本发明公开了鉴别万寿菊单复瓣性状的共分离分子标记、检测引物及检测试剂盒和应用。所述鉴定万寿菊单复瓣性状的基因分子标记在单瓣万寿菊中的核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示，其在复瓣万寿菊中的核苷酸序列分别为SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。本发明还提供了检测所述基因分子标记的检测引物及其在万寿菊单复瓣检测中的应用。应用本发明建立的基因分子标记检测方法能直接利用PCR产物快速鉴别万寿菊的单复瓣性状，对万寿菊单复瓣进行准确区分。本发明检测方法在万寿菊单复瓣F2分离群体和24份万寿菊资源中的检测效率达100％，能够在苗期对万寿菊实生苗进行分子标记辅助育种，显著提高了育种效率。
本发明公开了鉴定万寿菊舌状花花瓣裂片性状的SCAR分子标记、检测引物及其应用。所述SCAR分子标记在万寿菊舌状花瓣无裂片的核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示，其在万寿菊舌状花瓣有裂片的核苷酸序列为SEQ ID NO.2所示。本发明进一步提供了鉴定万寿菊舌状花花瓣裂片性状的检测引物和检测试剂盒。采用本发明提供的SCAR分子标记能准确高效区分万寿菊的舌状花花瓣裂片有无，其在万寿菊舌状花花瓣裂片有无的F2分离群体中检测效率达96.12％，能够直接利用PCR产物快速筛选万寿菊舌状花花瓣裂片有无的性状，能够在苗期对万寿菊进行选择，显著提高育种效率并降低育种成本。
