[发明专利]一种基因组简化与二代测序SNP复合检测体系和检测方法在审

专利信息
申请号: 201810035165.0 申请日: 2018-01-15
公开(公告)号: CN108148899A 公开(公告)日: 2018-06-12
发明(设计)人: 李泽卿 申请(专利权)人: 武汉爱基百客生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;C12Q1/6806
代理公司: 上海精晟知识产权代理有限公司 31253 代理人: 冯子玲
地址: 430000 湖北省武汉市东湖*** 国省代码: 湖北;42
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摘要: 发明公开了一种基因组简化与二代测序SNP复合检测体系和检测方法,包括如下步骤:将形成的扩增产物内添加底物,从而能够合成第一个碱基,并清除所有游离的碱基,在测序时,选取PTP平板,且PTP平板表面含有160万个光纤孔,光纤孔内载有化学发光反应所需的各种酶以及底物,然后将碱基依照T、A、C、G的顺序依次循环进入PTP平板,假如发生碱基配对,会释放焦磷酸,焦磷酸在酶的作用下,形成氧化荧光素,同时释放光信号,实时利用高灵敏度CCD捕获,碱基和PTP平板进行配对,然后捕获到一分子的光信号,由此一一对应,能够准确、快速的确定待测模板的碱基序列。本发明能够对基因组进行准确的测序。
搜索关键词: 测序 碱基 基因组 光纤孔 焦磷酸 底物 捕获 化学发光反应 高灵敏度 碱基配对 碱基序列 扩增产物 平板表面 氧化荧光 释放 检测 配对 游离 合成
【主权项】:
一种基因组简化与二代测序SNP复合检测体系和检测方法,其特征在于,包括以下步骤:S1:选取目标DNA,并利用内切酶对目标DNA进行酶切,以便获得目标DNA片段,完成后,将其置于零下10‑零下2摄氏度的无菌储存箱内,备用;S2:再次选取DNA模板,并在DNA模板表面涂抹DNA模板制备液,且DNA模板制备液需均匀涂抹,以保证反应的准确度;S3:向S1中处理的目标DNA片段内添加DNA修复酶,并在15‑25摄氏度的环境下,能够将目标DNA片段末端进行修复,然后再次向其中添加碱基,并将其储存3‑6h,然后备用;S4:将S3中储存后的目标DNA片段取出,并在放置在15‑25摄氏度的反应器皿内,并将目标DNA片段分别与甲基化引物相连接,从而获取的连接产物;S5:将S4中产生的连接产物置于S2中的DNA模板内,并将目标DNA片段结合到扩增引物表面,然后将目标DNA片段进行扩增,从而能够形成扩增产物;S6:将形成的扩增产物内添加底物,从而能够合成第一个碱基,并清除所有游离的碱基,在测序时,选取PTP平板,且PTP平板表面含有160万个光纤孔,光纤孔内载有化学发光反应所需的各种酶以及底物,然后将碱基依照T、A、C、G的顺序依次循环进入PTP平板,假如发生碱基配对,会释放焦磷酸,焦磷酸在酶的作用下,形成氧化荧光素,同时释放光信号,以获取信号;S7:将S6中释放的光信号,实时利用高灵敏度CCD捕获,碱基和PTP平板进行配对,然后捕获到一分子的光信号,由此一一对应,能够准确、快速的确定待测模板的碱基序列。
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