本发明公开了基于GPU的VDIF格式数据异构并行编帧方法,涉及通信技术领域。本发明充分利用图形处理单元(Graphic Process Unit,GPU)的高灵活性和高效并行数据处理能力,提出了基于GPU的符合VDIF规范的数据格式编帧方法,并分别设计了帧头计算过程、多通道单线程编帧模式和多通道多线程编帧模式即主机通过图形处理器GPU以多通道方式接收输入数据,并获取输入参数,计算帧头参数,并计算输入数据的每秒帧数和每秒数据位数,并判断输入数据每秒内帧数是否为整数、以及每秒数据位数是否为完成量化位数的整数倍;若二者均为是,则根据需求,选择单通道单线程模式或者多通道单线程模式;分别执行单通道单数据线程流程和多通道单数据线程流程。