[发明专利]一种用于基因表达检测的DNA高通测序数据校正方法有效
| 申请号： | 201210104293.9 | 申请日： | 2012-04-11 |
| 公开（公告）号： | CN102622534A | 公开（公告）日： | 2012-08-01 |
| 发明（设计）人： | 冯伟兴;贺波;栾兴桃;王科俊 | 申请（专利权）人： | 哈尔滨工程大学 |
| 主分类号： | G06F19/20 | 分类号： | G06F19/20 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 150001 黑龙江省哈尔滨市南岗区*** | 国省代码： | 黑龙江;23 |
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| 摘要： | 本发明属于分子生物信息检测领域。具体是一种提高DNA高通测序获取基因表达检测数据准确性的校正方法。该发明包括下列步骤：(1)采集基因表达DNA测序检测数据，建立基因表达DNA高通测序检测数据校正模型；(2)采集基因芯片测量的基因表达值；(3)采用相关分析确定基因表达高通测序校正模型中的模型参数；(4)确定模型参数值后的基因表达DNA高通测序检测数据校正模型生成校正后的基因表达值。本发明利用校正模型对DNA测序值存在的序列比对映射误差进行估算和补偿，减小了检测误差，在充分发挥DNA高通测序检测数据高分辨率、高精度的基础上，有效提高检测的准确性。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 用于 基因 表达 检测 dna 高通测 序数 校正 方法 | ||
【主权项】：
一种用于基因表达检测的DNA高通测序数据校正方法，其特征是，包括下列步骤：(1)采集基因表达DNA测序检测数据，建立基因表达DNA高通测序检测数据校正模型：Zi＝(1+β×1/Ci)×Yi其中，Yi为实测的第i个基因表达高通测序值，Zi为校正后的第i个基因表达值，Ci为该基因所在DNA区域的保守值，β为模型参数；(2)采集基因芯片测量的基因表达值；(3)采用相关分析确定基因表达高通测序校正模型中的模型参数：将基因表达DNA高通测序检测数据校正模型得到的基因表达值与基因芯片测得的基因表达值进行相关程度计算，确定相关值最大时的模型参数β值；(4)确定模型参数值后的基因表达DNA高通测序检测数据校正模型生成校正后的基因表达值。
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