[发明专利]一种估算四倍体物种基因组的二倍化程度的方法有效
| 申请号： | 201710303803.8 | 申请日： | 2017-05-03 |
| 公开（公告）号： | CN107153777B | 公开（公告）日： | 2020-01-21 |
| 发明（设计）人： | 刘琳;郭文浒;肖世俊;陈楠生 | 申请（专利权）人： | 武汉菲沙基因信息有限公司 |
| 主分类号： | G16B25/10 | 分类号： | G16B25/10;C12Q1/68 |
| 代理公司： | 11212 北京轻创知识产权代理有限公司 | 代理人： | 杨立;朱毅 |
| 地址： | 430075 湖北省武汉市*** | 国省代码： | 湖北;42 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种估算四倍体物种基因组的二倍化程度的方法，其特征在于，包括以下步骤：对所述四倍体物种的基因组进行二代测序，得到四倍体基因组测序数据；将所述四倍体基因组测序数据与二倍体基因组测序数据进行比较，估算所述四倍体物种基因组的二倍化程度，所述二倍体基因组测序数据为所述四倍体物种的近缘二倍体物种基因组的二代测序数据。本发明以分析四倍体基因组二倍化程度为目标的直接分析方法，首次提出了二倍化率的概念用于量化四倍体基因组的二倍化程度，不依赖于目标的基因组序列，具有成本低，速度快，成功率高等优势。 | ||
| 搜索关键词： | 四倍体 基因组测序 物种基因组 二倍体 基因组 估算 物种 基因组序列 测序数据 直接分析 测序 成功率 量化 分析 | ||
【主权项】：
1.一种估算四倍体物种基因组的二倍化程度的方法，其特征在于，包括以下步骤：/nS1：对所述四倍体物种的基因组进行二代测序，得到四倍体基因组测序数据；/nS2：将所述四倍体基因组测序数据与二倍体基因组测序数据进行比较，分析得到所述四倍体基因组的序列重复率和杂合度，以及所述二倍体基因组的序列重复率，计算所述四倍体物种基因组的二倍化程度，计算公式为：/n
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