本发明公开了鉴定万寿菊舌状花花瓣裂片性状的SCAR分子标记、检测引物及其应用。所述SCAR分子标记在万寿菊舌状花瓣无裂片的核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示,其在万寿菊舌状花瓣有裂片的核苷酸序列为SEQ ID NO.2所示。本发明进一步提供了鉴定万寿菊舌状花花瓣裂片性状的检测引物和检测试剂盒。采用本发明提供的SCAR分子标记能准确高效区分万寿菊的舌状花花瓣裂片有无,其在万寿菊舌状花花瓣裂片有无的F2分离群体中检测效率达96.12%,能够直接利用PCR产物快速筛选万寿菊舌状花花瓣裂片有无的性状,能够在苗期对万寿菊进行选择,显著提高育种效率并降低育种成本。