[发明专利]一种丹参种质资源鉴定方法有效
申请号: | 201710107058.X | 申请日: | 2017-02-27 |
公开(公告)号: | CN107058508B | 公开(公告)日: | 2020-04-17 |
发明(设计)人: | 梁宗锁;祁哲晨;张晓丹;王瑞红;杨东风;郭万里;许玲;沈超 | 申请(专利权)人: | 浙江理工大学 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12Q1/6895;G16B40/00;C12N15/11 |
代理公司: | 北京卓岚智财知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11624 | 代理人: | 郭智 |
地址: | 310018 浙江省杭州*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明涉及一种利用基于丹参转录组序列开发SSR引物标记丹参种质资源的快速鉴定方法,主要包括以下步骤:(1)野外采集野生丹参样品,提取待测所有丹参群体基因组DNA,并检测提取质量;(2)以步骤(1)提取的DNA为模板,用基于丹参转录组序列的SSR引物组合进行PCR扩增;(3)对扩增产物进行测序分型和基因片段长度读取;(4)利用遗传学分析软件建立丹参的SSR遗传信息特征库和种质资源鉴定框架,并进行有效性验证。该方法能够对来自全国不同地区的野生丹参群体进行有效、快速的分类和鉴定,结果准确可靠,同时,该方法简便易行,且适用性高、可重复性强,可有效运用于丹参的种质资源鉴定。 | ||
搜索关键词: | 一种 丹参 种质 资源 鉴定 方法 | ||
【主权项】:
一种丹参种质资源鉴定的方法,其特征在于,包括以下步骤:提取待测丹参群体基因组DNA,并检测提取质量;以步骤1)提取的DNA为模板,用基于丹参转录组序列的SSR引物组合进行PCR扩增得到不同长度的扩增产物;对步骤2)所得不同长度的扩增产物进行测序分型和基因片段长度读取;对步骤3)所得的等位基因矩阵通过GenAlEx 6.5、CERVUS 3.0和MEGA 6等软件进行遗传学相关分析,建立丹参种质资源鉴定框架和丹参种质资源SSR遗传信息特征库;对步骤4)的丹参种质资源鉴定框架和SSR遗传信息特征库进行有效性验证。
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