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[发明专利]一种基于单核苷酸多态性预测开放阅读框的方法及系统-CN202210325529.5在审
发明人：宋波;姜梦云;宁卫东;程时锋 -专利权人：中国农业科学院农业基因组研究所
申请日： 2022-03-30 - 公布日： 2022-06-17 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于单核苷酸多态性预测开放阅读框的方法，以及预测开放阅读框的系统。本发明利用群体基因组变异数据中编码序列中核苷酸多态性的3碱基周期性，检验和筛选待测基因序列中的开放阅读框，并统计开放阅读框中密码子的使用频率，结合核苷酸多态性的3碱基周期性和密码子使用频率统计结果，统计分析综合评定小开放阅读框的预测概率，从而实现在基因组中对小开放阅读框的准确预测。
一种基于核苷酸多态性预测开放阅读方法系统

[发明专利]基因搜索权重调整方法、计算机存储介质及电子设备-CN202111256000.4有效
发明人：岑文杰;沈丽婷 -专利权人：云舟生物科技（广州）股份有限公司
申请日： 2021-10-27 - 公布日： 2023-04-07 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明提供了一种基于生物研究热点的基因搜索权重调整方法、计算机存储介质及电子设备，方法包括以下步骤：S1、建立文献数据库，文献数据库包含期刊出版的文献；S2、获取用户输入的开放阅读框；S3、筛选出与所述开放阅读框同名的多个物种，每个物种的基因ID不同；S4、检索每个物种的基因ID在所述文献数据库中出现的次数，得到与开放阅读框同名的多个物种的热度；S5、将与开放阅读框同名的多个物种进行热度排序。根据本发明的方法，通过筛选出与用户输入的开放阅读框同名的多个物种，并将各个物种的热度进行排序，可以帮助用户更快速的找到需求的开放阅读框，减少构建载体过程中选择开放阅读框的时间，提高用户体验。
基因搜索权重调整方法计算机存储介质电子设备

[发明专利]重组李斯特菌疫苗菌株及其制备方法-CN201580021074.6在审
发明人： A·瓦勒查;R·珀蒂 -专利权人：阿德瓦希斯公司
申请日： 2015-04-14 - 公布日： 2017-02-22 - 主分类号： C12N1/21 文献下载
摘要：在一个实施例中，本发明涉及一种重组李斯特菌菌株，所述重组李斯特菌菌株包含重组核酸，所述核酸包含第一开放阅读框，所述第一开放阅读框编码重组多肽，所述重组多肽包含融合至异源性抗原或其片段的LLO蛋白的第一N末端片段，并且其中所述重组核酸还包含第二开放阅读框，所述第二开放阅读框编码突变体PrfA蛋白。
重组李斯特疫苗菌株及其制备方法

[发明专利]基因工程化的噬菌体-CN201980100474.4在审
发明人：史蒂文·特里奥特 -专利权人：噬菌体技术公司
申请日： 2019-07-18 - 公布日： 2022-05-13 - 主分类号： C12N7/01 文献下载
摘要：一种将噬菌体工程化的方法，所述方法包括：分离噬菌体；从所述噬菌体的基因组中去除所有附着基因；插入编码一种或多种附着基因的第一独特开放阅读框，并插入编码一种或多种用于克服细菌防御的基因的第二独特开放阅读框；以及将非天然附着基因插入所述第一开放阅读框中，其中，所述非天然附着基因特异性地用于附着到选定的细菌。
基因工程噬菌体

[发明专利]一种人工改造的AKT3环状RNA及其在新冠疫苗中的应用-CN202110058895.4有效
发明人：何越峰;孙明军;毛一竹;蒋成兰;谭婧文;周倩;尹锦瑶 -专利权人：昆明医科大学
申请日： 2021-01-17 - 公布日： 2022-10-04 - 主分类号： C12N15/85 文献下载
摘要：本发明公开了一种人工改造的AKT3环状RNA及其在新冠疫苗中的应用，其特征是：经过改造AKT3环状RNA具有启动转录功能，在中间加入一段蛋白开放阅读框，使该环状RNA可稳定的表达上述白开放阅读框的蛋白，如果加入相应的免疫原蛋白开放阅读框，可以作用circRNA疫苗的载体，使免疫动物产生抗体，可用于为预防或治疗的疫苗。
一种人工改造 akt3 环状 rna 及其疫苗中的应用

[发明专利]选择高水平表达蛋白质的宿主细胞-CN200780015813.6有效
发明人： A·P·奥特;H·J·M·范布洛克兰;T·H·J·克瓦克斯;R·G·A·B·赛沃尔特 -专利权人：科罗迈吉尼科斯公司
申请日： 2007-04-24 - 公布日： 2009-05-20 - 主分类号： C12N15/67 文献下载
摘要：本发明提供了一种DNA分子，其包含编码可选择标记多肽的开放阅读框序列，其中编码链中的所述DNA分子包含具有GTG起始密码子或TTG起始密码子的可选择标记多肽的翻译起始序列，其中，与编码所述可选择标记蛋白质的原始开放阅读框序列相比，编码所述可选择标记蛋白质的开放阅读框序列被替换其至少一半的CpG二核苷酸。
选择水平表达蛋白质宿主细胞

[发明专利]增强胞内分子检测灵敏度的人工核糖核酸工具的构建方法-CN202310790665.6在审
发明人：旷怡;梁正桦;谭开鑫 -专利权人：香港科技大学深圳研究院
申请日： 2023-06-30 - 公布日： 2023-09-29 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：包括：⑴构建该人工核糖核酸工具的输出蛋白的开放阅读框序列；开放阅读框可表达融合蛋白，融合蛋白含有报告蛋白域、核糖核酸结合蛋白域和VPg蛋白域；(2)使用低表达量/弱5′端帽控制输出蛋白的基础表达量；(3)构建该人工核糖核酸工具的非翻译区序列；5′非翻译区中有适配体，与开放阅读框表达的融合蛋白中核糖核酸结合蛋白域特异性结合；其5′非翻译区或3′非翻译区中有分子感应序列，可特异性感应胞内分子，影响开放阅读框编码的输出蛋白的表达量
增强分子检测灵敏度人工核糖核酸工具构建方法

[发明专利]PCV2免疫原性组合物和产生这种组合物的方法-CN201210137320.2有效
发明人： M·艾希梅厄;G·尼策尔;M·谢弗 -专利权人：勃林格殷格翰动物保健有限公司
申请日： 2005-12-29 - 公布日： 2012-09-12 - 主分类号： C12N15/86 文献下载
摘要：本发明提供了回收2型猪圆环病毒开放阅读框2表达的蛋白质的改进方法。该方法通常包括以下步骤：将含有开放阅读框2编码序列的重组病毒转染到培养基中生长的细胞中，使该病毒表达开放阅读框2，回收上清液中表达的蛋白质。
pcv2 免疫原性组合产生这种方法

[发明专利]PCV2免疫原性组合物和产生这种组合物的方法-CN201710520864.X有效
发明人： M·艾希梅厄;G·尼策尔;M·谢弗 -专利权人：勃林格殷格翰动物保健美国有限公司
申请日： 2005-12-29 - 公布日： 2021-11-16 - 主分类号： C07K14/01 文献下载
摘要：本发明提供了回收2型猪圆环病毒开放阅读框2表达的蛋白质的改进方法。该方法通常包括以下步骤：将含有开放阅读框2编码序列的重组病毒转染到培养基中生长的细胞中，使该病毒表达开放阅读框2，回收上清液中表达的蛋白质。
pcv2 免疫原性组合产生这种方法

[发明专利]PCV2免疫原性组合物和产生这种组合物的方法-CN200580047741.4有效
发明人： M·艾希梅厄;G·尼策尔;M·谢弗 -专利权人：勃林格殷格翰动物保健有限公司
申请日： 2005-12-29 - 公布日： 2008-05-14 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供了回收2型猪圆环病毒开放阅读框2表达的蛋白质的改进方法。该方法通常包括以下步骤：将含有开放阅读框2编码序列的重组病毒转染到培养基中生长的细胞中，使该病毒表达开放阅读框2，回收上清液中表达的蛋白质。
pcv2 免疫原性组合产生这种方法

[发明专利]微藻多基因共表达载体及多基因共表达微藻-CN201510662234.7有效
发明人：范建华;李元广;闰从林;房磊;李淑兰 -专利权人：华东理工大学;嘉兴泽元生物制品有限责任公司
申请日： 2015-10-14 - 公布日： 2019-05-28 - 主分类号： C12N15/79 文献下载
摘要：本发明公开了一种微藻多基因共表达载体，所述表达载体的开放阅读框，采用Ubi启动子、Nos启动子或Hsp70A启动子；目的基因之间以2A肽序列连接并构建在所述表达载体的一个开放阅读框中。
多基因表达载体

[发明专利]基于图神经网络的抗菌性乳酸菌株筛选方法-CN202211558598.7在审
发明人：董改芳;孙志宏;翟冰 -专利权人：内蒙古农业大学
申请日： 2022-12-06 - 公布日： 2023-04-07 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明公开了基于图神经网络的抗菌性乳酸菌株筛选方法，包括：S1、通过蛋白质预测方法得到已测序乳酸菌的多个开放阅读框；S2、利用乳酸菌抗菌肽图神经网络模型对开放阅读框进行预测，得到多个可能的乳酸菌抗菌肽片段集合A1；利用乳酸菌抗菌肽数据库对开放阅读框进行多序列比对，得到乳酸菌抗菌肽片段集合A2；利用生物信息软件工具Hmmer对开放阅读框进行结构域预测，得到结构域片段集合A3；S3、若片段集合A1、A2、A3交集不为空
基于神经网络抗菌乳酸菌株筛选方法

[发明专利]用于治疗婴儿贝敦氏病的鞘内和静脉内组合基因疗法-CN202080047719.4在审
发明人：蒂莫西·J·米勒;S·J·格雷 -专利权人：北卡罗来纳－查佩尔山大学;阿贝奥纳治疗有限公司
申请日： 2020-04-29 - 公布日： 2022-04-01 - 主分类号： C12N15/86 文献下载
摘要：提供在需要其的受试者中用于治疗IBD或IBD相关障碍的方法，其包含联合的包含CLN1开放阅读框的多核苷酸的鞘内施用以及该多核苷酸的静脉内施用。包含CLN1开放阅读框的多核苷酸为野生型CLN1多核苷酸。在另一个方面，包含CLN1开放阅读框的多核苷酸包含密码子优化的该多核苷酸或其互补物的多核苷酸序列，且密码子被优化用于在人类细胞中表达。
用于治疗婴儿贝敦氏病静脉组合基因疗法

[发明专利]良好表达的合成基因的选择-CN200780047597.3有效
发明人：斯蒂恩·T·乔根森 -专利权人：诺维信公司
申请日： 2007-12-20 - 公布日： 2009-11-11 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本发明涉及在宿主细胞表达文库中，从编码相同感兴趣多肽、或其变体或同源物的多核苷酸文库间接鉴定包含表达水平改进的开放阅读框的多核苷酸的方法，所述方法包括步骤：a)提供宿主细胞中的表达文库，所述文库包含编码相同的感兴趣多肽、或其变体或同源物的至少两个不同的开放阅读框，每个开放阅读框与编码可筛选或可选择报道分子的下游基因在翻译上偶联；b)在有益于所述感兴趣多肽、或其变体或同源物表达的条件下培养宿主细胞；和c)筛选和/或选择当与所述文库中一个或多个其它宿主细胞相比时，所述翻译上偶联的报道分子的表达水平改进的宿主细胞，由此间接鉴定包含在该宿主细胞中表达水平改进的开放阅读框的多核苷酸；本发明还涉及表达文库和包含所述文库的宿主细胞。
良好表达合成基因选择

[发明专利]优化的CLN1基因和表达盒以及它们的应用-CN201780036781.1在审
发明人： S·格雷 -专利权人：北卡罗来纳大学教堂山分校
申请日： 2017-06-13 - 公布日： 2019-03-01 - 主分类号： C12N15/11 文献下载
摘要：本发明涉及包含编码PPT1多肽或其片段的核苷酸序列的多核苷酸、包含前述相同物质的载体(病毒或非病毒载体)以及使用该载体将开放阅读框递送至细胞或受试者以治疗婴儿神经元脂褐质沉积症(婴儿巴登氏病)的方法。该多核苷酸包含人CLN1开放阅读框。
开放阅读框多核苷酸神经元婴儿非病毒载体核苷酸序列表达盒沉积症脂褐质递送多肽病毒细胞基因治疗优化应用

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