本发明涉及基因工程领域，具体涉及水稻MIS2基因及其编码蛋白与应用，所述水稻MIS2基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，所述水稻MIS2蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。该基因的突变导致水稻株高降低，籽粒畸形、变小，同时颖壳不能咬合，而MIS2基因回补则可以使籽粒恢复正常表型。本发明发现了具有调控水稻株高和籽粒大小功能的MIS2基因及其编码蛋白，而水稻株型和籽粒性状是影响水稻产量和品质的重要性状，因此有望利用MIS2基因对水稻籽粒性状进行调控，对株型进行定向设计，以提高水稻产量。
本发明涉及基因工程领域，具体涉及水稻PAL1基因及其编码蛋白与应用，所述水稻PAL1基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述水稻PAL1蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示。该基因的突变导致水稻株高降低，穗长降低，同时一级枝梗数、二级枝梗数和穗粒数减少。通过转基因技术发现，PAL1基因可以使突变体穗型恢复至正常表型。本发明发现了具有调控水稻穗长功能的PAL1基因及其编码蛋白，而水稻穗型是影响水稻产量的重要性状，因此利用PAL1基因对水稻穗部性状进行调控，有望对株型进行定向设计，以提高水稻产量。
本发明提供了水稻DPS1基因及其编码蛋白与应用。水稻DPS1基因序列如SEQ ID No.2所示，其编码蛋白序列如SEQ ID No.1所示。本发明发现水稻DPS1基因的突变体开花前顶端小穗干瘪坏死，紧临顶部退化小穗的中间小穗不育，导致结实率和穗粒数均极显著降低。本发明将野生型DPS1基因转化水稻dps1突变体，可以恢复突变体穗顶部退化的表型，说明DPS1基因通过调控细胞程序性死亡而直接控制水稻穗顶部退化，可应用于水稻穗型的定向设计，并可作为重要的基因资源，有助于在分子育种实践中开发分子标记对穗顶部退化进行早期识别和淘汰，对水稻产量的提高具有重要的指导意义。
