[发明专利]一种穗菝葜的种质资源鉴定方法有效
| 申请号： | 201710106724.8 | 申请日： | 2017-02-27 |
| 公开（公告）号： | CN107151696B | 公开（公告）日： | 2020-06-05 |
| 发明（设计）人： | 祁哲晨;王瑞红;沈超;李攀;邱英雄;赵云鹏;傅承新;梁宗锁 | 申请（专利权）人： | 浙江理工大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12N15/11;G16B40/00 |
| 代理公司： | 北京卓岚智财知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11624 | 代理人： | 郭智 |
| 地址： | 310018 浙江省杭州*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种利用SSR分子标记快速鉴定穗菝葜种质资源的方法，包括以下步骤：（1）提取待测样品基因组DNA；（2）以步骤（1）提取的DNA为模板，用基于穗菝葜转录组序列的SSR引物组合进行PCR扩增；（3）对扩增产物进行测序分型和基因片段长度读取；（4）利用遗传学分析软件建立穗菝葜的SSR遗传信息特征库和种质资源鉴定框架并进行有效性验证。该方法能够对来自欧洲、非洲、亚洲的不同产地，及地区内不同自然群体来源的穗菝葜进行有效、快速的分类和鉴定，结果准确可靠，该方法简单易行，适用性高，可有效运用于穗菝葜的种质资源鉴定。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 穗菝葜 种质 资源 鉴定 方法 | ||
【主权项】：
一种利用SSR标记鉴定穗菝葜种质资源的方法，其特征在于，包括以下步骤：（1）提取待测样品的基因组DNA；（2）以步骤（1）提取的DNA为模板，用基于穗菝葜转录组序列的SSR引物组合进行PCR扩增，得到不同长度的扩增产物；（3）对步骤（2）所得不同长度的扩增产物进行测序分型和基因片段长度读取；（4）对步骤（3）所得的等位基因矩阵通过GenAlEx 6.5、CERVUS 3.0和MEGA 6等软件进行遗传学相关分析，建立穗菝葜种质资源鉴定框架和穗菝葜种质资源SSR遗传信息特征库；（5）对步骤（4）的穗菝葜种质资源鉴定框架和穗菝葜种质资源SSR遗传信息特征库进行有效性验证。
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