[发明专利]外来体相关核酸的测序和分析在审

专利信息
申请号: 201780079166.9 申请日: 2017-10-23
公开(公告)号: CN110191962A 公开(公告)日: 2019-08-30
发明(设计)人: 约翰·斯科格;斯蒂普特·查克拉波尔蒂;陈大林;迈克尔·瓦伦蒂诺;瓦斯沙特·塔迪戈特拉;罗伯特·基钦;多米尼克·格里姆;于伟 申请(专利权)人: 外来体诊断公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;C12Q1/6806
代理公司: 中国专利代理(香港)有限公司 72001 代理人: 初明明;黄希贵
地址: 美国马*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 发明提供了一系列步骤,其制备从细胞外囊泡分离出来的核酸(RNA和/或DNA),以供测序。这使得各种各样的RNAs和/或DNAs能够被有效地检测到。然后可以使用这些来识别各种属性,例如基因表达、可变剪接以及检测体细胞突变和生殖系突变,包括单核苷酸变体(SNV)和结构变化(插入/缺失、融合、倒置)。
搜索关键词: 核酸 测序 突变 剪接 单核苷酸 基因表达 结构变化 倒置 生殖系 体细胞 外来体 有效地 可变 检测 变体 外囊 制备 细胞 融合 分析
【主权项】:
1.一种对来自生物样品的核酸进行测序的方法,其包括:(a) 提供生物样品;(b) 在足以将来自生物样品的无细胞DNA和细胞外囊泡保留在捕获表面上或在捕获表面内的条件下,使生物样品与固体捕获表面接触;(c) 当无细胞DNA和细胞外囊泡在捕获表面上或在捕获表面内时,使捕获表面与溶解试剂接触,从而从捕获表面释放DNA和RNA并产生匀浆;(d) 从匀浆中提取DNA、RNA或两者;(e) 选择性地从匀浆或从提取的DNA、提取的RNA或两者中除去核糖体DNA或RNA序列;(f) 将RNA反转录成cDNA;(g) 从提取的DNA、反转录的cDNA或提取的DNA和反转录的cDNA两者,构建双链DNA库;(h) 任选地扩增来自库的DNA、RNA或DNA和RNA两者;(i) 从cDNA或双链DNA库选择性地富集核酸序列;和(j) 对包含cDNA、双链DNA或cDNA和双链DNA两者的库进行测序。
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