[发明专利]一种丹参种质资源鉴定方法

权利要求书

1.一种丹参种质资源鉴定的方法，其特征在于，包括以下步骤：

步骤1)：提取待测丹参群体基因组DNA，并检测提取质量；

步骤2)：以步骤1)提取的DNA为模板，用基于丹参转录组序列的SSR引物组合进行PCR扩增得到不同长度的扩增产物；

步骤3)：对步骤2)所得不同长度的扩增产物进行测序分型和基因片段长度读取；

步骤4)：对步骤3)所得的等位基因矩阵通过GENEIOUS 9.0.2、GenAlEx 6.5、CERVUS3.0和MEGA 6软件进行遗传学相关分析，建立丹参种质资源鉴定框架和丹参种质资源SSR遗传信息特征库；

步骤5)：对步骤4)的丹参种质资源鉴定框架和SSR遗传信息特征库进行有效性验证；其中步骤2)所述的SSR引物由上游引物和下游引物组成，每对引物的核苷酸序列为：SEQ IDNO.1-SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3-SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5-SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7-SEQ ID NO.8、SEQ ID NO.9-SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.11-SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.13-SEQ ID NO.14、SEQ ID NO.15-SEQ ID NO.16、SEQ ID NO.17-SEQ ID NO.18、SEQ IDNO.19-SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.21-SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23-SEQ ID NO.24、SEQ IDNO.25-SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27-SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29-SEQ ID NO.30、SEQ IDNO.31-SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33-SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35-SEQ ID NO.36、SEQ IDNO.37-SEQ ID NO.38、SEQ ID NO.39-SEQ ID NO.40、SEQ ID NO.41-SEQ ID NO.42、SEQ IDNO.43-SEQ ID NO.44、SEQ ID NO.45-SEQ ID NO.46、SEQ ID NO.47-SEQ ID NO.48、SEQ IDNO.49-SEQ ID NO.50、SEQ ID NO.51-SEQ ID NO.52、SEQ ID NO.53-SEQ ID NO.54、SEQ IDNO.55-SEQ ID NO.56、SEQ ID NO.57-SEQ ID NO.58、SEQ ID NO.59-SEQ ID NO.60、SEQ IDNO.61-SEQ ID NO.62、SEQ ID NO.63-SEQ ID NO.64、SEQ ID NO.65-SEQ ID NO.66、SEQ IDNO.67-SEQ ID NO.68、SEQ ID NO.69-SEQ ID NO.70、SEQ ID NO.71-SEQ ID NO.72、SEQ IDNO.73-SEQ ID NO.74、SEQ ID NO.75-SEQ ID NO.76、SEQ ID NO.77-SEQ ID NO.78、SEQ IDNO.79-SEQ ID NO.80，其中所述引物编号为奇数的核苷酸序列为带有荧光信号标记的上游引物，引物编号为偶数的核苷酸序列为下游引物。

2.根据权利要求1所述的丹参种质资源鉴定的方法，其特征在于，步骤4)所述的丹参种质资源鉴定框架和丹参种质资源SSR遗传信息特征库分别是丹参样本基于40对SSR引物的遗传距离UPGMA聚类树和40对SSR引物基于不同种质来源的丹参群体SSR等位基因的特征长度集合。