[发明专利]一种利用文本数据构建蛋白质相互作用网络的方法在审

专利信息
申请号: 201510086244.0 申请日: 2015-02-25
公开(公告)号: CN104657626A 公开(公告)日: 2015-05-27
发明(设计)人: 朱斐;刘全;王辉;凌兴宏;杨洋;伏玉琛 申请(专利权)人: 苏州大学
主分类号: G06F19/18 分类号: G06F19/18;G06F19/24
代理公司: 苏州市新苏专利事务所有限公司 32221 代理人: 杨晓东;朱亦倩
地址: 215000 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种利用文本数据构建蛋白质相互作用网络的方法,其特征在于,包括:⑴建立蛋白质集合;⑵记录蛋白质集合中所有蛋白质两两发生相互作用的概率值;⑶根据概率值的大小构建初始网络结构;⑹反复选择蛋白质,给定正或负作用反馈值,在初始网络结构上不断迭代,获得最终网络结构。本发明采用反复选择、相互作用的方式,以正反馈、负反馈和禁止反馈基础,通过强化学习来构建一个作用网络的概率图,与生物知识和生物数据无缝结合。
搜索关键词: 一种 利用 文本 数据 构建 蛋白质 相互作用 网络 方法
【主权项】:
一种利用文本数据构建蛋白质相互作用网络的方法,其特征在于,包括:⑴建立蛋白质集合;⑵记录蛋白质集合中所有蛋白质两两发生相互作用的概率值;⑶根据概率值的大小构建初始网络结构;⑷反复选择蛋白质,给定正作用或负作用反馈值,在初始网络结构上不断迭代,获得最终蛋白质相互作用网络的网络结构。
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