本发明公开了一种基于FPGA+GPU异构计算平台的波前处理控制方法,其处理过程为camera link full高速相机通过开窗口达到上千帧的采集速度,图像送入FPGA进行采集和斜率计算两个部分,再将数据通过PCIE协议送入GPU上进行波前复原运算,然后将数据送回到FPGA的控制运算单元得到控制信号,最后通过D/A通信卡,得到驱动信号送入到高压放大器中,完成波前处理控制;本发明在于挖掘GPU、FPGA并行计算的潜力,充分利用FPGA资源配置来进行时序逻辑,采用流水线设计及子任务并行处理的方式,缩短了延迟时间,提升了系统校正能力。