[发明专利]一种拟平滑念珠菌微卫星位点及其检测方法和应用有效
申请号: | 202310759738.5 | 申请日: | 2023-06-26 |
公开(公告)号: | CN116536447B | 公开(公告)日: | 2023-09-22 |
发明(设计)人: | 张丽;徐英春;宁雅婷;肖盟;孙天舒;罗征宇;于淑颖;陆旻雅;康巍 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院北京协和医院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 北京英创嘉友知识产权代理事务所(普通合伙) 11447 | 代理人: | 杨月 |
地址: | 100730 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 平滑 念珠菌 卫星 及其 检测 方法 应用 | ||
1.一种拟平滑念珠菌微卫星位点的检测方法,其特征在于,所述检测方法包括以下步骤:
S1、提取拟平滑念珠菌的总DNA;
S2、以所述总DNA为模板,利用荧光标记的引物组在PCR反应体系中进行PCR扩增反应;
S3、对PCR扩增产物中的荧光标记DNA片段进行多态性检测;
所述拟平滑念珠菌微卫星位点为核苷酸序列如SEQ ID NO.1-4所示的拟平滑念珠菌微卫星位点的组合;
所述引物组为核苷酸序列如SEQ ID NO.5-8所示的正向引物和核苷酸序列如SEQ IDNO.9-12所示的反向引物。
2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,每20μL的PCR反应体系中含有8-12μL的DNA聚合酶、1-3μL的gDNA、0.2-0.4μL的正向引物和0.2-0.4μL的反向引物;
所述正向引物的浓度为18-22μM,所述反向引物的浓度为18-22μM;
其中,所述正向引物的5’端通过荧光染料进行FAM和/或HEX标记。
3. 根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述PCR扩增反应的反应程序包括:94℃ 5min,94℃ 30s,60℃ 40s,72℃ 50s,10个循环;94℃ 30s,53℃ 40s,72℃ 50s,27个循环;72℃ 10min;
所述多态性检测包括:利用毛细管电泳检测PCR扩增产物中的荧光标记DNA片段,通过分子量内标确定所述PCR扩增产物的等位片段的位置和相对分子量。
4.一种用于扩增拟平滑念珠菌微卫星位点的引物组,其特征在于,所述引物组为核苷酸序列如SEQ ID NO.5-8所示的正向引物和核苷酸序列如SEQ ID NO.9-12所示的反向引物;
所述拟平滑念珠菌微卫星位点为核苷酸序列如SEQ ID NO.1-4所示的拟平滑念珠菌微卫星位点的组合。
5.一种用于检测拟平滑念珠菌微卫星位点的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中包含权利要求4所述的用于扩增拟平滑念珠菌微卫星位点的引物组。
6.权利要求1-3中任一项所述的检测方法在拟平滑念珠菌的分子分型、分子溯源、院感监测、群体遗传和系统进化分析中的应用。
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