[发明专利]一种西瓜全基因组SNP-Panel的开发、检测方法及育种应用在审
申请号: | 202210492072.7 | 申请日: | 2022-05-07 |
公开(公告)号: | CN115011717A | 公开(公告)日: | 2022-09-06 |
发明(设计)人: | 张毅;张倩;张娟 | 申请(专利权)人: | 分子标记(武汉)生物育种有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11;C12Q1/6869;C12Q1/6851 |
代理公司: | 武汉仁合利泰专利代理事务所(特殊普通合伙) 42275 | 代理人: | 黄昀 |
地址: | 430000 湖北省武汉市东湖新技术开发区光*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | 本发明涉及一种西瓜全基因组SNP‑Panel的开发、检测方法及育种应用,包获取需检测的西瓜DNA样品,基于西瓜基因组重测序信息开发覆盖西瓜整个基因组的SNP标记56245个SNP;优化精选722个SNP;每个SNP位点包含两个不同碱基变异位点;针对每一个SNP标记设计一对相对应的特异扩增引物;将722个SNP标记进行组合,构成一个基因Panel;使用特异引物扩增目标SNP标记位点,然后添加测序接头,完成二代测序文库的构建;质控与定量;在illumina测序仪上完成PE150测序获得序列数据;获取所标记的各位点的基因型。利用该技术可实现分子育种领域的基因检测及分析需求,检测覆盖度广,分析速度快,检测成本低,大幅度提高我国西瓜育种效率,缩短育种周期,促进农业发展。 | ||
搜索关键词: | 一种 西瓜 基因组 snp panel 开发 检测 方法 育种 应用 | ||
【主权项】:
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