酶TGG4如SEQID NO.2所示。该重组解脂耶氏酵母菌在制备黑芥子酶TGG4中的应用,在制备莱菔素中的应用,在降解莱菔苷中的应用。本发明还公开了一种酶制剂,通过培养该重组解脂耶氏酵母菌并收集菌体制得。本发明的食品级解脂耶氏酵母菌,能够高效表达黑芥子酶TGG4,可以在体外催化萝卜种子中的莱菔苷水解产生莱菔素。黑芥子酶TGG4是附着或镶嵌在细胞表面的,可以通过回收细胞实现黑芥子酶的重复利用,进行高效率、多批次的重复制备。