本发明属于生物基因工程的技术领域,具体涉及一种与荔枝果肉糖积累类型相关的基因及其分子标记、引物对和应用。所述基因为荔枝7号染色体上一个可将蔗糖水解为还原糖的基因LITCHI009111,其核酸序列SEQ ID NO.1所示;其分子标记Chr7:22496380G:A位于荔枝7号染色体上一个可将蔗糖水解为还原糖的基因LITCHI009111的第2内含子上;所述分子标记的引物对的核酸序列分别如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示,可快速筛查候选荔枝品种,预测荔枝果肉的糖积累类型,用于判断或辅助判断可食用部位的糖积累类型,筛选含有目标性状品种,缩短育种周期,提高优质品种的育种效率。