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[发明专利]一种微卫星不稳定分析方法及装置-CN202010632301.1有效
发明人：周衍庆;陈实富;汪周阳 -专利权人：深圳市海普洛斯生物科技有限公司
申请日： 2020-07-02 - 公布日： 2021-02-02 - 主分类号： G16B20/30 文献下载
摘要：本发明提供一种微卫星不稳定分析方法及装置，该方法包括；数据获取步骤，微卫星位点初次筛选步骤，样本训练步骤，微卫星位点再次筛选步骤，微卫星位点三次筛选步骤，微卫星稳定判断步骤。本发明能够基于现有的NGS检测数据分析结果挑选微卫星位点，直接分析样本的MSI状态，使用多个微卫星位点来分析MSI的状态，克服了PCR方法检测连续性差、容易误判的缺陷。
一种卫星不稳定分析方法装置

[发明专利]用于雄性罗氏沼虾遗传多样性分析的微卫星标记组合及引物-CN201810471020.5在审
发明人：马华威;黄光华;吕敏;杨慧赞;王瑞;杨琼;卢小花;曾兰;甘晖;阮志德;黄立斌 -专利权人：广西壮族自治区水产科学研究院
申请日： 2018-05-17 - 公布日： 2018-07-31 - 主分类号： C12Q1/6888 文献下载
摘要：本发明公开了用于雄性罗氏沼虾遗传多样性分析的微卫星标记组合及引物。用于雄性罗氏沼虾遗传多样性分析的微卫星标记组合，包括以下微卫星标记或其核苷酸序列的互补序列：微卫星标记1、微卫星标记2、微卫星标记3、微卫星标记4、微卫星标记5、微卫星标记6、微卫星标记7；其核苷酸序列分别如本发明提供了一种用于提供雄性罗氏沼虾遗传多样性分析的微卫星位点，结果显示，所有微卫星位点均显示高度差异性，该微卫星标记组合易识别、高度多态，非常适于研究不同的近亲雄虾组遗传结构，为罗氏沼虾优质父本选育提供基础性遗传信息
微卫星标记罗氏沼虾遗传多样性分析核苷酸序列微卫星位点引物高度差异性父本选育互补序列遗传结构遗传信息易识别多态雄虾遗传发育调控研究

[发明专利]筛选微卫星位点的方法及其应用-CN202110042650.2有效
发明人：肖姗姗;王涛;常壹昭 -专利权人：杭州瑞普基因科技有限公司
申请日： 2021-01-13 - 公布日： 2022-06-10 - 主分类号： C12Q1/6809 文献下载
摘要：本发明提出一种筛选微卫星位点的方法，该方法包括：(1)对已知微卫星稳定性状态的样本进行测序，以便获得包含待分析微卫星位点的测序读段；(2)基于所获得的测序读段，采用下列两种方式至少之一进行微卫星位点的筛选：(a)将所述测序读段与参考序列进行比对，获得包含所述待分析微卫星位点的测序读段的读段数目及读段长度，获得目标微卫星位点；和(b)基于包含待分析微卫星位点的测序读段在所述已知微卫星稳定性状态的样本中的step‑wisedifference值，获得目标微卫星位点。利用本发明的方法可以准确判断备选微卫星位点是否适合作为判定待检测样本微卫星稳定性的位点，使得所选择的微卫星位点可以准确判断待检测样本的微卫星稳定性的属性。
筛选卫星方法及其应用

[发明专利]哲罗鲑微卫星序列与多态性微卫星标记的获取方法和哲罗鲑多态性微卫星标记-CN200910073115.2无效
发明人：匡友谊;佟广香;尹家胜;孙效文 -专利权人：中国水产科学研究院黑龙江水产研究所
申请日： 2009-10-29 - 公布日： 2010-06-16 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：哲罗鲑微卫星序列与多态性微卫星标记的获取方法和哲罗鲑多态性微卫星标记，它涉及一种微卫星序列与多态性微卫星标记的获取方法和多态性微卫星标记。微卫星序列：一、提取哲罗鲑基因组DNA；二、哲罗鲑基因组DNA的酶切和微卫星富集文库的构建；三、菌落PCR扩增并进行阳性克隆检测和测序。哲罗鲑多态性微卫星标记：步骤一至三与上述方法相同；四、对哲罗鲑微卫星序列进行分析和引物设计；五、微卫星序列引物多态性鉴定。本发明哲罗鲑多态性微卫星标记共7对。本发明方法所获的生物材料可用于哲罗鲑的保护遗传学、亲缘关系分析、连锁图谱构建及养殖群体的遗传管理。
哲罗鲑微卫星序列多态性标记获取方法哲罗鲑

[发明专利]华贵栉孔扇贝微卫星标记的构建方法-CN200710027649.2有效
发明人：王艳红;喻子牛 -专利权人：中国科学院南海海洋研究所
申请日： 2007-04-23 - 公布日： 2007-09-26 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：提供一种华贵栉孔扇贝微卫星标记的构建方法，包括DNA的提取；酶切连接接头以及杂交前预扩增；用生物素标记的微卫星探针和SAV磁珠杂交富集微卫星序列，得到富含微卫星序列的DNA片断，然后对片段进行扩增；构建富含微卫星片段的富集文库，并利用PCR进行微卫星序列筛选；对阳性克隆进行测序，得到DNA序列结果；对含有微卫星序列的片段进行质量分析比较，对优质微卫星序列片段设计引物；利用PAGE检测筛选微卫星的扩增性、多态性、稳定性，统计相应群体遗传学参数；它操作简单，安全，结果真实可靠，效率高，阳性率高；用于遗传变异分析、种质保护与管理、连锁图谱构建及优良亲本群体的筛选和遗传选育。
华贵扇贝卫星标记构建方法

[发明专利]拟穴青蟹微卫星DNA标记及其筛选方法-CN201110068886.X无效
发明人：王桂忠;许晓军;叶海辉;李少菁;王克坚 -专利权人：厦门大学
申请日： 2011-03-21 - 公布日： 2011-09-14 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：拟穴青蟹微卫星DNA标记及其筛选方法。涉及DNA分子标记技术，提供拟穴青蟹微卫星DNA标记及其筛选方法。所述拟穴青蟹微卫星DNA标记可编号为A508，筛选方法为：构建拟穴青蟹微卫星富集文库，挑选单克隆并进行测序；使用微卫星DNA位点查找软件获得含有拟穴青蟹微卫星序列的阳性克隆，确定拟穴青蟹微卫星DNA标记A508微卫星标记可用于拟穴青蟹遗传结构分析、种质资源保护及分子标记辅助选育，其重复性良好，是一种可靠有效的分子标记。获得的拟穴青蟹微卫星DNA标记为拟穴青蟹的遗传结构分析、种质资源保护及分子标记辅助选育等奠定基础。
拟穴青蟹微卫星 dna 标记及其筛选方法

[发明专利]一种用于日本沼虾生长性状分析的微卫星标记及其应用-CN201611053261.5有效
发明人：康现江;管越强;武小斌;穆淑梅;段保华 -专利权人：河北大学
申请日： 2016-11-25 - 公布日： 2019-10-18 - 主分类号： C12Q1/6888 文献下载
摘要：本发明公开了一种用于日本沼虾生长性状分析的微卫星标记，包括微卫星标记GL01和微卫星标记GL02；所述微卫星标记GL01与额剑长性状相关联，微卫星标记GL02与尾扇长、第二步足长、第二步足长指节长性状相关联；所述微卫星标记GL01上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示、下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示；微卫星标记GL02上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示、下游引物核苷酸序列如同时本发明还公开了所述微卫星标记在日本沼虾的生长性状分析中的应用。本发明提供的微卫星标记的引物具有PCR扩增结果稳定的特点，其微卫星标记可以用于日本沼虾生长性状分析，可以辅助日本沼虾分子标记育种。
一种用于日本生长性状分析卫星标记及其应用

[发明专利]一种批量分析微卫星数据的生物信息学方法-CN201811649699.9有效
发明人：范李强;商海红;袁有禄;张志斌;范森淼;邹先炎;张震;刘爱英;葛群;李俊文;龚举武;巩万奎;石玉真 -专利权人：中国农业科学院棉花研究所
申请日： 2018-12-30 - 公布日： 2022-11-18 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明公开了一种批量分析微卫星数据的生物信息学方法。本发明所提供的批量分析微卫星数据的生物信息学方法综合运用了检测微卫星无效等位位点的Cervus、MICRO‑CHECKER软件，计算群体遗传结构的STRUCTURE分析和PCoA分析，以及结合Perl脚本语言编程等方法实验证明，本发明所提供的批量分析微卫星数据的生物信息学方法全面而系统，去除无效等位位点的微卫星数据更加准确，整个批量处理过程只需要在Windows系统中即可完成，操作简单可行，效率高，准确性好。
一种批量分析卫星数据生物信息学方法

[发明专利]一种与三疣梭子蟹生长性状相关的微卫星标记、其引物及应用-CN201910704471.3有效
发明人：康现江;段保华;管越强;穆淑梅;姬新东;李泽健;李书琴;李彦芹 -专利权人：河北大学
申请日： 2019-07-31 - 公布日： 2022-11-18 - 主分类号： C12Q1/6888 文献下载
摘要：本发明提供了一种与三疣梭子蟹生长性状相关的微卫星标记、其引物及应用，微卫星标记包括微卫星标记ZL03、ZL05、ZL06、ZL08和NC07；本发明还提供了上述的微卫星标记或其引物在三疣梭子蟹生长性状分析以及三疣梭子蟹分子育种中的应用本发明提供的微卫星标记的引物具有PCR扩增结果稳定的特点，其微卫星标记可以用于三疣梭子蟹生长性状分析，可以辅助三疣梭子蟹分子标记育种。
一种梭子蟹生长性状相关卫星标记引物应用

[发明专利]拟尖头鮊微卫星标记及其在亲缘关系鉴定中的应用-CN202310324245.9在审
发明人：王俊 -专利权人：西安理工大学
申请日： 2023-03-29 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： C12Q1/6888 文献下载
摘要：本发明公开了拟尖头鮊微卫星标记及其在亲缘关系鉴定中的应用，拟尖头鮊微卫星标记包括10对微卫星引物，10对微卫星引物组成5组双重PCR，微卫星引物的序列如序列表1所示。取拟尖头鮊鳍条样品，在拟尖头鮊鳍条样品中提取拟尖头鮊样品DNA；利用上述微卫星引物对拟尖头鮊样品进行PCR扩增；把PCR扩增产物在10％的聚丙烯酰胺胶上进行电泳分离，根据分离结果统计PCR扩增产物的基因型；用遗传分析软件MEGA绘制聚类分析图，根据聚类分析结果鉴定拟尖头鮊的亲缘关系。
尖头卫星标记及其亲缘关系鉴定中的应用

[发明专利]红麻表达序列标签微卫星DNA标记-CN201410641385.X有效
发明人：张立武;祁建民;万雪贝 -专利权人：福建农林大学
申请日： 2014-11-14 - 公布日： 2015-02-04 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及一种分子标记技术，具体涉及一种红麻表达序列标签微卫星DNA分子标记。其步骤包括，基于红麻转录组测序序列开发新的微卫星位点，扩增微卫星位点的引物序列以及微卫星位点多态性分析。本发明的特征是，基于红麻转录组测序的转录因子表达序列标签，分离鉴定了24个微卫星标记的DNA序列和扩增该24个微卫星位点的引物序列。本发明的24个新的红麻微卫星DNA标记可应用于红麻品种的遗传多样性分析，遗传连锁图谱构建以及分子标记辅助育种等研究，重复性好，是一种可靠有效的分子标记。
红麻表达序列标签卫星 dna 标记

[发明专利]一种基于单肿瘤样本高通量测序微卫星不稳定性探测位点筛选方法-CN201911414501.3有效
发明人：孙大伟;柳毅;段小红;承康平;周启明 -专利权人：求臻医学科技（浙江）有限公司
申请日： 2019-12-31 - 公布日： 2023-06-27 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于单肿瘤样本高通量测序微卫星不稳定性探测位点筛选方法，该方法基于优化后的微卫星位点状态标志，采用机器学习技术，通过对每个微卫星位点进行建模分析，利用有效位点被判别为微卫星不稳定位点的百分比来探测每个样本是否为微卫星不稳定状态，实现只利用肿瘤样本测序数据来探测微卫星不稳定状态，能够高精度判断多个微卫星位点的稳定性，实现准确稳定的微卫星不稳定状态基因检测。
一种基于肿瘤样本通量测序微卫星不稳定性探测筛选方法

[发明专利]黄麻表达序列标签微卫星DNA标记-CN201410088219.1有效
发明人：张立武;祁建民;徐建堂;陶爱芬;林荔辉;方平平;林培清;吴建梅 -专利权人：福建农林大学
申请日： 2014-03-12 - 公布日： 2014-07-23 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本发明涉及一种分子标记技术，具体涉及一种黄麻表达序列标签微卫星DNA分子标记。其步骤包括，开发新的微卫星位点，扩增微卫星位点的引物序列以及微卫星位点多态性分析。本发明的特征是，从GenBank公共数据库中下载黄麻表达序列标签，分离鉴定黄麻66个新的微卫星标记，筛选其中多态性丰富的10个微卫星标记CcSSR008、CcSSR013、CcSSR016、CcSSR024本发明提供了66个黄麻的新的微卫星位点及扩增这66个微卫星位点的引物序列和扩增方法，可应用于黄麻属不同种间的遗传多样性分析，遗传连锁图谱构建以及分子标记辅助育种等研究。
黄麻表达序列标签卫星 dna 标记

[发明专利]一种快速开发缢蛏微卫星分子标记的方法-CN201310503959.2无效
发明人：牛东红;李家乐;谢淑媚;王劦;赵弘刚 -专利权人：上海海洋大学
申请日： 2013-10-23 - 公布日： 2014-01-15 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本发明是一种快速开发缢蛏微卫星分子标记的方法，包括缢蛏微卫星序列的查找，基因组DNA的快速提取，微卫星引物的适用性扩增和微卫星标记的基因型鉴定方法。首先，在缢蛏转录组数据库中，按照微卫星分类标准，快速查找微卫星序列；其次，利用简化的苯酚氯仿抽提法，快速提取DNA；然后，建立缢蛏微卫星引物适用性的PCR扩增方法；最后，采用FAM荧光标记引物和ABI3730核酸分析仪进行缢蛏微卫星标记的鉴定，建立了一种快速开发缢蛏微卫星分子标记的方法。
一种快速开发缢蛏微卫星分子标记方法

[发明专利]银缕梅微卫星标记组合及其引物和应用-CN201911051297.3有效
发明人：陈云霞;刘佳奇;南程慧;薛晓明 -专利权人：南京森林警察学院
申请日： 2019-10-31 - 公布日： 2020-08-04 - 主分类号： C12Q1/6895 文献下载
摘要：本发明公开了一种银缕梅微卫星标记组合，其包括18个银缕梅微卫星标记，同时提供了一组能够高效扩增银缕梅微卫星标记的特异性引物组及银缕梅微卫星标记检测方法，可为银缕梅种质资源的开发及保护、遗传多样性分析、遗传图谱的构建、分子标记辅助育种及遗传结构的分析奠定基础。
银缕梅微卫星标记组合及其引物应用

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