[发明专利]一种血浆cfDNA全局性甲基化检测方法及应用在审

专利信息
申请号: 201910180935.5 申请日: 2019-03-11
公开(公告)号: CN109825559A 公开(公告)日: 2019-05-31
发明(设计)人: 康亚妮;赵小东;徐伟;毛湛睿;秦玉兰 申请(专利权)人: 上海交通大学
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858
代理公司: 上海旭诚知识产权代理有限公司 31220 代理人: 郑立
地址: 200240 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明公开了一种血浆cfDNA全局性甲基化检测方法及应用,涉及生物检测技术领域,其中,所述血浆cfDNA全局性甲基化检测方法为在从血浆中提取出的少量cfDNA中补加甲基化且含有生物素标记的外源DNA(λDNA),然后进行富集甲基化实验,将收集的产物通过PCR扩增后,再基于生物素‑链霉亲和素反应、采用链霉亲和素磁珠去除带有生物素标记的λDNA,得到cfDNA扩增文库,并进行高通量测序。本发明适用于少量的血浆cfDNA甲基化分析,无需特定地商品化试剂盒,操作简便高效,减少了样品的损失、提高了建库效率、且极大地提高了MeDIP等富集甲基化实验方法地检测灵敏性,具有较广泛的适用性。
搜索关键词: 血浆 甲基化检测 甲基化 生物素标记 富集 链霉亲和素磁珠 商品化试剂盒 生物检测技术 高通量测序 甲基化分析 链霉亲和素 检测灵敏 外源DNA 生物素 补加 建库 扩增 去除 文库 应用
【主权项】:
1.一种血浆cfDNA全局性甲基化检测方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:步骤1、从血浆中提取出cfDNA;步骤2、在所述步骤1中得到的所述cfDNA中补加甲基化且含有生物素标记的λDNA;步骤3、进行富集甲基化实验,并将收集的产物通过PCR扩增后,基于生物素‑链霉亲和素反应、采用链霉亲和素磁珠去除所述产物中带有生物素标记的λDNA,得到cfDNA扩增文库;步骤4、将所述步骤3得到的所述cfDNA扩增文库进行高通量测序。
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