[发明专利]一种高通量简化基因组测序文库的构建方法在审

专利信息
申请号: 201810035935.1 申请日: 2018-01-15
公开(公告)号: CN108179174A 公开(公告)日: 2018-06-19
发明(设计)人: 李泽卿 申请(专利权)人: 武汉爱基百客生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12Q1/6869;C40B50/06
代理公司: 上海精晟知识产权代理有限公司 31253 代理人: 冯子玲
地址: 430000 湖北省武汉市东湖*** 国省代码: 湖北;42
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摘要: 发明公开了一种高通量简化基因组测序文库的构建方法,包括如下步骤:将基因组DNA样本用限制性内切酶分别对不同的基因组DNA样本进行酶切,能够获得多组不同类型基因组DNA样本的DNA片段,并将不同的DNA片段分别与含有不同条形码序列的甲基化接头相连接,从而获取不同类型的连接产物,将连接产物添加扩增引物,进行PCR扩增,获得含有不同条形码序列的扩增产物,将扩增片段再次置于琼脂糖凝胶中,然后经琼脂糖凝胶电泳后回收DNA片段作为测序文库,采用芯片分析系统进行最终的质量检测和测序。该方法有效解决了远交群体物种高通量基因分型个体间片段变异大、测序深度低以及基因分型准确性低的问题。
搜索关键词: 基因组DNA 测序文库 高通量 样本 条形码序列 基因分型 连接产物 基因组 测序 构建 琼脂糖凝胶电泳 限制性内切酶 芯片分析系统 琼脂糖凝胶 扩增产物 扩增片段 扩增引物 有效解决 质量检测 甲基化 酶切 物种 回收 群体
【主权项】:
1.一种高通量简化基因组测序文库的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:S1:选择不同类型的基因组DNA样本,并将基因组DNA样本在10‑20摄氏度的无菌环境中进行保存,并用限制性内切酶分别对不同的基因组DNA样本进行酶切,且在酶切时,需将不同样本分时段进行酶切,从而能避免不同样本发生接触,影响基因组DNA样本的原始形态;S2:完成酶切后,能够获得多组不同类型基因组DNA样本的DNA片段,并将不同的DNA片段分别进行储存,且储存环境为2‑8摄氏度,并向DNA片段内添加lamda噬菌体基因组DNA,能够将DNA片段末端进行修复,然后再次向其中添加碱基,并将其储存12‑24h,然后备用;S3:将S2中储存后的不同类型的DNA片段取出,并在放置在15‑25摄氏度的反应器皿内,并将不同的DNA片段分别与含有不同条形码序列的甲基化接头相连接,从而获取不同类型的连接产物,然后将连接产物置于纯化仪器内,并在5‑15摄氏度的条件下利用水解酶对连接产物进行纯化20‑40min;S4:将S3中纯化后的连接产物添加扩增引物,进行PCR扩增,获得含有不同条形码序列的扩增产物,然后确定每组扩增产物的量,进行琼脂糖凝胶分离后,再次进行纯化,获得特定长度的扩增片段;S5:将S4中扩增后的扩增片段再次置于琼脂糖凝胶中,然后经琼脂糖凝胶电泳后回收DNA片段作为测序文库,采用芯片分析系统进行最终的质量检测和测序。
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