[发明专利]一种测序数据高效处理方法在审
| 申请号： | 201810378325.1 | 申请日： | 2018-04-25 |
| 公开（公告）号： | CN108763869A | 公开（公告）日： | 2018-11-06 |
| 发明（设计）人： | 常珊;陆旭峰;许磊;张大为 | 申请（专利权）人： | 江苏理工学院 |
| 主分类号： | G06F19/22 | 分类号： | G06F19/22 |
| 代理公司： | 常州佰业腾飞专利代理事务所(普通合伙) 32231 | 代理人： | 高姗 |
| 地址： | 213001 江*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种测序数据高效处理方法，属于生物医药技术领域，包括如下步骤：根据高通量测序数据为并行计算做准备；根据高通量测序数据为测序数据准备参考序列；通过并行计算过滤掉数据中质量不合格的数据；通过并行计算完成测序数据与参考序列的比对；通过并行计算提取比对数据中的SNP突变位点信息。本发明对测序数据进行质检，对质检后的数据与参考序列进行比对，根据比对结果提取SNP的突变信息，整套数据处理流程采用了Hadoop架构，使用Hadoop并行运算框架进行高通量测序数据云计算分析系统开发，为医学研究提供了快速、低廉、方便使用的高通量测序数据分析工具，大大的提高了数据处理速度。 | ||
| 搜索关键词： | 测序数据 高通量测序 并行计算 参考序列 高效处理 比对 质检 生物医药技术 数据处理流程 数据分析工具 比对结果 比对数据 并行运算 分析系统 数据处理 突变位点 突变信息 医学研究 云计算 过滤 架构 开发 | ||
【主权项】：
1.一种测序数据高效处理方法，其特征在于，包括如下步骤：根据高通量测序数据为并行计算做准备；根据高通量测序数据为测序数据准备参考序列；通过并行计算过滤掉数据中质量不合格的数据；通过并行计算完成测序数据与参考序列的比对；通过并行计算提取比对数据中的SNP突变位点信息。
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G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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